Bilgi

Çift sarmallı RNA Tek sarmallı DNA

Çift sarmallı RNA Tek sarmallı DNA



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ds RNA ve ssDNA'dan bahseden ders kitaplarında gördüm. Bir RNA nasıl çift iplikli olabilir ve aynı şekilde bir DNA nasıl tek iplikli olabilir ve eğer varsa neden isimler birbirinin yerine geçmiyor?


RNA (ribonükleik asit) ve DNA (deoksiribonükleik asit) arasındaki temel farklar, DNA'nın bir hidrojen atomu içermesi ve burada RNA'nın bir hidroksil (-OH) grubuna sahip olması ve RNA'nın urasilinin DNA'nın timininin yerini almasıdır. Aşağıdaki görüntü, birbirine bağlı birkaç deoksiriboz molekülünü ve yan tarafta bir riboz molekülünü göstermektedir. Deoksiribozda bir hidrojenle değiştirilen riboz molekülünün sağ alt kısmındaki OH grubudur. RNA ve DNA yapıları hemen hemen aynıdır, bu nedenle çift sarmallı RNA'ya sahip olamamanız için hiçbir neden yoktur. Benzer şekilde DNA tek sarmallı olabilir. Aslında, DNA replikasyonu ve transkripsiyonu için DNA zincirleri zorunlu ayrılın. dsRNA ve ssDNA en yaygın olarak virüslerde bulunur. Onlar hakkında daha fazla bilgi için bu ders slaytlarına göz atın: http://www.columbia.edu/itc/hs/medical/pathophys/id/2009/viruses2Color.pdf


RNA için tamamlayıcı baz eşleşmesi mümkündür

Posterin şüphesiz farkında olduğu gibi, DNA'nın çift sarmallı yapısı A-T ve G-C baz çiftleri tarafından stabilize edilir. Ayrıca DNA'nın RNA'ya transkripsiyonunda (A'nın U ile değiştirildiği) A-U baz eşleşmesinin gerçekleştiğinin farkında olacaktır. Bu nedenle, yok fiziko-kimyasal sebep dsRNA'nın neden uygun tamamlayıcı iplikler arasında oluşamadığı.

Virüsler, tek ve çift sarmallı DNA ve RNA örnekleri sağlar

Başka bir cevapta bahsedildiği gibi, bakteriyel ve ökaryotik virüslerin genomları, dsDNA, ssDNA, dsRNA ve ssRNA örnekleri sağlar.

Karıştırmak için iki tane gerekiyor

Doğada belirli bir DNA veya RNA'nın çift iplikli mi yoksa tek iplikli mi olduğu, her iki tamamlayıcı ipliğin de mevcut olup olmamasına bağlıdır. buna bağlı Biyoloji, kimya değil. Böylece, tek sarmallı bir virüs, bir sarmalın birçok kopyasının tamamlayıcı şablonun birkaç kopyasından kopyalandığı bir replikatif strateji geliştirmiştir. Çift sarmallı virüslerde (ve organizmalarda) replikasyon yöntemi, çift sarmallı bir genomla başlar ve her birinin aynı anda bir kopyasını oluşturarak eşit sayılara yol açar. (Ayrıca hemen hibritleşmelerini sağlayacak şekilde sentezlenirler.)

Doğa siyah kuğularla dolu

Karşılaşılan çoğu DNA'nın çift sarmallı ve karşılaşılan çoğu RNA'nın tek sarmallı olması gerçeği, hücresel organizmaların genomunun ve translasyon aygıtının doğasını yansıtır. Ancak transfer-RNA ve ribozomal-RNA (ve mRNA'lar) çift sarmallı sarmal kısımlara sahiptir ve sarmal oluşumunu içerebilen bireysel işlevlere sahip daha az bol çeşitli RNA türleri vardır. Ve elbette DNA/RNA hibritleri de vardır, örneğin DNA replikasyonu sırasında oluşan Okazaki fragmanları.


Üçüncü bir pedagojik yaklaşım deneyeceğim, yukarıdaki cevaplar yeterli.

Biyoloji üzerine tipik üniversite giriş seviyesi ders kitapları, DNA'nın çift sarmallı ve RNA'nın tek sarmallı olduğunu belirtir. Bu, daha sonra yanıltıcıdır, özellikle tek sarmallı DNA ve çift sarmallı RNA örneğiyle karşılaştığınızda.

