Bilgi

29.5: İnsan Evrimi - Biyoloji

29.5: İnsan Evrimi - Biyoloji



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Şaşırtıcı olmayan bir şekilde, bilim camiasının son nüfus dinamiklerine uzun ve biraz tartışmalı bir ilgi geçmişi vardır. Bu kromozomları bir otozom üzerindeki kısa bir yığına göre özel yapan şey tam olarak budur; tam olarak nereden geldiğini biliyoruz çünkü baba ya da anne soyunu zamanda geriye doğru takip edebiliyoruz.

Bu tür yeniden yapılandırma, diğer kromozomlarla çalışmaz. Örneğin, belirli bir popülasyondaki tüm kromozom 1'in belirli bir yığınını kullanarak bir ağaç oluşturacak olsaydı, bunlar gerçekten bir filogeni oluştururdu, ancak bu soyoluş, her bir aile ağacının rastgele atalarından seçilirdi.

Dizileme gelişmeye ve daha etkili olmaya devam ettikçe, insan genom projesi önerildi ve bununla birlikte, genomik verilere bir çeşit çeşitlilik ölçüsü eklemek için güçlü bir baskı vardı. Teknik olarak konuşursak, bu çeşitlilik ölçüsü için mikro uydulara bakmak en kolayıydı çünkü bir dizi polimorfizmini incelemek yerine boyut polimorfizmlerini görmek için jel üzerinde incelenebilirler. Bir hatırlatma olarak, bir mikro uydu, insan genomunda genellikle kısa ardışık tekrarlarla karakterize edilen değişken uzunlukta bir bölgedir. Mikro uyduların bir nedeni, insan genomundaki ALU elementleri gibi kendilerini genoma sokan retrovirüslerdir. Bu unsurlar bazen aktif hale gelir ve yerleştirme olayları olarak geriye dönük olarak yer değiştirir ve insan soyunda bu yerleştirme olaylarının ne zaman gerçekleştiği izlenebilir. Bu nedenle, genomun bu kısımlarını çeşitli farklı popülasyonlarda test etmek için erken bir baskı vardı. Mikro uydularla ilgili gerçekten çekici olan şey, oldukça polimorfik olmaları ve aslında mutasyon oranlarının çıkarılabilmesidir. Dolayısıyla bu oranlara dayanarak sadece popülasyonlar arasında belirli bir ilişki olduğunu söyleyemeyiz, aynı zamanda ne kadar süredir evrimleştiklerini ve hatta belirli mutasyonların ne zaman meydana geldiğini ve filogenetik ağacın belirli dallarında ne kadar süredir olduğunu da söyleyebiliriz. .

SSS

S: Bu, SNP'lerle basitçe yapılamaz mı?

C: SNP'lerle bunu çok kolay yapamazsınız.

Alel frekanslarına dayanarak kaç yaşında olduklarına dair bir fikir edinebilirsiniz, ancak aynı zamanda seçimden de etkilenecekler.

İnsan genom projesinden sonra, SNP'lerin genomuna geniş bakan Haplotip kalıtım Hapmap projesi geldi. Hapmap'in popülasyondaki ortak haplotipleri işaretleyen SNP'lere bakan genotipleme dizileri tasarlamadaki önemini öğrendiğimiz önceki bölümlerde Haplotip kalıtımını ayrıntılı olarak tartışmıştık.

Darboğazların İnsan Çeşitliliği Üzerindeki Etkileri Bu veri zenginliğini çalışmalarda ve çok sayıda matematiksel teknikte kullanmak, insanların aslında nüfus sayımımıza göre çok düşük bir çeşitliliğe sahip olduğunun farkına varılmasına yol açtı; bu da küçük bir etkin nüfus büyüklüğü anlamına gelir. Wright-Fisher modelini kullanarak, kurucu bir popülasyon büyüklüğü oluşturmak için bugün popülasyonda gördüğümüz çeşitlilik ve mutasyon sayısından geriye doğru çalışmak mümkündür. Bu hesaplama yapıldığında 10.000 civarında olduğu ortaya çıkıyor.

SSS

S: Bu neden bizim nüfus sayımımızdan çok daha küçük?

C: Bir yerlerde bir nüfus darboğazı vardı.

İnsanlar arasındaki toplam varyasyonun çoğu kıta içinde gerçekleşiyor. Çeşitliliğin coğrafya ile ne kadar açıklanıp ne kadar açıklanmadığı ölçülebilir. Çoğunun coğrafya ile açıklanmadığı ortaya çıktı. Aslında, en yaygın varyantlar her popülasyonda polimorfiktir ve ortak bir varyant belirli bir popülasyona özgüyse, muhtemelen bunun sürüklenme yoluyla gerçekleşmesi için yeterli zaman olmamıştır. Birkaç kuşak boyunca yalnızca şans eseri yüksek bir alel frekansına ulaşmanın ne kadar olası olmayan bir süreç olduğunu hatırlayın. Bu nedenle, bunu gerçekleştiğinde bir seçim sinyali olarak yorumlayabiliriz. Çeşitlilik kalıplarını ve ağaçları ataların haplotipleriyle karşılaştırmaya ilişkin tüm kanıtlar, bu alandaki ezici fikir birliği olan ve tüm genetik popülasyon verilerini gözden geçirdiğimiz mercek olan Afrika Dışı hipotezine yakınlaşıyor. Afrikalı kurucu popülasyondan başlayarak, wright balıkçı modelini kullanarak nüfus artışını modellemenin mümkün olduğunu gösteren çalışmalar olmuştur. Çalışmalar, Asya ve Avrupa popülasyonlarında gördüğümüz büyüme oranının, yalnızca Afrika dışı olaydan sonraki büyük üstel büyüme ile tutarlı olduğunu göstermiştir.

Bu, üstel büyümenin takip ettiği Darboğazlar aşırı nadir alellere yol açabileceğinden, ırklar arasındaki fonotipik farklılıkların nedenlerini anlamamıza yardımcı olur. İnsan çeşitliliği üzerine mevcut teori, kurucu nüfusun Afrika'dan göç etmesinden sonra ikincil darboğaz olayları olduğunu belirtir. Bu kurucular, daha önceki bir noktada, yakın atalarından bağımsız olarak, şimdi gezegendeki her insan genomuna yansıyan daha da küçük bir darboğaz olayına maruz kaldılar. Orijinal darboğazın ne kadar küçük olduğunu, Afrika ve Avrupa kökenli bireyler arasındaki farklılıklara bakarak, ikincil darboğazın etkilerini ve Avrupa nüfusunun üstel büyüme terimini çıkararak tahmin etmek mümkündür. Darboğaz olay tahminine yaklaşmanın diğer bir yolu, birleşen ağaçlar oluşturmak için gereken alel frekans spektrumunu basitçe incelemektir. Bu şekilde, genom boyunca haplotipler alınabilir ve birleşmenin genom boyunca nasıl değiştiğini gözlemleyerek en son ortak ataya ne olduğu sorulabilir. Örneğin, haplotipin uzunluğu göz önüne alındığında, bazı haplotiplerin pozitif olarak ancak yakın zamanda seçildiği tahmin edilebilir. Avrupa popülasyonundaki bu tür yeni mutasyonlardan birine örnek olarak laktaz geni verilebilir. Asya popülasyonu için başka bir örnek ER lokusudur.

Çoğu haplotip için bir birleşme ağacı çizildiğinde, türleşmenin gerçekleştiğini düşündüğümüzden çok daha öncesine gittiğini gösteren çok sayıda literatür var. Bu, belirli özelliklerin çok uzun bir süre polimorfik tutulduğunu gösterir. Bununla birlikte, tüm genomdaki bu özellik dağılımına bakılabilir ve ondan popülasyon tarihi hakkında bir şeyler çıkarılabilir. Bir popülasyonda yeni bir darboğaz varsa, bu, ataların çok yeni olmasıyla yansıtılırken, daha eski şeyler darboğazdan kurtulmuş olacaktır. Birleşme zamanlarının dağılımı alınabilir ve nüfus büyüklüğünün etkisinin zamanla nasıl değişeceğine dair simülasyonlar çalıştırılabilir. Bu tür bir çalışmayı yapmak için model, Li ve Durbin tarafından özetlenmiştir. Onların çalışmasından alınan Şekil 29.11, bu tür iki darboğaz olayını göstermektedir. Birincisi, kıta dışına göçlerden çok önce Afrika'da meydana gelen darboğazdır. Bunu, Afrika dışındaki göç gruplarından kaynaklanan nüfusa özgü bir darboğaz izledi. Bu, günümüz popülasyonlarının atalarına göre çeşitliliğine yansır ve bu popülasyonlardaki herhangi iki kişiden bir çift kromozoma bakmaktan türetilebilir.

Hastalığı Anlamak

İnsan popülasyonlarının darboğazlardan geçtiğini anlamak, popülasyona özgü hastalıkları anlamak için önemli çıkarımlara sahiptir. Tennessen ve ark. bu yıl birçok birey sınıfındaki ekzom dizilerine bakıyordu. Çalışma, nadir varyantların hastalığa nasıl katkıda bulunabileceğine bakmayı ve sonuç olarak popülasyon genetiği modellerini verilere uydurabilmeyi ve geniş bir popülasyon panelinden ekzomları sıralarken ne tür zararlı varyantların görüldüğünü sormayı amaçladı. Bu yaklaşımı kullanarak, daha sonra kurucu ve dallanan popülasyonlar arasında üstel büyümenin ne kadar zaman önce gerçekleştiğini tanımlayan parametreler üretebildiler. Bunun bir örneği için aşağıdaki şekil 29.12'ye bakın:

Son Popülasyon Karışımını Anlamak

Birleşme zamanlarını görüntülemeye ek olarak, daha yeni popülasyon katkılarını anlamak için SNP'ler üzerinde Temel Bileşen Analizi de yapılabilir. Bunu çoğu popülasyonda çalıştırmak, coğrafi konuma göre kümelenmeyi gösterir. Bununla birlikte, tarihsel sebeplerden dolayı yakın zamanda bir karışım yaşayan bazı popülasyonlar vardır. Bilimsel literatürde en çok atıfta bulunulan iki kişi şunlardır: Ortalama olarak 20 yaşında olan Afrikalı Amerikalılar.

Afrika kökenli Amerikalıların ve Meksikalı Amerikalıların karışım olayı hakkında söylenebilecek iki önemli şey var. İlk ve daha belirgin olanı, katkı seviyesinin çıkarılmasıdır. İkincisi ve daha ilginç olanı, gerçek karışım seviyesine dayalı olarak katkı olayının ne zaman gerçekleştiğini çıkarmaktır. Önceki bölümlerde tartıştığımız gibi, genomun ırksal gösterenleri, her nesildeki rekombinasyon nedeniyle karışımla parçalanır. Nüfus kapsanırsa, Avrupa ve Batı Afrika kökenlilerin yüzdesi her nesilde aynı kalmalıdır, ancak karıştırma nedeniyle segmentler kısalacaktır. Bu nedenle, haplotip bloklarının uzunluğu, karıştırmanın orijinal olarak gerçekleştiği zamana geri dönmek için kullanılabilir. (Başlangıçta gerçekleştiğinde, örneğin bazı kumarbazların tamamen Afrika kökenli olduğu gibi büyük yığınlar beklerdik.) Bu yaklaşımı kullanarak, yakın zamandaki ata tuzaklarının dağılımına bakılabilir ve ardından bu göçmenlerin bir ataya girdiklerinde bir model uydurulabilir. aşağıda gösterildiği gibi nüfus:


İnsan kininojen geninin yapısal organizasyonu ve evrimi için bir model.

Tüm insan kininojen geni, bir dizi örtüşen genomik DNA parçası olarak izole edilmiştir ve yaklaşık 27 kilobaz çiftini kapsayan 11 ekzon, kısıtlama enzimi analizi ve nükleotid dizi belirlemesi ile haritalanmıştır. Dokuz adet 5x27-terminal ekzon, yüksek moleküler ağırlıklı (HMW) ve düşük moleküler ağırlıklı (LMW) prekininojen mRNA'lar için ortak olan sinyal peptidi ve ağır zincir için 5'x27-çevrilmemiş bölgeyi ve protein kodlama bölgesini kodlar. . Ekson 10, bradikinin için ortak diziden ve HMW prekininojen mRNA için hemen takip eden benzersiz diziden oluşur. Ekson 11 daha sonra ekson 10'dan aşağı akış yönünde 90 nükleotitlik bir diziyi izleyerek yerleştirilir ve LMW prekininojen mRNA'sına özgü diziyi kesin olarak belirtir. Bu, toplam insan hücresel DNA'sının hibridizasyon analizi ile birlikte, insan HMW ve LMW prekininojen mRNA'larının, alternatif RNA işleme olaylarının bir sonucu olarak tek bir genden üretildiği sonucuna varmamıza yol açar. Kininojen geninin yapısal analizi ayrıca, dokuz adet 5'li terminal ekzonunun her birinin, kininojenlerin amino terminal kısmında gözlenen dokuz protein alanını ayrı ayrı belirlediğini gösterir. Ayrıca, bu dokuz genetik alan, üç genetik segmentten oluşan üç kez tekrarlanan bir model ile karakterize edilebilir ve bu üç alanın, ekzonlar 3-5 ve eksonlar 6-8'i kapsayan iki seti birbiriyle en yakından ilişkilidir. Bu nedenle, kininojen geninin yapısının üretilmesi için bir model olarak iki ardışık çoğaltma mekanizması önerdik.


