Bilgi

“Diferansiyel transkript kullanımı” (DTU) açıklaması

“Diferansiyel transkript kullanımı” (DTU) açıklaması


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Bu makale, diferansiyel transkript kullanımını şu şekilde açıklamaktadır:

Diferansiyel transkript kullanımı (DTU), bir genin nispi transkript bolluğu (RTA) profilinin, genin transkript izoformlarının her birinden kaynaklanan toplam gen seviyesi ekspresyonunun oranının, koşullar arasında farklılık gösterdiği alternatif bir eklemenin özel bir durumudur (Soneson ve ark. ., 2016). [… ] Bir DTU örneği, toplam gen ekspresyonunun A ve B koşulları arasında aynı olduğu, ancak transkript izoformu 1'in A koşulunda ağırlıklı olarak eksprese edilen transkript olduğu, transkript izoformu 2'nin ise şu durumda baskın olarak eksprese edilen transkript olduğu senaryo ile gösterilebilir. B.

Sorum şu: diferansiyel transkript kullanımı, belirli kodonların kullanım seviyeleri ile temelde aynı mı? Değilse, fark nedir? "Transkript izoformlarının" ne olduğundan emin değilim, bu yüzden burada kodonlardan mı yoksa tamamen farklı bir şeyden mi bahsettiğinden emin değilim.


Hayır, birleştirme ve alternatif birleştirme ile ilgisi olan tamamen farklı bir şey.

Splays ve alternatif splays ile ilgili ayrıntılar için sizi bazı genetik metinlere yönlendiriyorum, ancak burada bunların ne olduğu ve DTU'ya nasıl girdiği hakkında çok kısa ve eksik bir açıklama yapacağım.

Genler intronlar ve ekzonlardan oluşur. Ekzonlar, genlerin tek parçalarıdır. genellikle olgun transkripti oluşturmak (intron tutulması mümkündür, ancak bununla ilgilenmiyoruz). Ekleme, ökaryotik bir gende intronların çıkarıldığı ve olgun transkriptin yalnızca eksonlar kullanılarak birleştirildiği mekanizmadır. Ekleme sırasında, tüm ekzonlar mutlaka tutulmaz. Ekson 1, 2 ve 3'e sahip bir gen hayal edin. izoform) ekson 1, 2 ve 3'ten oluşandır. izoform 1. Ancak, adı verilen bir fenomen nedeniyle alternatif ekleme, diğer izoformlar üretilebilir, örneğin ekson 1 ve 3'ten oluşan bir izoform. izoform 2. Ortalama olarak, bolluğunu hayal edebiliriz. izoform 1 nazaran izoform 2 oldukça sabittir. Bununla birlikte, bazı tedaviler veya çevresel uyaranlardaki bazı değişiklikler, Diferansiyel Transkript Kullanımı iki izoformun nispi bolluğunun değiştiği.


Videoyu izle: Transkript (Mayıs Ayı 2022).