Yukarıdaki posterler sorunuzu zaten iyi yanıtladı - dsRNA ve ssDNA hayat ağacının her yerinde var. Ancak, isterim vurgulamak onların da her hücrede her zaman geçici olarak var olduklarını…

3 kritik örnek:

  1. DNA replikasyonu için DNA gevşemeli ve tek iplikli hale gelmelidir.
  2. Aynı şey transkripsiyon için de geçerlidir.
  3. RNA da üçüncül bir yapıya sahiptir. Ribozimler buna güvenir. Ancak tüm hücrelerde en bol bulunan RNA türü ribozomal RNA'dır. Bu yapıları oluşturur:

Bunlar 'tek ipliklidir', ancak yerel bölgeler arasında yeterli tamamlayıcılık varsa, başka bir RNA türü ile dimerize olabilirler. Aşağıda birçok RNA saç tokası ve ilmek görüyorsunuz ve bunlar yerel olarak tek bir molekül olmasına rağmen çift sarmallıdır.

yerinde melezleştirme de biyolojide yaygın olarak kullanılan bir başka tekniktir, bahsettiğiniz "kuralın istisnaları"nın hemen hemen hepsinden yararlanır. Günümüzde, RNA giderek daha fazla araştırılmaktadır. İşte nasıl çalıştığına dair basit bir diyagram:

Varsa neden isimler değiş tokuş edilmiyor?

RNA ve DNA isimleri, kimyasal olarak farklı oldukları için birbirinin yerine kullanılmaz! Yeterince tamamlayıcılık verildiğinde, yalnızca özellikleri, özellikle de kendilerini ve diğer nükleik asitleri tamamlama ve hibritleşme yeteneklerini paylaşırlar.


HeLa hücrelerinin adenovirüs kaynaklı intranükleer bölgelerinde tek iplikli DNA, çift iplikli DNA ve RNA'nın farklı dağılımı

Adenovirüs ile enfekte olmuş HeLa hücreleri içindeki nükleik asitlerin ince uzaysal dağılımını çeşitli immunogold etiketleme prosedürleri ile çok detaylı olarak araştırdık. DNA'yı saptamak için in situ terminal deoksinükleotidil transferaz-immünogold tekniğini kullandık. Yoğunlaştırılmış konak kromatin ve viral çift ve tek iplikli DNA içeren yapılar üzerinde beklenen belirgin etikete ek olarak, etiket yuvarlak fibriller noktalar üzerinde tutarlı bir şekilde ortaya çıktı. Buna karşılık, kompakt halkalar, kristaloidler, berrak amorf inklüzyonlar ve elektron yoğun amorf inklüzyonlar gibi virüs kaynaklı diğer alt yapılar önemli bir etiket göstermedi. Viral tek sarmallı DNA birikim bölgeleri dışında, in situ nick-translation-immunogold yöntemiyle aynı etiketleme modeli elde edildi. Bölümleri ayrıca anti-RNA antikorları ile etiketledik. Etiket sadece sitoplazma ve intranükleer fibrilogranüler ağ üzerinde değil, aynı zamanda oldukça açık bir şekilde kompakt halkalar ve kromatinler arası granül kümeleri üzerinde de mevcuttu. Enfekte hücrelerin diğer nükleer yapıları üzerinde, özellikle fibriler noktalar üzerinde hiçbir şey görülmedi. Bu fibriler noktaların viral, kapsüllenmemiş, çift sarmallı DNA depolama alanının oluşumunda rol oynayabileceğini düşünüyoruz.


Çift Zincirli RNA Nedir? (Resimleri olan)

Çift sarmallı ribonükleik asit (RNA), bu genetik materyal için daha yaygın olduğu gibi, izolasyonda tek bir sarmal yerine iki tamamlayıcı sarmal ile görünen benzersiz bir RNA biçimidir. RNA, bir dizi biyolojik aktivitenin kodunu içerir ve canlı organizmalarda önemli bir rol oynar. dsRNA olarak da bilinen çift sarmallı RNA, genellikle virüslerde görülür ve biraz sıra dışıdır. Virüslerde bu benzersiz bir özelliktir ve sadece az sayıda viral aile bu özelliği sergiler.