İçindekiler

Bugünkü Fas bölgesinin, MÖ 90.000 ile 190.000 arasında Paleolitik zamanlardan beri yerleşim gördüğü düşünülüyordu, ancak 300.000 yıllık bir homo sapien'in keşfinden sonra artık durum böyle değil ve bunun yerine, şimdi olduğu ileri sürülmektedir. aynı kanıtlarla insanlar tarafından ilkel zamanlardan beri iskan edilmiştir. [1] Üst Paleolitik dönemde, Mağrip bugünkünden daha verimliydi ve günümüzün kurak arazisinden daha çok bir savana benziyordu. [2] 22.000 yıl önce, Aterian'ın yerini, İber kültürleriyle benzerlikler paylaşan İberomaurus kültürü aldı. Iberomaurus dönemi Mechta-Afalou mezarları ile Avrupa Cro-Magnon kalıntıları arasında iskeletsel benzerlikler gözlemlenmiştir. Fas'taki Iberomaurus endüstrisinin yerini Kapsian kültürü aldı.

Kuzey Afrika ve Fas, erken Klasik dönemde ticaret kolonileri ve yerleşimler kuran Fenikeliler tarafından yavaş yavaş yükselen Akdeniz dünyasına çekildi. [3] Mogador, MÖ 6. yüzyılın başlarında bir Fenike kolonisiydi. [4] [ sayfa gerekli ]

Fas daha sonra Kartaca merkezli bir Kuzey Afrika imparatorluğunun parçası oldu. Bilinen en eski bağımsız Fas devleti, kral I. Bocchus yönetimindeki Moritanya'nın Berberi krallığıydı. Kuzey Fas'taki bu krallık, Moritanya'nın şu anki durumuyla karıştırılmamalıdır, en azından MÖ 110'a kadar uzanır. [5]

Roma İmparatorluğu bu bölgeyi MÖ 1. yüzyıldan itibaren kontrol ederek Mauretania Tingitana adını verdi. Hıristiyanlık MS 2. yüzyılda tanıtıldı ve Roma kasabalarında köleler ve bazı Berberi çiftçiler arasında dönüşümler kazandı.

MS 5. yüzyılda Roma İmparatorluğu'nun gerilemesi üzerine bölge kuzeyden önce Vandallar, ardından da Vizigotlar tarafından işgal edilmiştir. MS 6. yüzyılda kuzey Fas, nominal olarak Doğu Roma veya Bizans İmparatorluğu'nun bir parçasıydı. Bu süre boyunca, Fas'ın iç kısımlarındaki yüksek dağlardaki Berberi sakinleri boyun eğmedi.

MS 670'de, Kuzey Afrika kıyı ovasının ilk Arap fethi, Şam Emevîleri'ne bağlı bir general olan Ukba ibn Nafi'nin komutasında gerçekleşti. Emevi Müslümanları dillerini, yönetim sistemlerini ve İslam'ı Fas'a getirdiler. Berberilerin çoğu, çoğunlukla Arap yönetimi geri çekildikten sonra yavaş yavaş İslam'a dönüştü. Modern Fas bölgesindeki ilk bağımsız Berberi devleti, Rif Dağları'ndaki bir emirlik olan Nekor Krallığıydı. 710 yılında Salih I ibn Mansur tarafından Rashidun Halifeliğine bağlı bir devlet olarak kuruldu. 739'da Büyük Berberi İsyanı'nın patlak vermesinden sonra, Berberiler Sijilmasa'nın Miknasa'sı ve Barghawata gibi başka bağımsız devletler kurdular.

Ortaçağ efsanesine göre, İdris ibn Abdallah, Abbasilerin Irak'taki kabilesini katletmesinden sonra Fas'a kaçmıştı. Awraba Berberi kabilelerini Bağdat'taki uzak Abbasi halifelerine olan bağlılıklarını kırmaya ikna etti ve 788'de İdrisoğulları Hanedanlığı'nı kurdu. İdrisliler Fes'i başkentleri olarak kurdular ve Fas, Müslüman ilim merkezi ve büyük bir bölgesel güç haline geldi. İdrisliler 927'de Fatımi Halifeliği ve onların Miknasa müttefikleri tarafından devrildi. Miknasa, 932'de Fatımilerle ilişkilerini kestikten sonra, 980'de Sijilmasa Mağripleri tarafından iktidardan uzaklaştırıldılar.

Berberi hanedanları Düzenle

11. yüzyıldan itibaren bir dizi güçlü Berberi [6] [7] [8] hanedanı ortaya çıktı. Murabıt hanedanı [9] ve Muvahhid hanedanlığı altında Fas, Mağrip'e, günümüz İspanya ve Portekiz'inin çoğuna ve batı Akdeniz bölgesine hakimdi. 13. ve 14. yüzyıllarda Merinidler Fas'ta iktidarı ellerinde tuttular ve Muvahhidlerin başarılarını Cezayir ve İspanya'daki askeri seferlerle çoğaltmaya çalıştılar. Onları Wattasidler izledi. 15. yüzyılda, Reconquista orta ve güney İspanya'da Müslüman yönetimine son verdi ve birçok Müslüman ve Yahudi Fas'a kaçtı. [10] Portekiz'in 15. yüzyılda Atlantik kıyılarını kontrol etme çabaları Fas'ın içini büyük ölçüde etkilemedi. Elizabeth Allo Isichei'ye göre, "1520'de Fas'ta o kadar korkunç bir kıtlık vardı ki, uzun bir süre başka olaylar bununla tarihlendirildi. Fas nüfusunun on altıncı yüzyılın başlarında 5 milyondan 3 milyonun altına düştüğü öne sürüldü. ve on dokuzuncu yüzyıl." [11]

Şerif hanedanları Düzenle

1549'da bölge, İslam peygamberi Muhammed'in soyundan geldiğini iddia eden ardışık Arap hanedanlarının eline geçti: önce 1549'dan 1659'a kadar hüküm süren Saadi hanedanı ve ardından 17. yüzyıldan beri iktidarda kalan Alaouite hanedanı.

Saadi Hanedanlığı döneminde ülke, 1578'de Ksar el Kebir savaşında Osmanlı akınlarını ve Portekiz işgalini püskürttü. Ahmed el-Mansur'un saltanatı, Saltanat'a yeni zenginlik ve prestij getirdi ve Batı Afrika'ya yapılan büyük bir sefer, ezici bir baskı yarattı. 1591'de Songhay İmparatorluğu'na yenildi. Ancak, Sahra'daki bölgeleri yönetmek çok zor oldu. El-Mansur'un ölümünden sonra ülke oğulları arasında bölündü.

1666'da Fas, o zamandan beri Fas'ın yönetici evi olan Alaouite Hanedanlığı tarafından yeniden bir araya geldi. Fas, İspanya'dan gelen saldırganlıkla karşı karşıyaydı ve Osmanlı İmparatorluğu batıya doğru baskı yapıyor. Alaouitler konumlarını istikrara kavuşturmayı başardılar ve krallık bölgedeki öncekilerden daha küçük olsa da oldukça zengin kaldı. Yerel kabilelerin muhalefetine karşı İsmail İbn Şerif (1672-1727) birleşik bir devlet yaratmaya başladı. [12] Jaysh d'Ahl al-Rif (Riffian Ordusu) ile 1684'te Tanca'yı İngilizlerin elinden aldı ve İspanyolları 1689'da Larache'den sürdü.

Fas, 1777'de Amerika Birleşik Devletleri'ni bağımsız bir ulus olarak tanıyan ilk ulustu. [13] [14] [15] [16] Amerikan Devrimi'nin başlangıcında, Atlantik Okyanusu'ndaki Amerikan ticaret gemileri tarafından saldırılara maruz kaldı. Berberi korsanları. 20 Aralık 1777'de Fas Sultanı III. Muhammed, Amerikan ticaret gemilerinin saltanatın koruması altında olacağını ve böylece güvenli geçiş yapabileceklerini ilan etti. 1786'da imzalanan Fas-Amerikan Dostluk Antlaşması, ABD'nin bozulmamış en eski dostluk anlaşması olarak duruyor. [17] [18]

Faslılar ve Güney Avrupalılar arasında gözlemlenen genetik yakınlık, bu iki grubun ya Üst Paleolitik'te ve Neolitik'te ya da alternatif olarak Güney İberya'da Mağribi birlikleri tarafından paylaşılan tarih boyunca ortak bir atayı paylaşmalarından kaynaklanmaktadır. [19] Ocak 2012'de yayınlanan bir genetik araştırma, yerli Kuzey Batı Afrika atalarının Afrika dışındaki popülasyonlarla en yakından ilişkili göründüğünü, ancak "Fas halkı ile Yakın Doğu/Avrupalılar arasındaki ayrışmanın muhtemelen Holosen'den (>12.000 yıl) önce geldiğini belirtti. Paleolitik (>40.000BC)." [20]

Son araştırmalar, Arapça konuşan Faslı popülasyonlar ile Arapça konuşmayan Faslı popülasyonlar arasında önemli bir genetik farklılık bulunmadığını açıkça ortaya koymaktadır. İnsan lökosit antijeni HLA DNA verileri, hem Arap olmayan etnik dil kimliğine sahip hem de Arap etnik dil kimliğine sahip olan Faslıların çoğunun Berberi kökenli olduğunu ve yalnızca Fas'ı değil, ülkenin geri kalanını işgal eden Arabistan'dan gelen soykütüksel gerçek Arapların olduğunu göstermektedir. 7. yüzyılda Kuzey Afrika artı İspanya, gen havuzuna önemli ölçüde katkıda bulunmadı. [21] [22] İspanya'dan gelen Mağribi mülteciler sahil kasabalarına yerleştiler. [23]

Aslında, 2000 tarihli bir makaleye göre Avrupa İnsan Genetiği Dergisi, Kuzey-Batı Afrika'dan gelen Faslılar, genetik olarak, Bantu etnik kökenine sahip Sahra Altı Afrikalılarından ve Orta Doğululardan ziyade İberyalılara daha yakındı. [24] Sonuçlar, ya Faslıların İspanyollarla tarih öncesi bir akrabalığını, ya da Fas'tan İspanya'ya Mağribi (yani Berberi) girişinin bir sonucu olduğunu veya daha sonra Fas'a sürgün edilen Müslümanlaştırılmış yerli İspanyollardan Fas'a genetik girdinin bir sonucu olduğunu gösteriyor. Katolik Reconquista'nın ardından Müslümanların İspanya'dan kovulması (burada sürülen Müslümanların arasında yalnızca, her halükarda esasen Fas Berberi kökenli olan yabancı kökenli Müslüman nüfus olan Mağribi nüfusu değil, aynı zamanda çoğunluğu olmasa da çoğu Müslüman olan Fas'a İspanyol DNA'sının genetik bir girişi ile sonuçlanan, Fas'ın Arap fethi sırasında Arabistanlı soy Araplarının Faslılar üzerinde sahip olduğu herhangi bir genetik girdiden çok daha fazla.

İncelenen farklı lokuslar, Berberiler ve diğer Kuzey Afrika grupları arasında, özellikle Faslı Arapça konuşanlar arasında yakın benzerlik olduğunu ortaya çıkardı; bu, mevcut Fas nüfusunun güçlü bir Berberi geçmişine sahip olduğu hipoteziyle uyumlu. [25]

Gabriel Camps ve Charles-André Julien gibi tarihçilerle birlikte çeşitli popülasyon genetiği çalışmaları, modern Kuzeybatı Afrikalıların gen havuzunun büyük kısmının, dil grubuna bakılmaksızın, İslam öncesi dönemin Berberi popülasyonlarından türetildiği fikrine destek vermektedir. . [26]

Buna göre X-Kromozom SNP analizleri, yazarlar Kuzeybatı Afrika'daki berberiler ve Araplar arasında yüksek bir genetik homojenlik bildirdiler, bu yüzden bu bölgenin Araplaşmasının kültürel bir fenomen olduğunu öne sürdüler. yapmadı ata popülasyonunun değiştirilmesi anlamına gelir. Sonuçlarımız, kuzeybatı Afrika'nın erken yerleşimi hipotezini desteklemektedir. Orijinal berber popülasyonu, çevredeki bölgelerden düşük bir genetik akış almış gibi görünüyor. Fas popülasyonunun genetik farklılaşmasını açıklamak için farklı hipotezler öne sürülmüştür. İlk genetik sürüklenme, belirli bir coğrafi izolasyon seviyesi nedeniyle yeniden oluşturulmamış alel frekans dağılımında farklılıklara neden olmuş olabilir. Cebelitarık Boğazı birçok yazar tarafından önemli bir genetik engel olarak tanımlanmıştır. Kuzeybatı Afrika ile İber Yarımadası'nın güneyi arasında muhtemelen belirli bir düzeyde genetik değişim meydana gelmiş olsa bile, bu alanda keskin frekans değişiklikleri tanımlanmıştır. Ayrıca Sahra Çölü'nün, KB Afrika popülasyonlarının Sahra altı popülasyonlarından genetik izolasyonundan sorumlu olduğu öne sürülmüştür. Akdeniz bölgesindeki Neolitik demik difüzyonun etkisi hakkında bir fikir birliği yoktur. Sonuçlarımıza göre, Neolitik yayılmaların ve/veya daha sonraki göç olaylarının KB Afrika popülasyonları üzerindeki etkisi düşük olurdu. X-Kromozom SNP analizleri

E-M215 Düzenle

E1b1b (E-M215), Kuzey Afrika'daki en yaygın haplogruptur. E-M215 ve baskın alt bölümü E-M35'in yaklaşık 22.400 yıl önce Doğu Afrika'da ortaya çıktığı ve daha sonra Kuzey Afrika'ya ve oradan Batı Asya'ya yayılacağı düşünülüyor. [29] [30] E1b1b1 clade şu anda Fas'ta çeşitli şekillerde bulunur. Toplam E1b1b1 (E-M35) Faslılarda frekanslar %93,8'e ulaştı. [31]

E-M215, bilinen tüm modern E-M215 erkeklerini, E-M35 ve E-M281'i içeren iki eski şubeye sahiptir. Bu ikisinden, Etiyopya dışındaki yerli bir popülasyonda teyit edilen tek şube E-M35'tir ve bu da sırasıyla E-V68, E-Z827, E-V6 ve E-V92 olmak üzere bilinen dört şubeye sahiptir. E-V68 ve E-V257, Kuzey Afrika ve Afrika Boynuzu'nda en yüksek sayılarda bulunurken, Orta Doğu ve Avrupa'nın bazı bölgelerinde ve Güney Afrika'nın izole edilmiş popülasyonlarında da daha düşük sayılarda bulunmuştur.