RNA, bağlı bir iplik oluşturmak için birbirine bağlanan nükleik asit zincirlerinden oluşur. Tek sarmallı formlar, birbiri üzerine katlandıkları ve ayrıntılı üç boyutlu formlar oluşturdukları için çok karmaşık bir yapıya sahip olabilirler. Çift sarmallı RNA, genetik materyalin iki zinciri de farklı işlevleri gerçekleştirmek için katlanıp büküleceğinden daha da karmaşık hale gelebilir. Görüntüleme RNA'sı, son derece küçük boyutu nedeniyle zordur. RNA'yı laboratuvar ortamında görmek için çok hassas ve güçlü görüntüleme sistemleri gereklidir.

Çift sarmallı RNA'ya ilgi duyan araştırmacılar, bir RNA örneğine kesme enzimleri ekleyerek onu laboratuarda izole edebilirler. Enzimler, çift zincirleri geride bırakarak, onları ayırmak için herhangi bir tek RNA dizisini hedefleyecektir. Bu enzimler bilimsel tedarikçilerden temin edilebilir veya laboratuvarlar belirli araştırmalar için kendi enzimlerini üretebilir. Kirleticiler süreci kesintiye uğratabileceğinden, RNA'yı enzimlerle parçalamak için genellikle kontrollü bir ortam gereklidir.

Çift sarmallı RNA'nın bir işlevi girişim veya susturmadır. Teller, bir genin ifade şeklini değiştirebilir veya tamamen kapatabilir. dsRNA virüsleri için bu, belirgin bir avantaj sağlar. Virüs bir hücreye girebilir ve kendini korumak için genleri kapatabilir ve virüsün daha fazla kopyasını üretmek için hücreyi ele geçirebilir. Bu gruptaki virüslerin tedavisi zor olabilir, çünkü vücutta hareketli bir hedef haline gelebilirler ve bir doktorun onları tedavi etmek için reçete edebileceği ilaçlarla savaşabilirler.

Daha iyi bilinen karşılığı olan DNA gibi, RNA da her bir zincirdeki kimyasal zinciri tanımlayacak ekipmanla sıralanabilir. RNA'daki nükleik asitler tamamlayıcı çiftler oluşturacaktır ve bu, bir modelin tahmin edilmesini kolaylaştırabilir. Çift sarmallı RNA'nın genetiğini sıralamak, canlı organizmalarda nasıl çalıştığını anlamak için önemli olabilir ve bu da araştırmacıların bu benzersiz genetik yükü taşıyan virüsleri hedef alacak antiviral ilaçlar geliştirmesine olanak tanır.

Mary, birkaç yıl önce siteye katkıda bulunmaya başladığından beri, InfoBloom araştırmacısı ve yazarı olmanın heyecan verici mücadelesini benimsedi. Mary, Goddard Koleji'nden liberal sanatlar derecesine sahiptir ve boş zamanını okuyarak, yemek pişirerek ve harika açık havayı keşfederek geçirir.

Mary, birkaç yıl önce siteye katkıda bulunmaya başladığından beri, InfoBloom araştırmacısı ve yazarı olmanın heyecan verici mücadelesini benimsedi. Mary, Goddard Koleji'nden liberal sanatlar derecesine sahiptir ve boş zamanlarını okuyarak, yemek pişirerek ve harika açık havayı keşfederek geçirir.


DsRNA nedir?

dsRNA'nın kısaltması çift ​​sarmallı RNA. dsRNA'da birbirini tamamlayan iki RNA dizisi vardır. Bu iplikler, tamamlayıcı bazlar arasında bağlar oluşturarak birbirleriyle eşleştirilir. ssRNA'nın aksine, dsRNA uzun değildir – kısa bir moleküldür. dsRNA, tamamlayıcı DNA zincirleri, karşıt promotörlerden simetrik transkripsiyon yoluyla RNA'ya kopyalandığında oluşur. Ayrıca ssRNA, tamamlayıcı baz eşleşmesi yoluyla dsRNA olan sarmal içi çift sarmallar oluşturabilir. dsRNA, transpozonlardan ve tekrarlayan genlerden kaynaklanan tamamlayıcı ssRNA'ların baz eşleşmesiyle de oluşturulabilir.

Şekil 02: dsRNA Virüsü

Bazı virüslerin dsRNA genomları vardır. Bu virüslerin geniş bir konak aralığı vardır. Rotavirüsler ve pikobirnavirüsler dsRNA virüsleridir. Bu virüslerin dsRNA genomu, RNA'ya bağımlı RNA polimeraz tarafından mRNA'ya kopyalanır. Daha sonra mRNA molekülleri viral proteinlere dönüşür. Ayrıca, pozitif anlamda RNA ipliği, yeni viral partiküller için dsRNA genomları üretmek üzere tekrar kullanılabilir. Baltimore sınıflandırmasında dsRNA, Grup III'e aittir. dsRNA virüsleri, memeliler, bakteriler, bitkiler ve mantarlar dahil tüm organizmaları enfekte eder.

Küçük enterferans yapan RNA veya siRNA, ökaryotlarda RNA enterferansını ve ayrıca omurgalılarda interferon tepkisini tetikleyebilen bir dsRNA türüdür.


Virüsler

David P. Clark , Nanette J. Pazdernik , Moleküler Biyolojide (İkinci Baskı), 2013

2.3 Daha Yüksek Organizmaların DNA Virüsleri

Hayvanların DNA virüslerinin çoğu çift sarmallı DNA içerir. Örneğin, Simian virüsü 40 (SV40) DNA'sını konak kromozomuna yerleştirerek maymunlarda kansere neden olan ufacık, küresel bir virüstür. Başka bir çift sarmallı DNA virüsü, herpes virüsü, konak hücrenin nükleer membranından çalınan ekstra bir dış malzeme zarfıyla küreseldir (Şekil 21.14). Protein kabuğuna sahip iç nükleik asit, nükleokapsid olarak adlandırılır. Bu aile, uçuklara ve genital herpesin yanı sıra su çiçeği ve bulaşıcı mononükleoza neden olan virüsleri içerir. Herpes virüslerinin, hiçbir hasara neden olmadıkları, sadece konakçı hücre ile adım adım çoğaldıkları gizli bir durumda kalabildikleri için tamamen tedavi edilmesi zordur. Gizli herpes virüsleri, dairesel ekstra kromozomal plazmitler olarak çoğaldıkları çekirdekte bulunur. Aktif enfeksiyonlar, stres veya diğer faktörler nedeniyle uzun bir sessizlik döneminden sonra tekrar patlayabilir.

Şekil 21.14. Herpesvirüsler ve Poxvirüsler

Birçok hayvan virüsü, genomları için çift sarmallı DNA kullanır. Herpes virüsü, çift sarmallı DNA genomunu çevreleyen bir protein kaplamaya ve dış zarfa sahip basit bir virüstür. Poxvirus iki zarf katmanına sahiptir. Palisade olarak bilinen bir protein tabakası, çekirdek zarfın içine gömülüdür. Ek olarak, önceden hazırlanmış viral enzimler de enfeksiyondan hemen sonra replikasyona izin vermek için genomla paketlenir. Bu virüsler hayvanları enfekte eder ve her iki durumda da en dıştaki viral zar, önceki konakçı hücrenin zarından türetilir.

Herpes virüsleri uzun süre latent kalabilir.

Poksvirüsler en karmaşık hayvan virüsleridir ve o kadar büyüktürler ki, sadece bir ışık mikroskobu ile görülebilirler (Şekil 21.14). Gibi bakteriler için 1.0 x 0.5 mikron ile karşılaştırıldığında, yaklaşık 0,4 x 0,2 mikrondur. E. koli. Tamamı hücre çekirdeği içinde çoğalan diğer hayvan DNA virüslerinin aksine, çiçek virüsleri çift sarmallı DNA'larını konakçı hücrenin sitoplazmasında çoğaltır. Virüs parçacıkları, inklüzyon cisimleri olarak bilinen hücre altı fabrikalarında üretilir. Poxvirüsler, kompleks bakteriyel virüslerin T4 ailesi ile yaklaşık olarak aynı sayıda 150-200 gene sahiptir.

Poksvirüsler en büyük hayvan virüsleridir.

DNA içeren bitki virüsleri nispeten nadirdir. Bir örnek karnabahar mozaik virüsü (CMV)Küçük bir küresel kabuğun içinde dairesel DNA'ya sahip olan ve karnabahar ve lahana ve Brüksel lahanası gibi akrabalarını öldüren . Bu virüs, bazı genlerinden gelen hızlandırıcıların son derece güçlü olması ve böcek öldürücü toksinleri veya diğer transgenleri ifade etmek için bitki genetik mühendisliğinde kullanılmış olması nedeniyle dikkate değerdir. Bitki virüslerinin çoğu, aşağıda tartışılacağı gibi RNA genomlarına sahiptir.