Afro-Asya dili konuşanlar arasında E1b1b baskındır. E-M35 soyunun dilsel grubu ve taşıyıcılarının, bu dil ailesinin menşe bölgesinden, Afro-Asya konuşma tarihine sahip popülasyonlar arasında birlikte ortaya çıkmış ve dağılmış olma olasılığı yüksektir. [32] [33]

E-M35'in tüm ana alt dallarının, ana dalla aynı genel bölgeden kaynaklandığı düşünülmektedir: Kuzey Afrika, Afrika Boynuzu veya Yakın Doğu'nun yakın bölgeleri. E-M35'in bazı şubeleri binlerce yıl önce Afrika'dan ayrıldı. Örneğin, Battaglia ve ark. (2007) harvcoltxt hatası: hedef yok: CITEREFBattagliaFornarinoAl-ZaheryOlivieri2007 (yardım), E-M78'in (bu yazıda E1b1b1a1 olarak anılır) Avrupa'da 10.000 yıldan daha uzun süredir olduğunu tahmin ediyor.

E-M81 Düzenle

E1b1b1b1 (E-M81), vakti zamanında E1b1b1b, E3b1b, ve E3b2, Fas'taki en yaygın Y kromozomu haplogrubudur ve alt sınıfının hakim olduğu E-M183.

14.200 yıl önce Kuzey Afrika'da ortaya çıktığı düşünülmektedir. [34] Ana soyundan E1b1b (E-M215) yaklaşık 42.600 yıl önce Afrika Boynuzu'nda ilk kez ortaya çıktığına inanılmaktadır. [35]

Bu haplogrubu Kuzey Afrika'da %85'lik bir ortalama frekansa ulaşıyor. Saharawiler de dahil olmak üzere bazı Faslı Berberi popülasyonlarında yaklaşık %80 veya daha fazla olan sıklık, Mısır'da bu aralığın doğusunda yaklaşık %28'e düşer. [30] [36] [37]

Bu Berberi grupları ve Mozabitler, Riffians, Chleuhs, Orta Atlas ve Kabyle gibi diğerleri arasında klanın yaygınlığı nedeniyle, bazen genetik olarak adlandırılır. Berberi işaretleyici.

The Berber haplogroup alt dallarının bu filogenetik ağacı, YCC 2008 ağacına ve ardından ISOGG tarafından özetlendiği gibi yayınlanmış araştırmalara dayanmaktadır. [38] [39] [40]

  • E1b1b1b (L19, V257)
    • E1b1b1b1 (M81)
      • E1b1b1b1a (M107) Underhill ve ark. (2000) harvcoltxt hatası: hedef yok: CITEREFUnderhill_et_al.2000 (yardım) .
      • E1b1b1b1b (M183) Bu dal, E-M81'de son derece baskındır. Aslında Karafet ve ark. (2008) harvcoltxt hatası: hedef yok: CITEREFKarafet_et_al.2008 (yardım) bunu E-M81'in bir alt bölümü olarak tanımlamaya devam ediyor ve ISOGG Karafet ve arkadaşlarına atıfta bulunuyor, tüm veriler aslında filogenetik olarak ele alınması gerektiğini ima ediyor gibi görünüyor. M81'e eşdeğer [kaynak belirtilmeli]
        • E1b1b1b1b1 (M165) Underhill ve ark. (2000) harvcoltxt hatası: hedef yok: CITEREFUnderhill_et_al.2000 (yardım) .
        • E1b1b1b1b2 (L351) E-M35 Filogeni Projesinde iki ilgili katılımcıda bulundu.

        Ortalama Kuzey Afrika Faslı Berberi, +%80'de E3b3 frekanslarına sahiptir. Alvarez ve diğerleri(2009) çalışma, Marakeş'teki Berberiler'de E3b1b sıklığının 28/33 veya %84.8 olduğunu göstermektedir. Geri kalan frekanslar 1/33=%3 E3a*, 1/33=%3 E3b*, 1/33 veya %3 E3b1a ve 1/33 veya %3 E3b1c'dir. [31]

        E1b1b (M81) Proto-Berber belirteci E1b1b1b1a1 (M107) Mali'de indirgenmiş bir Proto-Berber soyu. [41]

        E-M78 Düzenle

        En temel ve nadir E-M78* paragrubu, Faslı Araplarda daha düşük frekanslarda bulunmuştur. Alt bölüm E-V65, uzak kuzey Afrika'nın Mağrip bölgelerinde yüksek seviyelerde bulunur. Cruciani ve ark. (2007), Libyalı Arap soyları arasında yaklaşık %20 ve Faslı Araplar arasında yaklaşık %30 seviyeleri rapor etmektedir. Berberiler arasında daha az yaygın gibi görünüyor, ancak yine de >%10 seviyelerinde mevcut. Yazarlar bu soy için Kuzey Afrika kökenli olduğunu öne sürüyorlar. Avrupa'da, İtalya ve Yunanistan'da sadece birkaç kişi bulundu.

        Capelli et al. (2009) harvcoltxt hatası: hedef yok: CITEREFCapelli_et_al.2009 (yardım) Avrupa'daki beta kümesini inceledi. Güney İtalya'da küçük miktarlar buldular, ancak aynı zamanda Cantabria, Portekiz ve Galiçya'da da izler buldular ve Cantabria, çalışmalarında Avrupa'daki en yüksek seviyeye sahip, %3.1 ile (161 kişiden 5'i).

        diğer frekansları E1b1b1a1c (E-V22) Cruciani ve ark. (2007) Faslı Arapları (%7.27, 55 kişi) ve Faslı Yahudileri (%8, 50 kişi) içermektedir.

        Fas Y-DNA Haplogroups Düzenle

        Nüfus n A/B E-M33 E-V38 E-M35* E-M78 E-M81 E-M123 G J r Referans
        Fas 760 0.9 2.7 3.2 4.2 6.8 67.3 0.6 0.6 7.6 4.4 Bekada et al. 2013 [42]
        Fas 87 9.2 5.7 52.8 26.4 Fadhlaoui-Zid ve ark. 2013 [43]
        Fas 221 1.8 4.5 4 6.8 65 9 4 Fregel et al. 2009 [44]
        Fas 51 4 6 6 6 55 20 4 Onofri et al. 2008 [45]
        Fas 176 6.3 5.1 6.3 63.6 13.6 2.8 Bosch et al. 2001 [46]
        Araplar (Fas) 49 42.9 32.6 20.4 Semino et al. 2004 [47]
        Araplar (Fas) 44 6.8 2.2 11.3 52.2 15.9 6.8 Bosch et al. 2001 [46]
        Araplar (Fas) 54 38.9 31.5 Cruciani ve ark. 2004 [48]
        Berberiler (Fas) 64 10.9 68.7 6.3 Semino et al. 2004 [47]
        Berberiler (Marakeş) 29 3.4 6.9 72.4 Cruciani ve ark. 2004 [49]
        Berberiler (Orta Atlas) 69 10.1 71 4.3 5.8 Cruciani ve ark. 2004 [49]
        Berberiler (Güney Fas) 40 2.5 7.5 12.5 65 10 Bosch et al. 2001 [46]
        Berberiler (Kuzey Merkez) 63 3.1 9.5 7.9 1.5 65 11.1 Bosch et al. 2001 [46]
        Berberiler (Amizimiz) 33 3 3 3 3 84.8 3 Alvarez et al. 2009 [50]
        Berberiler (Asni) 54 1.9 3.7 79.6 1.9 1.9 Dugoujon ve ark. (2005) [51]
        Berberiler (Bouhria) 67 1.5 77.6 6 1.5 6 Dugoujon ve ark. (2005) [51]
        Berberiler (Kuzey Fas) 43 79.1 Ahmed Reguig et al. 2014 [52]
        Berberiler (Güney Fas) 65 98.5 Ahmed Reguig et al. 2014 [52]
        Berberiler (Orta Fas) 187 89.8 Ahmed Reguig et al. 2014 [52]
        Fas Sahrawi 189 0.5 5.2 6.8 55.5 11.1 13.2 7.2 Bekada et al. 2013 [42]
        Fas Sahrawi 89 8.9 11.2 59.5 20.2 Fregel et al. 2009 [44]
        Fas Sahrawi 29 3.4 3.4 75.8 17.2 Bosch et al. 2001 [46]
        Faslı Yahudiler 19 21.1 26.3 31.5 10.5 Francalacci ve ark. 2008 [53]

        J-P209 Düzenle

        Haplogroup J-P209'un yaklaşık 31.700 yıl önce Güneybatı Asya'da ortaya çıktığına inanılıyor (Semino 2004'e göre 31.700±12.800 yıl önce harvnb hatası: hedef yok: CITEREFSemino2004 (yardım) ). Haplogroup J-P209, en yoğun olarak Güneybatı Arap Yarımadası'nda bulunur. Bu bölgenin dışında, J-P209 haplogroup Kuzey Afrika'da var: Cezayir (%35'e kadar) (Semino 2004) hasat hatası: hedef yok: CITEREFSemino2004 (yardım), Tunus (%31'e kadar), [54] Fas (%20'ye kadar) (Semino 2004) hasat hatası: hedef yok: CITEREFSemino2004 (yardım), Mısır (%20'ye kadar) (Luis 2004) hasat hatası: hedef yok: CITEREFLuis2004 (yardım) .

        Diğer haplogruplar Düzenle

        E-M34 SNP'yi kontrol etmeden E-M123 ile ilgili Fas'ta küçük frekanslarda bulunur A için düşük bölgesel yüzdeler E-M123 Faslı Berberlerde %3 civarında rapor edilmiştir. E-M123, E1b1b1b2a (ISOGG 2012) olarak da bilinir.

        Haplogroup J ve Haplogroup R1 gibi Avrasya haplogrupları da çok düşük frekanslarda gözlemlenmiştir. Cruciani ve ark. (2004) Fas'taki popülasyonları analiz eden Kuzey Afrika Y-kromozomal varyasyon modelinin (hem J1 hem de R1b haplogrupları dahil) büyük ölçüde Neolitik kökenli olduğu sonucuna varmıştır, bu da dünyanın bu bölgesindeki Neolitik geçişe demik difüzyonun eşlik ettiğini düşündürmektedir. Berberice konuşan pastoralistlerin Cezayir Çölü'nden Doğu Fas'a göçü, ancak daha sonraki makaleler bu tarihin, Kuzey Afrika'daki Oranian kültüründen Capsian kültürüne geçişle birlikte on bin yıl kadar önce olabileceğini öne sürdü. [55] [56]

        Haplogrup G ve T Fas'ta nadiren bulunur, Fas'ta alınan 147 örnekte %1'inin G olduğu tespit edilmiştir.[57]

        Başka bir çalışmada Fas'taki 312 örneğin %1'i G. [58]

        Başka bir çalışma, yalnızca Fas'ın Azgur Vadisi'ndeki 33 örneğin hiçbirinin belirlenmediği mezralardan örnekler topladı. [31] Bu mezralar, bileşimde tipik olarak Berberi oldukları hissedildiği için seçildi.

        20 Faslı Yahudi üzerinde yapılan bir araştırma, %30'unun G olduğunu buldu. [31] Test edilen erkekler o sırada görünüşe göre İsrail'de yaşıyordu. Yahudi erkekler üzerinde yapılan başka bir araştırma, Fas'taki 83 Yahudi erkeğin %19.3'ünün haplogrup G'ye ait olduğunu buldu. . Ayrıca, Avrupa Neolitik dönemine ait tüm erkek iskeletlerinin çoğunluğu, şimdiye kadar, Buz Adam Ötzi'nin mumyalanmış kalıntıları gibi bu haplogruba ait Y-DNA'yı vermiştir, National Geographic Society, 30.000 yıl önce Orta Doğu'da haplogrup G'yi yerleştirir ve haplogrubu taşıyan insanların Neolitik Çağ'ın Afrika'ya ve ardından Avrupa'ya yayılmasında rol oynadığını varsayıyor [60] Faslı Arapların yüzde ikisi ve Asni Vahası'ndaki Faslı Berberilerin %0 ila %8'inin aynı şekilde G olduğu tespit edildi. [61]

        Haplogroup T, Cezayir sınırlarına yakın Asni Oasis'in merkezi Berberleri arasında %1,9 oranında bulunur ve Faslı Yahudilerde %4 oranında gözlemlenir.