Karnabahar mozaik virüsünden gelen güçlü promotörler, bitkilerin genetik mühendisliğinde genleri ifade etmek için kullanılır.


DNA neden çift sarmallı, ancak RNA tek sarmallı?

Aslında, daha iyi bir soru nedenini sormaktır. DNA ilk etapta çift sarmallıdır. Birçok kişi, çift sarmallı olmanın kopyalanmasına izin verdiğini varsayıyor, ancak bu açıklama su tutmaz. Tek iplikli de olabilir - hem RNA hem de DNA zaten sadece tek bir DNA dizisinden kopyalanır. Aslında, DNA'nın sadece tek bir ipliği RNA veya DNA polimeraza* sunmak için geçmesi gereken tüm 'açma' sürecinden tasarruf sağlayacaktır.

42 yorum:

Evet, DNA'nın çift, RNA'nın tek iplikli olması için iyi bir neden, bir nokta eklemek istiyorum, bu DNA urasil(RNA) yerine timin içerir, bu, replikatör ve translasyon enzimlerinin ebeveynini tanımasını sağlayabilir. iplik..

lütfen bunun ayrıntılarını bilmeme izin ver.

onun gerçekten otantik kanıtı
neden 2 H-bağ s/b adinin n timin varken 3 H-bağ s/b guanin n sitokin olduğunu sormak istiyorum
TEŞEKKÜRLER, MAIRA

Biri pürin diğeri pirimidin.

DNA için hidrojen bağlarının sayısı önemli değildir, söz konusu olan, bazların HERHANGİ bir hidrojen bağı oluşturma yeteneğidir. T yalnızca A ile hidrojen bağları oluşturabilir ve C yalnızca G ile hidrojen bağları oluşturabilir. Başka hiçbir biçim çalışmaz ve eşleşme gerçekleşemez.

Tam olarak neden GC etkileşiminde üç H-bağının varken AT etkileşiminde 2 H-bağının bulunduğuna gelince, bunun nedeni oldukça karmaşıktır ve moleküler yapıları tarafından belirlenen çeşitli bazların üç boyutlu şekilleri ile ilgilidir. . A-T etkileşiminde, üçüncü bir H-bağının oluşması için bir fırsat yoktur. Nedenini görmek için bu resme bir bakın.

Lütfen açıklığa kavuşturur musunuz - DNA duyusu anti-duyu ipliği, benim anlayışıma göre DNA replikasyonunda yer alır.

Evet. Belki bir açıklama yapılmalıdır. her iki iplikçik de DNA replikasyonu için şablon olarak kullanılabilir, ancak transkripsiyon sırasında sadece 3'-5' (anti-sens) kullanılır. RNA polimeraz olmasının nedeni sadece 3'39-5'39 DNA zincirinden okur ve RNA'yı 5'39-3'39 yönünde sentezler.

yanlışım varsa düzeltin. =)

dna neden merdiven şeklinde veya düz değil??

dna neden çift sarmal oluşturur dna'nın yapısından hangi kuvvetler sorumludur? lütfen acele edin ans..yarın benim sunumum.

çok teşekkür ederim! bu, AP Biyoloji ödevimde bana çok yardımcı oldu.

DNA neden tek iplikli değil de çift iplikli (çift sarmallı)?

cool bazı biyoloji ödevlerimde bana yardımcı oldu

Teşekkürler. gerçekten yardımcı oldu. Bu bağlamda bir sorum var. RNA normalde bir hücrede dsRNA olarak bulunur mu? DNA'nın çift sarmallı olmasının tek amacı genomu sağlam tutmak mı? lütfen açıklayın

yazı için teşekkürler.. bana çok yardımcı oldu

Harika bir yazı. Ökaryotik biyokimya karmaşıktır. Doğal seçilimin yaşamın bu aşamasına ulaşmasının milyarlarca yıl sürmesine şaşmamalı.