        En bazal ve nadir E1a* paragrubu, Faslı Berberilerden ve Sahrawilerden elde edilen örneklerde daha düşük frekanslarda bulunmuştur. 45.000 civarında, Paleolitik zamanlarda E1b1b ile birlikte Yakın Doğu'dan Kuzey Afrika'ya Geri-Avrasya Göçü ile bağlantılıdır. [61]

        Faslı Berberlerde (E3b %94) bulunan Y-DNA haplogruplarının ana bileşenleri, Avrupa ve komşu Kuzey Afrika ve Yakın Doğu popülasyonları ile paylaşılmaktadır. Haplogrupların küçük payı ayrıca Kuzey Batı Afrikalılar (E1a, A1a %1), Yakın Doğulular (J, G, T %2,4), Sahra Altı Afrikalılar (E3a %1,7) ve Avrupalılar (R1b, I1) ile ilgili olanları da içerir. % 2) yakınlık.

        Belirlenen önemli yüzdelerden bazıları şunlardı:

          : %56 (Aboukhalid 2010 harvnb hatası: hedef yok: CITEREFAboukhalid2010 (yardım) ) - Tipik Afrika kökenli konuşan popülasyonlar. : %20,4 (Semino 2004 harvnb hatası: hedef yok: CITEREFSemino2004 (yardım) ) - Güneydoğu Avrupa, Kuzey Afrika, Afrika Boynuzu, Orta Asya ve Orta Asya'da ılımlı bir dağılımla Arap yarımadası, Levant ve Kafkasya'nın tipik popülasyonları Güney Asya. : %0,8 ila %6,8 (Bosch 2001 harvnb hatası: hedef yok: CITEREFBosch2001 (yardım) ) - Tipik Batı Avrupalılar, bazı Batı Asya halkları, Orta Afrika'nın Sudanlı Fulani ve Çad konuşan halkları ve bazı Orta Asya halkları (örn. Başkurtlar, Türkmenler ve Uygurlar gibi). [62] : %0.4 - Kafkasya'dan ve daha az ölçüde Orta Doğu'dan tipik insanlar. : %0.5 - Faslı Berberiler, Sahrawiler, Güney Avrupalılar ve Sahel'deki bazı Çad konuşmacıları arasında bulunan nadir haplogrup. : %1,7 - Nijer-Kongo konuşan nüfusların tipik bir örneği. : %0.4 - Batı Avrasya'da yaygın olarak dağıtılır. : %0.4 - Kuzey ve Güney-Doğu Avrupa'da zirveleri ile günümüz Avrupa popülasyonlarının çoğunda bulunabilir. Haplogrup I1 Y-kromozomları, Yakın Doğu, Kafkaslar, Kuzeydoğu Afrika ve Orta Sibirya'nın bazı popülasyonlarında da bulunmuştur.

        Berberilerin atası olan Fas'ın tarih öncesi popülasyonları, daha geniş bir Paleo-Akdeniz halkları grubuyla ilişkiliydi. Afroasiatik ailesi muhtemelen Mezolitik dönemde, belki de Kapsian kültürü bağlamında ortaya çıkmıştır. [63] [64] DNA analizi, Fas Berberi popülasyonları ile İskandinavya'nın Sami halkının popülasyonları arasında yaklaşık 9,000 yıl öncesine dayanan bir bağlantı bulmuştur. [65]

        MÖ 5000 civarında, Kuzey Afrika popülasyonları öncelikle Neolitik devrimle ilişkili daha yeni bir müdahale ile Iberomaurus ve Kapsian kültürlerinin yapımcılarından geliyordu. [66] Ön-Berberi kabileleri, Geç Tunç Çağı'ndan Erken Demir Çağı'na kadar bu tarih öncesi topluluklardan evrimleşmiştir. [67]

        DNA kanıtı, 25.000 ila 19.000 yıl önceki Son Buzul Maksimumu sırasında, bir kilometreden fazla kalınlığa sahip büyük buz tabakalarının Kuzey Avrupa'nın çoğunu kapladığını ve bölgeyi insanlar için yaşanmaz hale getirdiğini gösteriyor. İnsan popülasyonlarının güneye, Akdeniz'e yakın daha sıcak bölgelere çekildiğine inanılıyor. Bu dönemde sığınakların İberya, Balkanlar ve İtalya'da olduğuna inanılıyor. Fas'tan İberya'ya bir miktar gen akışı vardı. [68]

        Buzul maksimumundan sonra, Avrupa iklimi ısındığında, sığınakların Avrupa'nın yeniden nüfuslandığı kaynak olduğu düşünülüyor. İber sığınağına tanıtılan Berberi soyları, daha sonra insanların kuzeye doğru genişlemesiyle tüm Avrupa'ya dağılmış olacaktı. Bu, Doğu Avrupa'da ve Rusya kadar kuzeyde, başta Fas olmak üzere Kuzeybatı Afrika ile tarihöncesi bağlantıları olan genetik soyların varlığını açıklayabilir (bkz. mtDNA). [68] İber sığınaklarından gelen insan nüfusunun genişlemesinin de Fas ve Kuzeybatı Afrika'ya geri döndüğüne inanılıyor. [69]

        Tarih öncesi dönemin sonuna kadar Neolitik

        Neolitik Devrim sırasında avcılık ve toplayıcılıktan tarıma geçiş, dünya tarihinde bir dönüm noktası olmuştur. Tarımda ilk değişikliği yapan toplumların, MÖ 10.000 civarında Kuzey Afrika ve Orta Doğu'da yaşadıklarına inanılıyor. Tarım, Orta Doğu'dan çiftçilerin göç etmesiyle Avrupa'ya tanıtıldı. [70] Demik yayılma modeline göre, bu Orta Doğulu çiftçiler, "Afrika dışına" göçten bu yana Avrupa'da yaşayan yerel avcı-toplayıcı popülasyonların yerini aldı ya da onlarla iç içe geçti. [71]

        İlk Orta Doğulu çiftçilerin, esas olarak Kapsian kültüründen Kuzey Afrika etkilerine sahip oldukları öne sürülmüştür. [72] Ortadoğu'da bulunan bazı genetik soyların bu dönemde oraya geldiğine dair öneriler var. [73] Orta Doğu'daki ilk Tarım toplumlarının genellikle Filistin'de MÖ 12.000-10.000 arasında var olan Natufian Kültüründen ortaya çıktığı düşünülmektedir. Fas'tan Sina üzerinden İbero-Maurisliler tarafından Kuzey-Batı Afrika'dan önemli bir göç, Natufian'ın oluşumundan önce gerçekleşmiş gibi görünüyor. [74]

        2013 yılında, tarih öncesi Taforalt ve Afalou bölgelerinde kazılan Epipaleolitik Iberomaurus kültürünün yapımcılarına ait iskeletler, antik DNA için analiz edildi. Örneklerin tümü, ya Kuzey Afrika ya da kuzey ve güney Akdeniz kıyılarıyla ilişkili anne kuşaklarına aitti ve bu, Epipaleolitik'ten bu yana bu alanlar arasındaki gen akışını gösteriyor.[75] Eski Taforalt bireyleri, Y-DNA haplogrup E1b1b'yi ve mtDNA haplogrupları U6, H, JT ve V'yi taşıyordu, bu da bölgede Iberomaurus döneminden kalma nüfus sürekliliğine işaret ediyor. [76] [77]

        Fas Araplarının Genetik Berberi Mirası Sürekliliği

        Kuzey Afrika'da Berberi ve Arap örnekleri arasındaki kültürel farklılaşma, AMOVA analizlerinde ve MDS ve PC analizlerinde gösterildiği gibi, her iki grup arasındaki genetik farklılıkları yansıtmıyor gibi görünüyor. Kuzey Afrika'daki Araplar çoğunlukla Orta Doğu Araplarının torunlarıysa, Orta Doğu'da başka yerlerden çok daha yaygın olan N, U1, U3, U7 ve HV gibi haplogrupların frekansları, Kuzey Afrika Araplarında Berberilerden daha büyük olmalıdır. . Ancak bunun tam tersi gözlemleniyor: bu haplogruplar Kuzey Afrika Araplarında %5'e, Berberilerde %10'a varıyor.

        Kuzey Afrika Arapları ve Berberiler arasındaki farklılaşma eksikliği, klasik belirteçler (Bosch ve diğerleri 1997), otozomal STR'ler (Bosch ve diğerleri 2000), Alu yerleştirme polimorfizmleri (Comas ve diğerleri 2000) ve diğer genetik belirteçler kullanılarak da gözlemlenmiştir. Y kromozomu soyları Bu model, bölgenin Araplaştırılmasının, Arap genişlemesinin gerçekleştiği bölgede yaşayan Berberi popülasyonlarının demografik olarak değiştirilmesinden ziyade, esas olarak kültürel bir süreç olduğunu göstermektedir. [78]

        Faslı mitokondriyal havuz, yapısında esasen Berberidir ve "Batı Avrasya haplogruplarının genel olarak yüksek frekansı" ile karakterize edilir. %36 ila %60, bir şekilde daha düşük Sahra altı L soy sıklığı ve Kuzey Afrika haplogrupları U6 ve M1'in önemli (ancak farklı) varlığı". İberya'dan kaynaklanan maksimum buzul genişlemesi, yalnızca Avrupa'nın değil, aynı zamanda Kuzey Afrika'nın da yeniden yerleşimine yol açtı".[80]

        Avrasya mtDNA (anne) dizileri, Faslı Berberlerde %96, Cezayirli Berberlerde %82 ve Berberi olmayan Faslılarda %78, Senegalli bir popülasyonda sadece %4'lük bir frekansta tespit edildi. (Rando 1998 harvnb hatası: hedef yok: CITEREFRando1998 (yardım) )

        Yakın zamana kadar, bazı makaleler, Fas'taki ana L haplogruplarının dağılımının esas olarak Sahra-ötesi köle ticaretinden kaynaklandığını öne sürdü. [81] Ancak, Eylül 2010'da, Fregel tarafından Berberi mtDNA'sı hakkında kapsamlı bir çalışma. L haplogruplarının çoğunun çok daha eski olduğu ve yaklaşık 20.000 yıl önce eski bir Afrika gen akışı tarafından tanıtıldığı sonucuna vardı. [82]

        Faslı Kuzey ve Güney Berberileri, SSA mtDNA'sının yalnızca %3 ila %1'ine sahiptir, Sahra altı gen havuzuna katkıdaki bu kuzey-güney gradyanı, Esteban et al., [83] mtDNA soylarının geri kalanı için çoğunlukla Kafkas/Batı Avrasya kökenliyken, Faslı Araplar L-mtDNA dizileri aracılığıyla yaklaşık %21 ila %36 oranında daha yüksek SSA anne karışımına sahiptir, En yüksek L-mtDNA frekansları Faslı Araplara Bildirilmektedir Çevre Alanının El jadida %36 ve bu büyük ölçüde köle ticaretine atfediliyor. [84]

        L-mtDNA'nın frekansları (> %1)

        Ülke Etnik grup Test edilen sayı Referans L-mtDNA%
        Fas Faslı (Yahudiler) 149 Behar et al. (2008) 1.34%
        Fas Fas Kuzeyi (berberiler) 124 Esteban et al. (2004) 1%
        Fas Fas (Araplar) 81 Hariç et al. (2010) 36%
        Fas Fas Arapları 56 Turchi et al. (2009) 25.00%
        Fas Fas Güneyi (Berberiler) 64 Turchi et al. (2009) 26.00%

        Trombetta ve ark. (2011), V257'nin, her iki kanadın da Kuzey Batı Afrika Muhtemel Fas'tan Akdeniz üzerinden güneybatı Avrupa'ya göç etme belirtileri göstermesi bakımından kardeş bölümü E-V68 ile bir paralellik gösterdiğini hissetti. Örneklerinde Faslı Marakeş Berberi, Korsikalı, Sardunyalı, Güney İspanyol ve Kantabrialı E-V257 olan 6 "E-V257*" bireyi buldular.

        E-M35 içinde, iki haplogrup, E-V68 ve E-V257 arasında çarpıcı paralellikler vardır. Her ikisi de Kuzey Batı Afrika'da, özellikle Fas'ta (sırasıyla E-M78 ve E-M81) sıklıkla gözlenen bir soy ve çoğunlukla Güney Avrupa'da bulunan bir grup farklılaşmamış kromozom içerir. E-V68* ve E-V257*'nin E-M35 taşıyıcılarının Kuzey Afrika'daki genişlemesi, Fas ile Güney Avrupa arasında bir deniz yayılmasını daha makul bir hipotez haline getiriyor.

        Semino'dan bir araştırma (2004'te yayınlandı) Y kromozomu haplotipi E1b1b1b'nin (E-M81) Fas popülasyonlarına özgü olduğunu ve Avrupa'da İberya (İspanya ve Portekiz) ve Sicilya dışında neredeyse hiç bulunmadığını gösterdi.

        İber yarımadasının Y-kromozom analizi, buna göre haplogrup E1b1b1b'nin Güney İspanya'da %10'luk frekansları aştığını gösteriyor. Çalışma, hem tarihi hem de tarih öncesi zamanlarda Kuzey Afrika ve Orta Doğu'dan yalnızca çok sınırlı bir etkiye işaret ediyor. [85] Mikro uydu varyasyonunun yokluğu, İslami genişleme döneminde, yani Berberi popülasyonlarında, Akdeniz'deki tarihi değişimlerle tutarlı olarak Fas'tan çok yeni bir varış olduğunu düşündürmektedir. Portekiz ile sınırlı, Y kromozom soylarıyla ilgili bir çalışma, "mtDNA ve Y verileri, o bölgedeki Berberi varlığının MS 711'deki Mağribi genişlemesinden önce geldiğini gösteriyor. Verilerimiz, Sahra altının aksine erkek Berberilerin göçmenler, ülkede uzun süreli ve sürekli bir topluluk oluşturmuştur". [86]

        Karakteristik bir Fas haplotipi olan Haplotip V(p49/TaqI), İber yarımadasında da bulunabilir ve azalan bir Kuzey-Güney frekans çizgisi, Fas'tan İberya'ya doğru bir gen akışı oluşturur ve bu da yarımadadaki Mağribi varlığıyla tutarlıdır. . [87] Bu Kuzey-Güney haplotip V sıklığı, Akdeniz bölgesinde, güney Portekiz'de %30'a yakın frekanslardan güney Fransa'da yaklaşık %10'a kadar gözlenecektir. Benzer şekilde, İtalya'daki en yüksek frekans güneydeki Sicilya adasında (%28) bulunur. [88] [89]

        81 popülasyondan 6.501 alakasız Y-kromozom örneğinin kullanıldığı geniş kapsamlı bir çalışma (2007'de yayınlandı) şunları buldu: "Hem bu E-M78 alt haplogrupları (E-V12, E-V22, E-V65) hem de E-M81 Haplogroup, Fas soylarının İberia (Pasiegos hariç), kıta İtalyası ve Sicilya'nın tüm erkek gen havuzuna katkısı sırasıyla %5,6, %3,6 ve %6,6 olarak tahmin edilebilir." [89]

        Gaetano tarafından Sicilya hakkında bir çalışma ve diğerleri 2008, "Kuzeybatı Afrika Fas popülasyonlarında yaygın olarak yayılmış olan Hg E3b1b-M81'in Sicilya gen havuzuna %6 oranında katkıda bulunduğu tahmin edilmektedir." [90]

        "Çalışma, farklı soydan insanlar arasındaki dini dönüşümlerin ve müteakip evliliklerin hem İspanya'da, özellikle Balear Adaları'nda hem de Portekiz'de modern nüfus üzerinde önemli bir etkiye sahip olduğunu gösteriyor", [91]

        Avrupa'da, E-M81 her yerde bulunur, ancak çoğunlukla İber Yarımadası'nda bulunur, burada Avrupa'nın geri kalanından farklı olarak [Not 1] E-M78'den daha yaygındır ve ortalama sıklık %5 civarındadır. [57] [92] [93] [94] [95] Avrupa'da şimdiye kadar bulunan en yüksek frekanslar Cantabria'dan Pasiegos'ta gözlendi, %18 (8/45) [95] ila %41 ( 23/56). [49] İspanyol Kanarya Adaları'nda da ortalama %8,28 (54/652) sıklık bildirilmiştir ve en büyük üç ada Tenerife (%10,68), Gran Canaria (%11,54) ve Fuerteventura'da (%13,33) %10'un üzerindedir. %). [96]

        Latin Amerika üzerindeki genetik etkiler

        Latin Amerika'nın İspanyol ve Portekiz kolonizasyonunun bir sonucu olarak, E-M81 Latin Amerika'da [97] [98] [99] ve ABD'deki Latin Amerikalı erkekler arasında da bulunur. [100]

        Diğer bölgeler Düzenle

        Diğer ülkelerde, Faslı Berberi haplogrupları Mısır, Fransa, Sudan, Somali, Ürdün, Lübnan, Suudi Arabistan ve Sefarad Yahudileri arasında bulunabilir. [93]


        CRC klinik öncesi modeller

        İnsan kanser hücre dizileri, temel kanser araştırmalarında ve ilaç keşfinde yaygın olarak kullanılan in vitro model sistemlerdir. Dünya çapındaki farklı hücre hattı bankalarından 100'den fazla hücre hattı CRC hücre hatları olarak kaydedilmiştir. Bununla birlikte, bunlardan birkaçı primer tümörlerin mutasyonel ve transkripsiyonel heterojenliğini tamamen özetleyebilmektedir [28] ve CRC ve farmakogenomiklerin fonksiyonel biyolojik mekanizmalarını incelemek için ima edilmektedir. İfade ettikleri genlere dayanarak, CRC hücre hatları, çeşitli klinik özelliklere sahip altı benzersiz alt tipte sınıflandırılmıştır. Bu nedenle, uygun bir alt türün seçimi, çalışmaların kapsamı için kritik öneme sahiptir. Ayrıca, birincil CRC ile bu benzerliklere rağmen, birkaç pasajdan sonra yıllarca in vitro manipülasyon, hücre hatlarının orijinal tümörden ayrılmasına yol açar. Ayrıca, spesifik alt klonlar için zenginleştirme ile seri geçiş sırasında genetik, epigenetik ve transkriptomik değişikliklerle sonuçlanan yapay kültür koşulları, tümör mikro ortamının insan immün ve stromal bölmesi ile karmaşık ve sürekli etkileşimin olmaması, davranışı derinden etkiler. deneysel tekrarlanabilirlik ve klinik anlamlılık eksikliğine yol açan hücrelerin sayısı [29,30,31,32,33,34,35]. CRC'nin in vivo deneysel modelleri, in vitro sistemin sınırlarının üstesinden geldi ve kanser biyolojisi bilgimizi geliştirmemize ve yeni terapötik hedefler belirlememize izin verdi. 1990'ların başında, genetik olarak tasarlanmış fare modellerinin (GEMM'ler) nesli, beyinde anlamsız mutasyonlar taşıyordu. Apc FAP hastalarına benzer şekilde kendiliğinden çoklu bağırsak neoplazileri geliştiren gen [36], tümör gelişiminin erken evrelerinde yer alan moleküler yolakların anlaşılmasına büyük ölçüde katkıda bulunmuştur. Bununla birlikte, heterozigot mutasyon Apc gen (Apc Min/+ ) ince bağırsağın tümör lezyonlarını özetler, ancak büyük kolonu etkileyenleri değil, uygun olmayan bir sporadik kolon-rektal kanser modeline neden olur ve metastatik süreçleri incelemek için. Alternatifi olan transgenik fareler Apc mutasyonlar ve/veya diğer mutasyona uğramış baskılayıcılar veya onkogenler ile kombinasyonlar halinde, örneğin Ras, cdx2, Tgfb, Pten, Smad3, ve Braf büyük kolon ve rektumda da maligniteyi ve tümör gelişimini artırmalarına izin verilmiştir. Bununla birlikte, çoklu mutasyonlar taşıyan farelerde yaşam süresinin önemli ölçüde azalması, bu modellerin kullanımını sınırlamıştır [37, 38]. Apc Min/+ azoksimetan (AOM) gibi kanserojen bir madde ile tedavi edilen fareler, adenokarsinom lezyonlarının ilerlemesi ile kolondaki maligniteyi iyileştirir. Yine de, CRC modelinin karmaşıklığını ve sonuç olarak ilgili moleküler mekanizmaları arttırır. Alternatif bir fare modeli, kanserojen kaynaklı bir modeldir. Zamana ve doza özel bir yöntem olan dekstran sülfat sodyumun (DSS) siklik oral uygulaması ile birlikte tekrarlanan AOM enjeksiyonları, insan CRC'sinde meydana gelen anormal kript odakları-adenom-karsinom dizisini özetlemek için kullanılan en yaygın CRC modelidir. [39, 40]. Düşük maliyetler, yüksek tekrarlanabilirlik ve yüksek fizibilite, CRC başlatma ve ilerlemeyi incelemek için kimyasal olarak AOM/DSS modelinin kullanımını yaygınlaştırmıştır. GEMM'ler ve kanserojen kaynaklı modeller, temel kanser araştırmalarında ve ilaç keşfinde değerli bir araç olsa da, bir klinik araştırmanın birden çok yönünü yeniden üretemezler. Çeşitli bir diyet, yaşam tarzı ve insanları taklit eden eşit bir mikrobiyomun eksikliği, hastalığın başlangıcını ve seyrini büyük ölçüde etkileyebilir. Ayrıca, farenin tümör gelişimini sınırlayan kısa yaşam süresi ve kendi içinde yetiştirilmiş farelerdeki zayıf genetik heterojenite nedeniyle tümörler arası heterojenliğin olmaması, sonuçların coşkusunu potansiyel klinik çevirilerini sınırlar.


        4. EPİDEMİYOLOJİ: VEKTÖR-KONAK VE VEKTÖR-PARAZİT ETKİLEŞİMLERİ

        [Ayrıca bakınız 28: hayır. 13298, 13299, 13309, 13316, 13330, 13334]

        13319 Aksoy, S. & Rio, R.V.M., 2005. Çoklu genomlar arasındaki etkileşimler: çeçe, ortakyaşarları ve tripanozomlar. Böcek Biyokimyası ve Moleküler Biyoloji , 35 (7): 691&ndash698.

        Aksoy: Yale Üniversitesi Tıp Fakültesi, Epidemiyoloji ve Halk Sağlığı Anabilim Dalı, 60 College St., 606 LEPH, New Haven, CT 06510, ABD.

        Böcek kaynaklı hastalıklar yüksek bir halk sağlığı yüküne neden olur ve hayvancılık ve tarım üzerinde yıkıcı bir etkiye sahiptir. Bugüne kadar, kontrolün son derece zor olduğu kanıtlanmıştır. Sahra altı Afrika'yı rahatsız eden böyle bir hastalığa protozoan Afrika tripanozomları neden olur (tripanozom spp.) ve çeçe sinekleri tarafından bulaşır. Bu sunum, çeçe sineğinin biyolojisini ve onun simbiyontlarının yanı sıra tripanozomlarla olan etkileşimlerini açıklamaktadır. Tsetse, iki enterik dahil olmak üzere üç farklı mikrobiyal ortakyaşar barındırabilir (Wigglesworthia glossinidia ve gazoz glossinidius) hem de fakültatif Wolbachia Konak fizyolojisini etkileyen enfeksiyonlar. Zorunlu ortakyaşamın genomu üzerine son araştırmalar Wigglesworthia çeçe konak türleri ile uzun birlikte evrimsel geçmişinin göstergesi olan özellikleri ortaya çıkarmıştır. Kommensal benzerinin karşılaştırmalı analizi gazoz serbest yaşayan enteriklerle, simbiyotik bir yaşam tarzına geçiş sürecinde genomik uyarlama olaylarını yansıtan ev sahibi çevreye (fizyoloji ve ekoloji) adaptasyon örnekleri sağlar. Uygulamalı bir bakış açısıyla, ortakyaşarların genomik ve gelişimsel biyolojileri hakkında biriken kapsamlı bilgi ve bu mikroplardaki yabancı genleri ifade etme yeteneğimizle birleşir. laboratuvar ortamında ve çeçe orta bağırsaklarını bu tasarlanmış mikroplarla yeniden doldurmak, şimdi hastalık yönetimi için yeni bir araç vaat eden vektör yeterliliğine katkıda bulunan konakçı fizyolojik özelliklere müdahale etmek için bir araç sağlıyor.

        13320 Dagnogo, M., Traore, G. & Souleymane, F., 2004. Fildişi Sahili Daloa'da çeçe sineklerinin tripanosom enfeksiyon oranlarından uyku hastalığı bulaşma risk alanlarının belirlenmesi. Uluslararası Tropikal Böcek Bilimi Dergisi , 24 (2): 170&ndash176.

        Dagnogo: Université d'Abobo Adjamé, UFR SN, 02 BP 801 Abidjan 02, Côte d'Ivoire.

        Fildişi Sahili'ndeki Daloa ormanlık alanında dört yıl boyunca çeçe'deki tripanozom enfeksiyonu oranını ve dolayısıyla tripanozomiyaz enfeksiyon riskini değerlendirmek için bir çalışma yapıldı. Kayıtsız Glossina biyotoplar, 18 908 Glossina palpalis palpalis Vavoua tuzakları ile yakalandı ve diseke edildi. En yaygın tripanozom türleri Glossina NS tripanosoma kongolense (yüzde 7,63) ardından T. vivax (yüzde 4,50). tripanosoma brucei , hayvan ve insan Afrika tripanosomiasisinden (HAT) sorumlu tripanozom, toplanan çeçe sineklerinin sadece 34'ünde bulundu ve çok düşük bir enfeksiyon oranına sahipti (yüzde 0.18). İncelenen tüm habitatlarda enfekte çeçe sinekleri yakalanmasına rağmen, enfeksiyon oranı patikalarda (yüzde 0,44), çiftliklerde (yüzde 0,20) ve ormanlık su kaynakları çevresinde (yüzde 0,27) köy kenarlarına (yüzde 0,06) ve orman sınırları (yüzde 0.05). Enfekte 34 çe sineği arasında brucei , yalnızca yüzde 0,05'inde yalnızca tükürük bezlerinde parazit vardı. Sonuçlarımız, patikaların, kahve ve kakao tarlalarının ve ormanlık su kaynaklarının enfeksiyon riskinin bulunduğu potansiyel biyotoplar olduğunu göstermektedir. brucei en önemlisidir. antropofili Glossina Bu bölgelerdeki nispeten yüksek sayıda parazitle ilişkili olarak, hastalığın bugün Daloa'da endemik olmasının nedeni olabilir. Çalışmamızda, kadın Glossina Erkeklere göre (yüzde 0,04) tripanozomlarla (yüzde 0.14) daha sık enfekte olmuşlardı ve genellikle dişiler erkeklerden daha uzun yaşıyordu. Parazit taşıyan dişilerin ömrünün uzun olması, bu bölgede HAT'ın endemik olmasının başlıca nedeni olabilir.