NEDEN nedenini açıklamakta çok yararlı ve iyi!

evet, şimdi dNA'nın neden çift sarmallı olduğunu anlayın. Her şeyin bir açıklaması var.

yine de bu, RNA'nın neden tek sarmallı olduğunu açıklamıyor mu?
ve neden üridin DNA'da değil de RNA'da bulunur?

Sudheesh, sanırım ilk soruya cevap veriyor. Son paragrafı tekrar okuyun.

Ynt: İkinci soru, buraya bir göz atın.

bir numaralı nedenden dolayı üçlü veya daha fazla olması halinde de 'koruma' işlemi yapılabilir.
cevabı olan varsa.

Açık olduğun için teşekkürler.

DNA'nın neden asit (deoksiribonükleik asit) olarak adlandırıldığını söyleyen var mı?

efendim, RNA'nın tek sarmallılığının nedeni konusunda hâlâ kafam karıştı. NASIL dis yapı kararlı? nd JENİTİK MALZEME midir, değil midir?

Bu yorum yazar tarafından kaldırılmıştır.

RNA tek zincirli olarak mevcut değildir çünkü:

Bir hücredeki RNA, yalnızca transkripsiyonla üretilir ve başka yollarla üretilmez. Sadece bir DNA dizisinin kopyalandığını unutmayın. Yani açıkçası sadece bir RNA zinciri sentezlenir.

bir olası açıklama daha olabilir:
Tamamlayıcı DNA dizisi, DNA'ya bağımlı DNA polimeraz tarafından (çoğaltma sırasında) sentezlenir. Ve çekirdekte tamamlayıcı bir RNA zincirini sentezlemek için böyle bir RNA'ya bağımlı RNA polimeraz yoktur.

Ayrıca dsRNA'nın biyolojik önemi yoktur, çünkü:
# Nükleer gözenekleri geçemez. (Umuyorum)
# Ribozomlar tarafından çevrilemez (antisens RNA tedavisinin temel prensibi)


Çift ​​sarmallı RNA tarafından güçlü ve spesifik genetik girişim Caenorhabditis elegans

RNA'nın hücrelere deneysel girişi, bir endojen gen 1, 2'nin işlevine müdahale etmek için belirli biyolojik sistemlerde kullanılabilir. Bu tür etkilerin, enjekte edilen RNA ile endojen mesajcı RNA transkriptleri arasındaki hibridizasyona bağlı olan basit bir antisens mekanizmasından kaynaklandığı öne sürülmüştür. Nematodda RNA enterferansı kullanılmış Caenorhabditis elegans gen ekspresyonunu manipüle etmek için 3 , 4 . Burada, karışan RNA'nın yapısı ve iletimi için gereksinimleri araştırıyoruz. Şaşırtıcı bir şekilde, çift sarmallı RNA'nın girişim üretmede her iki sarmaldan ayrı ayrı olduğundan önemli ölçüde daha etkili olduğunu bulduk. Yetişkin hayvanlara enjeksiyondan sonra, saflaştırılmış tek sarmallar en fazla mütevazı bir etkiye sahipken, çift sarmallı karışımlar güçlü ve spesifik enterferansa neden oldu. Bu müdahalenin etkileri, hem enjekte edilen hayvanlarda hem de onların soyunda belirgindi. Etkilenen hücre başına yalnızca birkaç enjekte edilmiş çift sarmallı RNA molekülü gerekliydi, bu da endojen mRNA ile stokiyometrik etkileşime karşı çıkıyor ve girişim sürecinde bir katalitik veya amplifikasyon bileşeni olabileceğini öne sürüyordu.


MRNA'nın Çift Zincirli cDNA'ya dönüştürülmesi

mRNA'nın çift sarmallı ek DNA'ya enzimatik dönüşümü, bir dizi farklı prosedürle gerçekleştirilebilir. Bunların tümü, ters transkriptazın etkisini ve cDNA'nın oligonükleotid ile hazırlanmış sentezini içerir. Bundan sonra, ortak kullanımdaki prosedürler önemli ölçüde farklılık gösterir. İkinci ipliğin sentezlenmesine yönelik bir dizi yöntem ve klonlanabilir DNA yapmak için uygun uçların üretilmesine yönelik çeşitli prosedürler vardır. Bu prosedürlerin ana hedefleri, mRNA'nın vektör DNA'ya bağlanabilen DNA'ya yüksek bir dönüşüm verimi ile mümkün olduğu kadar uzun olan ek DNA'yı oluşturmaktır. Aşağıdaki protokoller yalnızca ticari olarak temin edilebilen reaktifleri gerektirir ve genellikle iyi cDNA kitaplıkları üretmede başarılıdır. Temel protokol, daha sonra EcoRI gibi benzersiz bir kısıtlama alanına klonlama için bağlayıcılara bağlanabilen kör uçlu cDNA yapmak için bir yöntemi açıklar. NS