        13321 Malele, I., Craske, L., Knight, C., Ferris, V., Njiru, Z., Hamilton, P., Lehane, S., Lehane, M. & Gibson, W., 2003. Tanzanya'da yabani çeçe sineklerinin tripanozom enfeksiyonlarını PCR ile tanımlamak için spesifik ve jenerik primerlerin kullanımı. Enfeksiyon, Genetik ve Evrim , 3 (4): 271&ndash279.

        Gibson: Biyolojik Bilimler Okulu, Bristol Üniversitesi, Bristol BS8 1UG, Birleşik Krallık

        Tropikal Afrika'da insan ve hayvan tripanozomiyazının epidemiyolojisinde tripanozom türlerinin ve alt türlerinin doğru tanımlanması zorlu bir görev olmaya devam etmektedir. Şu anda, Afrika çeçesi ile bulaşan tripanozomların yaklaşık on farklı türü, alt türü veya alt grubunu tanımlamak için spesifik PCR testleri bulunmaktadır. Bu PCR testleri burada dört çeçe türündeki tripanozomları tanımlamak için kullanılmıştır (Glossina brevipalpis , G. pallidipes , G. swynnertoni , G. morsitans morsitans) Tanzanya'nın iki bölgesinden. Türe özgü primerler kullanılarak PCR, 1 041 diseksiyon pozitif probosit üzerinde gerçekleştirildi ve 254'te (yüzde 24) genel bir pozitif tanımlama verdi. Bunların 61'i (yüzde 24) iki veya daha fazla tripanozom içeriyordu. Her iki saha bölgesinde de en büyük genel prevalansa sahip tripanozom, tripanosoma simia Toplam 118 enfekte çeçe hortumunda tespit edilen Tsavo (yüzde 46). Pangani'de, T. godfreyi bulundu G. pallidipes ama içinde değil G. brevipalpis , bu sineklerin bu tripanozoma karşı farklı duyarlılığa sahip olabileceğini veya farklı bir dizi konakla beslenebileceğini öne sürüyor. Tripanozom enfeksiyonlarının yüksek bir oranı (yaklaşık yüzde 75) tanımlanamadı. Bu tanımlanamayan örneklerin kimliğini araştırmak için, genin değişken bölümlerini büyütmek için tripanozomal küçük alt birim ribozomal RNA (ssu rRNA) genlerinin korunmuş bölgelerine tamamlayıcı primerler kullandık. Amplifiye DNA fragmanları klonlandı, dizilendi ve bilinen tripanozom türlerinin veri tabanındaki ssu rRNA genleri ile karşılaştırıldı. Bu şekilde, geçici olarak iki yeni tripanozom tanımladık: tripanosoma canlısı ve ilgili bir tripanozom T. godfreyi . NS T. godfreyi-ilgili tripanozom Tanzanya saha örneklerinde sıklıkla meydana geldi ve yaygın olduğu görülüyor. Bu iki yeni tripanozomun moleküler tanımlanması artık izolasyonlarını ve tam biyolojik karakterizasyonlarını kolaylaştırmalıdır.

        13322 de la Rocque, S., 2003.Épidémiologie des trypanosomoses africaines. Dönüşümü analiz et ve prévision du risque dans des paysages. [Afrika tripanozomlarının epidemiyolojisi. Değişen peyzajlarda risk analizi ve tahmini]. Courrier de l'Environnement de l'INRA , 49: 80&ndash86.

        de la Rocque: CIRAD, BP 5035, 34032 Montpellier cedex 1, Fransa. [[e-posta  korumalı]]

        1996 yılında Burkino Faso, Sideradougou'da tripanozomiyaz üzerine yapılan çalışmalar sırasında iki tür çeçe ele geçirildi, Glossina tachinoides ve G. palpalis gambiensis . Otlatma alanları, hastalık için potansiyel bulaşma alanları, çevresel dinamikler ve sağlık riskleri referans alınarak bu tarımsal-pastoral alanın epidemiyolojisi hakkında notlar alınmıştır.

        13323 Schukken, Y.H., van Schaik, G., McDermott, J.J., Rowlands, G.J., Nagda, S.M., Mulatu, W. & d'Ieteren, G.D.M., 2004. Sığırlarda yeni ve kalıcı tripanozom enfeksiyonları için risk faktörlerini değerlendirmek için geçiş modelleri - Güneybatı Etiyopya'daki Ghibe Vadisi'nden uzunlamasına verilerin analizi. Parazitoloji Dergisi , 90 (6): 1279&ndash1287.

        Schukken: Nüfus Tıbbı ve Teşhis Bilimleri Bölümü, S3119 Schurmann Salonu, Veterinerlik Fakültesi, Cornell Üniversitesi, Ithaca, NY 14853, ABD. [[e-posta  korumalı]]

        Bu çalışmanın amacı, hem olay hem de kalıcı tripanozom enfeksiyonları ile ilişkili faktörleri ayırt etmek için geçiş modellerini uygulamaktı. 1 561 sığırdan toplanan veriler, hem tripanozom enfeksiyonlarının (toplam 56 931 sığır örnekleme ayı) hem de çeçe (Glossina spp.) tehdidi, Mart 1986'dan Mart 1998'e kadar aylık olarak izlendi. Hem dökme hem de insektisit hedefli çeçe kontrol programları ve çeçe kontrolünden önce diminazen aseturate ile toplu tedavi, tripanozom enfeksiyonunun hem insidansında hem de kalıcılığında kontrolsüzlere göre önemli düşüşlerle ilişkilendirildi. dönemler, mevsimsel ve cinsiyet etkileri gibi. Bununla birlikte, etkilerin büyüklükleri, yeni ve kalıcı enfeksiyonlar için genellikle farklıydı. Enfeksiyonun kalıcılığı için iki eğilim vardı. Genel olarak, diminazen aseturate ile düzenli tedaviye rağmen, çalışma sırasında enfeksiyon süresi arttı. Geçiş modelinin iki büyük faydası vardı. Birincisi, artan enfeksiyon riskiyle ilişkili diğer faktörleri hesaba katarak, zamanla artan enfeksiyon süresini belirlemekti. İkincisi, belirli faktörlerin yeni ve kalıcı tripanozom enfeksiyonları üzerindeki etkilerindeki farklı kalıpları vurgulamaktı.

        13324 Van den Bossche, P., Ky-Zerbo, A., Brandt, J., Marcotty, T., Geerts, S. & De Deken, R., 2005. geçirgenliği tripanosoma brucei sığırlarda gelişimi sırasında. Tropikal Tıp ve Uluslararası Sağlık , 10 (9): 833&ndash839.

        Van den Bossche: Veterinerlik Departmanı, Tropikal Tıp Enstitüsü, Nationalestraat 155, B-2000 Antwerp, Belçika. [[email protected] itg.be]

        Son salgınlar Trypanosoma brucei rhodesiense Uganda'nın doğusundaki Soroti Bölgesi'ndeki uyku hastalığı, sığırların bu parazitin rezervuarı olarak oynayabileceği önemli rolü göstermiştir. Sığır rezervuarının epidemiyolojik önemini açıklığa kavuşturmak için, ne kadar kolay olduğunu belirlemek için deneyler yapıldı. brucei Friesian sığırlarında gelişimi sırasında bulaşır. Geliştirilmesi brucei sığırlarda yüksek düzeyde parazitemi ve PCV'de bir düşüş ile akut bir faz ile karakterizedir. Akut fazı, PCV'nin düşük fakat stabil kaldığı ve paraziteminin düşük olduğu kronik bir faz takip eder. Parazitleri, bu kronik evrede parazitolojik tanı araçlarını kullanarak tespit etmek genellikle zordur. Kronik olarak enfekte olmuş sığırların mücadelesi T. kongolense ani bir artışa neden olur. brucei parazitemi. Parazitemideki önemli farklılıklara rağmen, enfekte sığırlar üzerinde ilk kan yemekten sonra metasiklik enfeksiyonlar geliştiren çe sineklerinin oranı, akut ve kronik fazlar veya karma evre arasında önemli ölçüde farklılık göstermedi. T.b. brucei /T. kongolense enfeksiyon. Bu, gözlem süresi boyunca paraziteminin, üzerinde çeçe enfeksiyon oranlarının parazitemiden bağımsız olduğu eşiğin üzerinde olduğunu göstermektedir. Epidemiyoloji, yayılma ve kontrolün anlaşılması için araştırma bulgularının yansımaları T.b. rhodesiense uyku hastalığı tartışılır.


        İnsan rotavirüs suşlarının genetik çeşitliliği ve zoonotik potansiyeli, 2003–2006, Macaristan †

        Bu sunumdaki bulgular ve sonuçlar yazarlara aittir ve Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinin görüşlerini yansıtmayabilir.

        Soyut

        Rotavirüs suşları üzerindeki etkisini değerlendirmek için birçok ülkede yeni ruhsatlı aşıların piyasaya sürülmesinden önce ve sonra rotavirüs suş sürveyansı yapılmaktadır. Burada, Macaristan'ın Budapeşte bölgesinde (2003–2006) RNA profil analizine, multipleks PCR ile genotiplemeye ve nükleotit dizilimine dayanan bir suş gözetim çalışmasını tanımlıyoruz. 1.983 G tipi rotavirüs arasında G1 (%22), G2 (%4.8), G3 (%3.5), G4 (%18.5), G6 (%1.1), G8 (<0.1%, n=1), G9 (%42) ve G12 (%3.4) özgüllükleri. P genotip insidansı ile ilgili bilgiler, bir numune alt kümesi için belirlendi (n = 814). Küresel olarak önemli suşlara ek olarak, örneğin P[9],G3 P[14],G6 veya P[14],G8 gibi çeşitli yaygın olmayan antijen kombinasyonları da bulundu. Yaygın olmayan antijen kombinasyonlarına sahip seçilmiş suşların VP7, VP4, VP6 ve NSP4 genlerinin sekans ve filogenetik analizi, sırasıyla belirli sığır, domuz, kedi, at ve lapin rotavirüsleri ile yüksek benzerlik göstermiştir. Hayvan rotavirüslerinin insan hastalıklarındaki rolünü değerlendirmek için sürekli gözetim gereklidir. J. Med. Virol. 81:362–370, 2009. © 2008 Wiley-Liss, Inc.


        Ex vivo genişletilmiş insan dolaşımdaki Vδ1 γδT hücreleri, kolon kanseri için uygun terapötik potansiyel sergiler

        Gamma delta T (γδT) hücreleri, kanser hücrelerine karşı güçlü, MHC ile sınırsız sitotoksisiteye sahip doğuştan gelen lenfositlerdir ve çeşitli maligniteler için evlat edinen hücresel immünoterapide umut verici bir umut gösterir. Bununla birlikte, çoğu katı tümör için benimsenen immünoterapide yaygın olarak kullanılan Vγ9Vδ2 γδT (Vδ2 T) hücrelerinin klinik sonucu sınırlıdır. Burada, insan periferik kanından (PB) taze izole edilmiş Vδ1 γδT (Vδ1 T) hücrelerinin, yapışık ve küre oluşturan insan kolon kanseri hücrelerine karşı Vδ2 T hücrelerinden daha güçlü sitotoksisite sergilediğini gösteriyoruz. laboratuvar ortamında. Ayrıca, hem sağlıklı donörlerin hem de kolon kanseri hastalarının PB'sinden izole edilen Vδ1 T hücrelerini tercihli olarak genişletmek için optimize edilmiş bir protokol geliştiriyoruz. laboratuvar ortamında fitohemagglutinin (PHA) ve interlökin-7 (IL-7) ile kısa süreli kültür. Genişletilmiş Vδ1 T hücreleri, hücreden hücreye temasa bağlı bir şekilde yapışık ve küre oluşturan kolon kanseri hücrelerine karşı gelişmiş sitolitik etkiye sahip sitotoksisite ile ilgili molekülleri, kemokin reseptörlerini ve sitokinleri yüksek oranda eksprese etti. Ek olarak, PHA ve IL-7 genişletilmiş Vδ1 T hücreleri, kısmen bir IL-2 sinyal yolu aracılığıyla çoğalma ve hayatta kalma avantajı gösterdi. Üstelik, ex vivo genişletilmiş Vδ1 T hücreleri ayrıca tümör büyümesini kısıtladı ve insan kolon karsinomu ksenograflı farelerin tümör yüklü hayatta kalma süresini uzattı. Bulgularımız, PHA ve IL-7 tarafından genişletilen insan PB Vδ1 T hücrelerinin, kolon kanseri gibi insan katı tümörleri için antikanser evlat edinen immünoterapi için umut verici bir aday olduğunu göstermektedir.

        Anahtar Kelimeler: Antijenler, Ags CCSC'leri, kolon kanseri kök hücreleri FACS, flüoresans aktive hücre sınıflandırma FCM, akış sitometrisi γδT hücreleri, gama delta T hücreleri IL-7, interlökin-7 MACS, manyetik aktive hücre ayırma PB, periferik kan PHA, fitohemagglutinin PBMC'leri, periferik kan mononükleer hücreler Vδ2 T hücreleri, Vγ9Vδ2 γδT hücreleri Vδ1 T hücreleri, Vδ1 γδT hücreleri Zol, Zoledronat. evlat edinen hücresel immünoterapi sitotoksisite insan PB Vδ1 T hücreleri insan PB Vδ2 T hücreleri insan kolon kanseri.


        29.5: İnsan Evrimi - Biyoloji

        C2005/F2401 '07 Ders 20 -- Mayoz, Yaşam Döngüleri ve Genetiğe Giriş

        Telif Hakkı 2007 Deborah Mowshowitz ve Lawrence Chasin Biyolojik Bilimler Bölümü Columbia Üniversitesi New York, NY.

        Son güncelleme 18.11.2007 11:05 AM . Bildiriler: 20A ( Süper çevrim ve Ayrılmama. ) Ayrıca 19A & amp B'ye ihtiyaç duyar.

        1. Karyotiplerin Toplanması -- Kromozom Bantlama ve Amp Yeniden Düzenlemeleri

        A. Normal bir kabak veya karyotipte ne görüyorsunuz?

        1. Kromozom sayısını, boyutunu ve şeklini görebilir (santromerin konumu ile belirlenir) ve her bir kromozom için bantlama teknikleri ile her bir kromozomu tanımlayabilir. (Bantlama = kromozomları standart boyalarla boyama prosedürü, farklı boyalar farklı koyu ve açık bölgeler desenleri verir. Her bant = tek bir gen değil, 100'lerce gen bloğu.)

        2. Her türün standart bir karyotipi vardır sabit sayıda kromozom ile Türler arasındaki ilişkileri değerlendirmek ve daha sonra tartışacağımız belirli anormallikleri tespit etmek için benzerlikleri ve farklılıkları kullanabilirsiniz. Tüm vücut (somatik) hücrelerinde ve her nesilde aynı sayı.

        3. Bir (normal) karyotipin önemli genel özellikleri -- 'N' ve 'ploidi' geçen sefer açıklandı.

        a. Tanım: Homologlar = her türün tüm kromozomları. Cinsiyet kromozomları dışında, homologlar aynı boyuta, bant düzenine ve sentromer (şekil) konumuna sahiptir.

        B. Sayı: Diploid hücrelerde her kromozom türünden 2 homolog = 2 bulunur. Biri anneden biri babadan.

        C. Genlerin homolog alelleri üzerindeki ilişkisi. Homologlar (cinsiyet kromozomları hariç) homolog DNA taşırlar. Aynı genleri, aynı sırada, karşılık gelen yerlerde (loci) taşırlar, ancak mutlaka aynı genleri taşımazlar. versiyon (alel) her bir genin.

        Örneğin, göz rengi geni her iki homologda da aynı yerdedir, ancak belirli bir kromozom üzerindeki "göz rengi geni" mavi belirleyici versiyon veya kahverengi belirleyici versiyon olabilir. Bir genin her alternatif versiyonuna alel denir. Her homolog, göz rengi geninin bir alelini taşır. Homologlar aynı genleri taşır, ancak mutlaka aynı alelleri taşımaz.

        Başka bir örnek: Hemoglobinin beta zinciri için olan geni düşünün -- beta zinciri geni her zaman aynı konumdadır, ancak kromozom Hb konumunda (lokus) Hb A veya Hb S alelini (versiyon) taşıyabilir.

        NS. Kardeş kromatitler ve homologlar: Kardeş kromatitler = ikiye katlanmış bir kromozomun 2 yarısı. Neden özdeşler? Çünkü yarı muhafazakar bir DNA replikasyonunun iki ürününü içerirler. homologlar gerek yok özdeş -- her biri farklı bir kaynaktan geldi (farklı bir ebeveyn). Önemli: homologlar (homolog kromozomlar) ve kardeş kromatitler arasındaki farkı bildiğinizden emin olun. Sorun 8-8, Kısım A'ya bakın.

        5. İnsan karyotipleri -- cinsiyet kromozomları ve amp otozomları. Gerçek bir insan karyotipi için Sadava 9.15 (9.13)'e bakın. Daha birçok örnek internette bulunabilir. (Geniş bir ürün yelpazesi için Google'daki görselleri deneyin.) Kendiniz için bir karyotip yapmayı denemek istiyorsanız, http://bluehawk.monmouth.edu/ adresine gidin.

        İnsan hücreleri üzerinde karyotipler yaparsanız, kalıbın erkeklerden ve kadınlardan farklı olduğunu şu şekilde keşfedeceksiniz:

        Her iki cinsiyette de cinsiyetten bağımsız olarak aynı görünen 22 çift kromozom vardır, ancak 23. çift her iki cinsiyette de aynı değildir. Dişilerde 23. çift birbirine benzeyen 2 büyük kromozomdan oluşur. Erkeklerde 23. çift, mayoz bölünme sırasında birbirine benzemeyen ancak çift gibi davranan büyük ve küçük bir kromozomdan oluşur. Her iki cinsiyette de aynı olan 22 çift kromozoma otozom denir. Kalan çifte cinsiyet kromozomu, büyük olana X kromozomu, küçüğüne ise Y kromozomu denir. Yani dişiler XX ve erkekler XY'dir.

        B. Anormal bir karyotipte ne görebilirsiniz?

        1. 'Kromozomal' Mutasyonlar ve 'gen' mutasyonları.

        a. Bantlama yapabildiğiniz için tüm kromozomları ve kromozom bölgelerini birbirinden ayırabilirsiniz. Bu nedenle, karyotiplere bakarak tüm kromozomları ve/veya büyük gen bloklarını (sözde ) etkileyen büyük anormallikleri tespit edebilirsiniz. Bu anormalliklerin çoğu, bilinen genetik koşullarla – hastalıklar ve/veya bunlara eğilimlerle – ilişkilidir.

        B. Bir karyotipte görülebilen büyük değişiklikler "kromozomal" mutasyonlar olarak bilinir. Karyotiplerde sadece çok sayıda gen içeren (bazlar değil kilobazlar) büyük bölümlerdeki değişiklikler görülebilir.

        C. Bir karyotipte görülemeyecek kadar küçük olan değişikliklere genellikle "gen mutasyonları" denir. Birkaç bazın, hatta birkaç genin değişiklikleri. yapamam bir karyotipte saptanabilir. Bir kromozomdaki her bir bandın yüzlerce gen içeren büyük bir blok olduğunu unutmayın.

        a. Yeniden düzenlemeler. Fazla, eksik ve yeniden düzenlenmiş parçaları alabilirsiniz. (Yeterince büyükse, kayıp, eklemeler, inversiyonlar veya yer değiştirmeler görülebilir.) Diğer yöntemler kullanılarak daha küçük değişiklikler tespit edilmelidir.

        B. anöploidi. Geçen sefer açıklandığı gibi eksik veya fazla kromozom vakalarını görebilirsiniz. Anöploid fetüslerin çoğu kendiliğinden abort yapar, ancak birkaçı doğuma kadar hayatta kalır.

        (1). Trizomi 21. Hayatın erken dönemlerinde düzenli olarak ölümcül olmayan tek otozomal anöploidi, trizomi 21 veya Down sendromudur. (22. kromozom daha küçük görünebilir, ancak 21 en az genetik bilgi içeren otozomdur.) 21. kromozom için trizomik olan bireylerde, genellikle önemli zeka geriliği, ayırt edici yüz özellikleri ve erken yaşta Alzheimer geliştirme eğilimi ile sonuçlanan çoklu gelişim sorunları vardır. nispeten erken bir yaş. (Alzheimer vakalarında beyni tıkayan proteini kodlayan gen 21. kromozom üzerindedir.) Tüm bu anormalliklerin bir "gen dozajı" etkisinden kaynaklandığı düşünülmektedir. Tüm gen kopyaları normaldir, ancak trizomik kromozom 21 üzerinde 2 yerine 3 gen kopyasına sahiptir. Genlerin ekstra kopyaları ekstra protein üretir (2 yerine toplam 3 doz için). Ekstra protein miktarı, gelişimi bozan şeydir.

        (2). Cinsiyet kromozomlarının anöploidi. En az bir X olduğu sürece bu genellikle ölümcül değildir.

        a. Örnekler XXY, XO (O, 2. cinsiyet kromozomu yok anlamına gelir), XYY, XXX vb. Kişiler bilinmektedir. XO olan insanlar dişidir, ancak Turner sendromu adı verilen belirli anormallikleri vardır. XXY olan insanlar erkektir ve Klinefelter sendromuna sahiptir.

        B. Erkekliği ne belirler? Y'nin varlığı mı yoksa ikinci bir X'in yokluğu mu? Yukarıda açıklanan aneuploid bireylerin cinsiyeti, insanlarda erkek belirleyici faktör olanın ikinci X'in yokluğu değil, Y'nin varlığı olduğunu gösterir. İnsan Y kromozomunun çok az geni vardır, ancak bir kritik geni vardır. (Sry) erkek gelişimine yol açan bir dizi olayı tetikleyen varsayılan kadındır. (Meyve sineklerinde durum farklıdır: XO sinekleri erkek ve XXY sinekleri dişidir. Sineklerde cinsiyeti belirleyen X'lerin otozomlara oranıdır.)

        C. XO ve XXY neden hayatta kalıyor? Neden fazladan ve/veya eksik bir X, az çok normal bir varoluşla uyumluyken, eksik veya fazladan bir otozom neredeyse her zaman ölümcüldür? X'lerin sayısındaki çeşitlilik "normal" olduğu için -- dişilerde erkeklerin iki katı vardır, ancak hem erkekler hem de dişiler "normaldir". Dolayısıyla, "ekstra" X'lerle (veya bakış açınıza bağlı olarak eksik X'lerle) başa çıkmak için bir mekanizma olmalıdır. ). Aşağıya bakınız.

        NS. Bilginize: İkincil Cinsiyet Özellikleri . X ve Y üzerindeki genlerin çoğunun ikincil cinsiyet özellikleriyle (sakal büyümesi, meme gelişimi) hiçbir ilgisi yoktur) ikincil cinsiyet özellikleri için çoğu gen otozomaldir (bazıları X üzerinde olmasına rağmen). Y'nin varlığı, hangi hormonların yapıldığını ve dolayısıyla hangi otozomal (ve X bağlantılı) genlerin açık olduğunu belirler. Hormonları dışarıdan eklerseniz, her iki cinsiyet de diğerinin ikincil cinsiyet özelliklerini geliştirebilir. Ayrıca not var numara Alışılmadık cinsiyet kromozom kombinasyonları ile cinsel tercihler arasındaki ilişki.

        e. Kuşlar ve arılar. Cinsiyet belirleme mekanizması, diğer birçok organizmada benzerdir, çünkü bir cinsiyetin eşleşen bir kromozom çifti (homometik cinsiyet) ve diğerinin eşleşmeyen bir çifti (heterogametik cinsiyet) vardır. Hangisi ve dengenin cinsiyeti nasıl belirlediğinin ince noktaları değişir. Cinsiyet oranı (erkek/dişi) tüm bu durumlarda yaklaşık 1:1'dir çünkü heterogametik cinsiyet, erkek belirleyici ve dişi belirleyici gametleri eşit oranlarda üretir.

        Kuşlarda erkek değil dişi heterogametik cinsiyettir. Arılarda, bir cinsiyet diploid ve diğeri haploiddir - cinsiyet, kromozom dengesi tarafından belirlenir ilkesinin tüm kromozom setine bir uzantısıdır. Bu yüzden 'sana kuşlardan ve arılardan bahsedeceklerini' söylediklerinde, insan cinsiyetini açıklamanın iyi bir yolu değil!

        Anöploidiler nasıl oluşur? Aşağıya bakınız. Mitoz ve karyotipleri incelemek için problemi deneyin 8-8 kısım A-D ve amp G .

        II. Mayoza Genel Bakış

        1. Mayoz bölünme/indirgeme bölünmesi ihtiyacı -- karyotip ve ploidiyi nesilden nesile sabit tutmak için.

        Çoğu yüksek organizmanın hücrelerinin çoğu diploiddir. Örneğin, insanların neredeyse tüm hücrelerinde 46 kromozom veya 23 çift vardır. Yumurta ve spermde de 46 kromozom varsa, bir yumurta ve bir spermin birleşmesinden oluşan bir sonraki nesil 92 kromozoma sahip olacaktır. Ama açıkçası # kromozomu her nesli ikiye katlamıyor. Yani yumurta ve sperm diğer tüm hücrelerden farklı olarak sadece 23 kromozoma sahip olmalı ve haploid olmalıdır. Yani diploid hücrelerden haploid hücreler yapmanın bir yolu olmalı. Vardır ve sürece mayoz denir. Mayoz bölünme sırasında her birinden bir kromozom çift rastgele seçilir, böylece ortaya çıkan haploid 23 çift yerine 23 kromozoma sahip olur. Daha sonra, bu tür 2 haploid, döllenme sırasında size 23 çiftli bir diploid vermek için birleşir.

        2. Bütün bunlarla neden uğraşasınız ki? Neden seks?

        Ne de olsa, bir sonraki nesle her iki ebeveynden de tam bir diploid hücre ile başlayabilir ve kendinizi bir sürü sorundan kurtarabilirsiniz! Bazı organizmalar, en azından bazı zamanlar bu şekilde çoğalır, ancak çoğu organizma cinsel üreme ile meşgul olur. Muhtemelen bunu yapıyorlar çünkü her mayoz döngüsü, ardından füzyon, yeni bir kromozom kombinasyonuna izin veriyor. (Mayozda meydana gelen çaprazlama, kromozomlar içinde yeni gen kombinasyonlarına da izin verir.) Dolayısıyla, cinsel üreme, genetik materyalin yeniden karıştırılmasına izin verdiği için faydalıdır (bakterilerle aynı argüman). Yeni bir çeşitlilik sağlamak (seçimin uygulanacağı seçim için) ve/veya hasarlı kopyaların onarılması (& değiştirilmesi) için yeniden karıştırma gereklidir.