(3'den 5'e kadar) bir oligo(dT) primeri, XhoI endonükleaz için bir kısıtlama bölgesi ve üretimi sırasında kısıtlama bölgesini korumak için bir (GA)20 tekrarından oluşan bir bağlayıcı-primerden yararlanır. kör uçlu cDNA. Bireysel cDNA molekülleri üzerindeki dahili XhoI bölgeleri, birinci iplikli nükleotit karışımına 5-metil-dCTP'nin dahil edilmesiyle korunur. Benzersiz uçlara sahip olan nihai cDNA'lar, EcoRI adaptörlerinin 5' ucuna bağlanmasından ve cDNA'ya bağlayıcı-primer tarafından dahil edilen 3' XhoI bölgelerini serbest bırakmak için XhoI tarafından sindirildikten sonra EcoRI/XhoI ile sindirilmiş vektörlere klonlanabilir. Bu değişiklikler, temel protokolden önemli ölçüde daha hızlı ve daha kolay olan oldukça basitleştirilmiş bir prosedürle sonuçlanır.


Hücresel proteinler, herpes simpleks virüsünün DNA replikasyonunun kökenini geçen bir transkriptin başlangıç ​​bölgesinden tek ve çift sarmallı DNA ve RNA'yı spesifik olarak bağlar.

Herpes simpleks virüsü 1 DNA sentezinin küçük bileşenli kökenleri, kökenlerden yaklaşık 290-360 baz çifti olan heterojen başlatma bölgelerine sahip bir RNA tarafından enfeksiyonun geç döneminde kopyalanır. Hücresel proteinlerin, bu RNA'nın bir alt kümesinin 5' ucunu temsil eden etiketli bir RNA probu ile reaksiyona girdiğini, ancak bu RNA'nın tamamlayıcı ipliği ile reaksiyona girmediğini rapor ediyoruz. Proteinler iki kompleks oluşturur. Kompleks 2, test edilen tüm nükleer özütler tarafından oluşturulurken, kompleks 1, değişmez bir şekilde yalnızca sahte enfekte hücrelerin nükleer özütlerinde bulunan proteinler tarafından oluşturulmuştur. Kompleks 1, etiketli RNA probunun 40 nükleotidlik bitişik bir uzantısını nükleaz bozulmasından korur. Kompleks 1'in oluşumu, tek sarmallı RNA ve DNA ve çift sarmallı RNA ve DNA tarafından diziye özgü bir tarzda rekabetçi bir şekilde inhibe edildi. Kompleks 1'i oluşturan protein(ler) bu nedenle, nükleik asidin doğasından (tek ve çift sarmallı RNA ve DNA) bağımsız olarak belirli bir nükleotid dizisini tanımaları bakımından bilinen nükleik asit bağlayıcı proteinlerden oldukça farklıdır. Şu sonuca varıyoruz: (i) kompleks 1 ve 2'yi oluşturan proteinler muhtemelen farklıdır, (ii) kompleks 1, viral replikasyon için enfeksiyon boyunca gerekli değildir veya kültürdeki hücrelerde viral replikasyonu engelleyemez ve (iii) duyarlı hücreler enfeksiyon, tek sarmallı nükleik asitlerdeki belirli dizileri tanıyan bir veya daha fazla proteini kodlar ya bu proteinler, çift sarmallı nükleik asitte aynı sarmalın konformasyonuyla tek sarmallı nükleik asitler üzerinde uyumlu bir konformasyon verir veya bu proteinler spesifik bir , hem tek sarmallı hem de çift sarmallı nükleik asitlere farklı konformasyon.


Çift sarmallı RNA Tek sarmallı DNA - Biyoloji

DNA ve RNA benzer olsa da, çok belirgin farklılıkları vardır. Tablo 1, DNA ve RNA'nın özelliklerini özetlemektedir.

Tablo 1. DNA ve RNA'nın Özellikleri
DNA RNA
İşlev Genetik bilgiyi taşır Protein sentezinde görev alır
Konum Çekirdekte kalır Çekirdeği bırakır
Yapı DNA çift sarmallı “merdiven”dir: baz basamaklı şeker-fosfat omurgası. Genellikle tek sarmallı
Şeker deoksiriboz riboz
pirimidinler sitozin, timin sitozin, urasil
pürinler adenin, guanin adenin, guanin

Bir diğer farklılıktan bahsetmekte fayda var. Tek tip DNA vardır. DNA, her hücre nesline aktarılan kalıtsal bilgidir ve DNA'nın replikasyonu gerektiğinde, iplikçikleri az miktarda enerji ile "açılabilir" ve DNA, RNA'ya kopyalanır. Birden fazla RNA türü vardır: Messenger RNA, bir protein yapmak için gerekli bilgiyi çekirdekten (DNA'nın kaldığı yer) ribozomların bulunduğu sitoplazmaya taşıyan geçici bir moleküldür. Diğer RNA türleri arasında ribozomal RNA (rRNA), transfer RNA (tRNA), küçük nükleer RNA (snRNA) ve mikroRNA bulunur.

RNA tek sarmallı olmasına rağmen, çoğu RNA türü, tamamlayıcı diziler arasında kapsamlı intramoleküler baz eşleşmesi gösterir ve işlevleri için gerekli olan öngörülebilir üç boyutlu bir yapı oluşturur.

Daha sonra öğreneceğiniz gibi, bir organizmadaki bilgi akışı DNA'dan RNA'ya ve proteine ​​doğru gerçekleşir. DNA, transkripsiyon olarak bilinen bir süreçte mRNA'nın yapısını belirler ve RNA, translasyon olarak bilinen bir süreçte proteinin yapısını belirler. Bu, tüm organizmalar için geçerli olan Merkezi Yaşam Dogması olarak bilinir, ancak viral enfeksiyonlarla bağlantılı olarak kuralın istisnaları ortaya çıkar.

Özetle: DNA ve RNA

Nükleik asitler, hücre bölünmesi ve protein sentezi gibi hücresel aktiviteleri yöneten nükleotitlerden oluşan moleküllerdir. Her nükleotid bir pentoz şeker, bir azotlu baz ve bir fosfat grubundan oluşur. İki tür nükleik asit vardır: DNA ve RNA. DNA, hücrenin genetik planını taşır ve ebeveynlerden yavrulara (kromozomlar şeklinde) aktarılır. Zıt yönlerde uzanan, hidrojen bağları ile bağlanan ve birbirini tamamlayan iki tel ile çift sarmal bir yapıya sahiptir. RNA tek ipliklidir ve pentoz şekerden (riboz), azotlu bir bazdan ve bir fosfat grubundan oluşur. RNA, protein sentezinde ve düzenlenmesinde rol oynar. Messenger RNA (mRNA), DNA'dan kopyalanır, çekirdekten sitoplazmaya aktarılır ve proteinlerin yapımı için bilgi içerir. Ribozomal RNA (rRNA), protein sentezi bölgesindeki ribozomların bir parçasıdır, oysa transfer RNA (tRNA) amino asidi protein sentezi bölgesine taşır. microRNA, protein sentezi için mRNA kullanımını düzenler.


Moleküler Biyoloji

Replikasyona katılan bir DNA molekülünün sarmal yapısı Şekil 1.13'te gösterilmektedir. Kopyalanmamış bölge, iki yavru çiftin oluştuğu eşlenmiş bölgeye açılan ebeveyn çiftinden oluşur. Çift sarmal yapı, çoğaltma çatalı olarak adlandırılan iki bölge arasındaki birleşimde bozulur. Replikasyon, replikasyon çatalının ebeveyn DNA'sı boyunca hareketini içerir, bu nedenle ebeveyn ipliklerinin sürekli olarak çözülmesi ve yavru duplekslere geri sarılması vardır.

  • Endonükleazlar bireysel bağları keser içinde RNA veya DNA molekülleri, ayrı parçalar üretir. Bazı DNAazlar, hedef bölgede bir dubleks DNA'nın her iki zincirini de parçalarken, diğerleri iki zincirden sadece birini parçalar. Endonükleazlar, Şekil 1.14'te gösterildiği gibi kesme reaksiyonlarında yer alır.