        3. Yer değiştirme nasıl çalışır?

        a. Kromozomların Yeniden Karıştırılması.
        Bir kişinin 1 numaralı kromozomun 2 özdeş kopyasına ve 2 numaralı kromozomun 2 özdeş kopyasına sahip olduğunu varsayalım. (Bu kromozomları bir renge çizin, diyelim pembe.) Başka bir kişi, kromozom 1'in birbiriyle aynı ancak birinci kişideki kopyalardan farklı 2 kopyasına sahiptir ve benzer şekilde 2 numaralı kromozom için. (Bu kromozomları başka bir renge çizin, diyelim beyaz.) Bu iki insanın yavruları "pembe" ve "beyaz kromozomların bir karışımına sahip olacak. Birkaç nesil sonra, akla gelebilecek tüm "pembe" ve "beyaz" kromozom kombinasyonlarını elde etmek mümkün olacaktır. (Bkz. problem 8-4 kısım A ve B.)

        B. Yeniden karıştırma genleri:
        Tüm kromozomların yeniden karıştırılmasına ek olarak, kromozomların eşdeğer parçaları yeniden karıştırılabilir veya değiştirilebilir. Homolog kromozomlar eşleşir ve mayoz bölünme sırasında çapraz geçiş yaparak eşdeğer bölümleri değiştirebilir. (Bu, bakterilere transformasyon, transdüksiyon vb. sırasında olanlara eşdeğerdir, ancak ökaryotlarda süreç mayoz bölünmenin profaz I'i ile sınırlıdır.) Bkz. Sadava 9.17 ve 9.18 (9.15 ve 9.16) veya Becker şek 20-17 (18-). 17). Not: "Genetik rekombinasyon" terimi genellikle genlerin çaprazlama yoluyla yeniden karıştırılması anlamına gelir. Bazen, çaprazlama dahil olsun veya olmasın her türlü yeniden karıştırma (genlerin ve/veya kromozomların) anlamında daha kapsamlı bir anlamda kullanılır.

        B. Mayoz sırasında kromozomlara ne olur? -- bkz. Bildiri 19B ve aşağıdaki resim.

        1. DNA sentezi, bölünmeden önce gerçekleşir. Mayoz bölünmeden önce mitozda olduğu gibi DNA kopyalanması gelir. Mayozdan (veya mitozdan) önceki S sırasında hücre, kromozom başına DNA içeriğini ve kromatit sayısını iki katına çıkarır. Böylece hücre, çift kromozom çiftleriyle başlar = her kromozomun 4 kopyası.

        2. Ürünler: Her biri diploid (mitozdan) 2 ürün yerine, her biri haploid (mayozdan) 4 ürün vardır. Her kromozomun kopya sayısını 4'ten bire kesmek için bir değil 2 bölünme gerekir.

        3. Mayoz bölünmenin iki bölümü: Mayoz bölünmenin birinci bölümü homologları ayırır, mayoz bölünmenin ikinci bölümü kardeş kromatitleri ayırır.

        4. N, c ve kromatit/kromozom sayısına ne olur? Birinci bölme, hücre başına kromozom sayısını 2N'den N'ye yarı yarıya keser ve hücre başına DNA içeriğini 4c'den 2c'ye kadar yarıya indirir ("quotc" aşağıda tanımlanmıştır). İkinci bölme, hücre başına DNA içeriğini (2c'den c'ye) yarıya, kromatit/kromozom sayısını (2'den 1'e) ve hücre başına toplam kromatid sayısını (2N'den N'ye) yarıya indirir. Bir çift kromozomlu bir hücrede neler olur:

        Yukarıdaki resim gösterir tüm hücreler her aşamada -- DNA sentezinden önce, S'den sonra, 1. bölmeden sonra ve 2. bölmeden sonra. Bkz. Becker şek. 2 çift kromozomlu bir hücrede benzer bir mayoz diyagramı için 20-3 (18-3).

        El Notu 19B, yukarıda gösterilen aşamaların farklı bir görünümünü göstermektedir. 'Kromozom döngüsünü' - kromozomların sayısını, kromatitlerin sayısını ve DNA içeriğini vurgular. hücre başına her aşamada. Bir kromozom çifti (N = 1), 3 çift (N = 3) ve herhangi bir genel N değeri olan hücreler için kromozom döngüsünü özetler.

        "quotc", kromozom veya kromatit sayısı değil, hücre başına DNA içeriğinin bir ölçüsüdür.

        c = bir organizmanın haploid hücresi başına minimum DNA içeriği = S'den önce haploid hücrenin DNA içeriği (kopyalanmamış kromozomlarla) = bir kromatit setinin DNA içeriği. C, N'ye eşit DEĞİLDİR DNA içeriği N kromozomlu (bir kromatit/kromozomlu).

        Mayoz bölünmeyi (şimdiye kadar) gözden geçirmek ve Mitoz ile karşılaştırmak için, 8-1, 8-2 (A'dan E'ye bölümler), 8-3 ve 8-8 (A-D ve G bölümleri) problemlerini yapın (veya bitirin).


        III. Mayozun Mekanizması -- bkz. çalışma 19A.

        A. Adımlar : Bunlar, 19A'daki broşürde ayrıntılı olarak gösterilmiştir ve mitozla karşılaştırmalar burada özetlenmiştir. Mitoz ve mayoz bölünmenin benzer diyagramları için Sadava 9.19 (9.17) veya Becker şek. 20-9 (18-9). Daha güzel resimler için Sadava 9.16 (9.14) veya Becker 20-5 & 20-6 (18-5 & 18-6) bakın.

        B. N >1 ise ne olur? Handout 19A, 1 çift kromozomlu bir hücreye ne olacağını gösterir. (2N hücre, N=1.) Ek kromozom çiftleri (N > 1) varsa, her çift metafaz I'de bağımsız olarak sıralanacaktır. Bunun daha sonra tartışılacağı gibi önemli genetik etkileri vardır.

        C. Profaz I -- Mitozdan Bazı Farklılıklar

        1. Karşıdan karşıya geçmek. Bu, bir çiftin 2 üyesi arasında kromozomların eşdeğer bölümlerini değiştiren bir "kes & amp rejoin" mekanizması ile rekombinasyonun gerçekleştiği zamandır. Rekombinasyon eşleştirmeyi gerektirir, bu nedenle homolog kromozomlar pro'da eşleştirilir. Mayozun I ama mitozun değil. Daha fazla detay takip edilecek. (Eşleştirme resimleri metinlerde gösterilmiştir.)

        Not: Çaprazlama (rekombinasyon), çift sarmallı DNA moleküllerinin kesilmesini ve yeniden birleştirilmesini içerir mRNA üretimi (birleştirme), tek sarmallı RNA moleküllerinin kesilmesini ve yeniden birleştirilmesini içerir.

        2. Süre. Mayozdaki Profaz I, genellikle mitozdaki profazdan çok daha uzun ve daha karmaşıktır. (Her iki metin de profazı erken, orta ve geç alt aşamalara ayırıyor Becker 20-7 (18-7) merak ediyorsanız daha fazla ayrıntıya sahip.) Pro. Çok uzun olabilirim - insan dişilerinde, doğumdan önce yumurtanın dökülmesine kadar sürer. Bu çok uzun profesyonelin sonuçları. Aşağıda tartışıldım.

        D. İnsan mayoz bölünme ürünleri (bkz. Sadava 42.3 (43.3) veya Becker şekil 20-10 [18-10])

        1. Kadınlarda: Dişi germ hücreleri mayoz bölünmeden geçtiğinde, 4 haploid çekirdeğin eşdeğeri oluşur, ancak sadece bir tanesi bir yumurtada biter. "Diğer 3" çekirdekte sona erecek olan genetik materyal bir kenara itilir - polar cisimler adı verilen küçük yapılar oluşturur. Yumurta (en azından) 4 mayotik ürün için yeterli olacak sitoplazma miktarını ve sadece bir tanesinin genetik bilgisini içerir.

        2. Erkeklerde: Erkek germ hücreleri mayoz bölünmeye uğradığında 4 sperm oluşur.


        IV. Yaşam döngüsü - Mayoz ve mitoz nasıl birleşir? Veya 1 çok hücreli organizma nasıl 2 verir? Ya da daha iyisi, eşeyli üreme yapan organizmalar için 2 (ebeveyn) nasıl 1 (yavru) verir?

        A. Supercycle -- Handout 20B.

        1. Genel fikir -- Genel Bakış

        Mayoz ve/veya füzyonu takip eden mitotik bölünmelerin sayısına bağlı olarak birçok farklı yaşam döngüsü mümkündür. "Süperdöngü" etiketli çalışma kağıdı 20'nin üst kısmındaki diyagram, genelleştirilmiş bir yaşam döngüsünü gösterir ve terminolojiyi açıklar. (Sadava 9.14 (9.12) veya 28.4 (29.2), Becker şek. 20-4 [18-4] ile eşdeğerdir.) Bir organizma gösterilen tüm aşamalardan geçiyorsa, o zaman hem haploid hem de diploid fazlara sahiptir.

        2. Haploid ve Diploid Yaşam Döngüleri

        a. Diploid Yaşam Döngüsü . Mayoz → gamet olursa ne elde edersiniz. Bir organizma, süper döngü diyagramının sol yarısındaki aşamaların çoğunu atlayabilir ve doğrudan germ hücrelerinden gametlere gidebilir. Böyle bir organizma, insanlarda olduğu gibi temelde diploid bir yaşam döngüsüne sahiptir. Bkz. Becker, şek. 20-4 (d) [18-4 (d)].

        B. Haploid Yaşam Döngüsü. Zigot, mitozla değil mayozla hemen bölünürse ne elde edersiniz. Bir organizma, zigot mitozla değil de mayoz bölünmeyle hemen bölünürse, diyagramın sağ yarısının çoğunu atlayabilir. Böyle bir organizma temelde haploid bir yaşam döngüsüne sahiptir. Bazı basit algler böyledir. Bkz. Becker şek. 20-4 (b) [18-4 (b)].

        3. Nesiller Değişimi Bitkilerde yaygın olan herhangi bir aşamayı atlamazsanız ne elde edersiniz.

        • Çoğu bitki, hem haploidlerin hem de diploidlerin mitotik bölünmeleri ile hem haploid hem de diploid fazlardan geçer. Ancak haploid faz o kadar kısadır (çok az mitotik bölünme içerir), organizmanın haploid formu genellikle çıplak gözle görülmez.
        • Her iki faz da görülebilir. Yosun gibi daha basit bitkilerden birkaçı, çıplak gözle görülebilen hem haploid hem de diploid formlar üretir. Sadava 28.3 ve 28.5 (29.5 ve 29.9) ve/veya Becker şek. 20-4 (c) [18-4 (c)]. Hem sporofiti (bitkinin spor taşıyan formu) hem de gametofiti (bitkinin gamet taşıyan formu) görebilirsiniz.
        • Yosun için yeşil bulanık madde haploiddir ve gamet üretir, bu nedenle gametofit = gamet taşıyan bitki olarak adlandırılır. İki gamet, yeşil matın üzerinde kahverengi sapları (diploid) üretmek için mitozla bölünen bir zigot oluşturmak üzere birleşir. Sapın bazı hücreleri, spor üretmek için mayoz bölünmeden geçer (sapın sonundaki kapsülün içinde), bu nedenle sapa sporofit = spor taşıyan bitki denir.

        4. Gametler ve Sporlar -- Terminoloji

        • Gamet elde etmenin iki yolu - 2N'nin mayozu veya N hücrelerinin uzmanlaşması. Yosun, haploid hücrelerin uzmanlaşmasıyla gamet üretir, insanlar diploidlerin mayozuyla gamet üretir.
        • Mayoz bölünme ürünleri sporlar veya gametler olabilir. Yosunlarda mayoz ürünlerine gamet değil spor denir, çünkü mayotik ürünler mitozla bölünecektir (gamet yapmak için uzmanlaşmadan önce). İnsanlarda mayoz bölünme ürünlerine gamet denir.
        • Gametlere karşı sporlar: Mayotik ürünler asla mitoz bölünmeyecek, ancak bir zigot oluşturmak için birleşecekse, bunlara gamet denir. Mayotik ürünler mitozla bölünecekse, bunlara spor denir.

        5. Süper döngü haploid veya diploid yaşam döngüsüne indirgenebilir

        a. Diploid Yaşam Döngüsü . Mayoz → gamet ise. Haploidlerde mitotik bölünme yoktur. Spor yok.

        B. Haploid Yaşam Döngüsü. Eğer zigot → ise hemen mayoz bölünme. (Mayosis → sporları, gamet değil.) Diploidlerde mitotik bölünme yok. Germ hücresi yok.


        B. Bu döngünün bazı sonuçları:

        1. Kalkınma Sorunu. Eğer zigot bizi mitozla #8594 ise geliştirme nasıl çalışır? Tüm hücreler aynı DNA'ya sahipse, hücreler neden farklı proteinler üretiyor? Başka bir deyişle, genler neden farklı hücre tiplerinde farklı şekilde 'ifade edilir'? Anahtarları ne ayarlar ve korur? Diferansiyel gen ekspresyonunun nasıl kurulduğu ve sürdürüldüğü tam olarak anlaşılmamıştır, ancak bir sonraki dönemde biraz daha tartışılacaktır.

        2. Adli tıp. Erişkinlerin hemen hemen tüm hücreleri aynı DNA'ya sahiptir. Bu nedenle, bir şüpheliden alınan DNA ile suç mahallinde bulunan DNA'yı karşılaştırabilirsiniz. DNA'nın hangi tür hücrelerden geldiği önemli değildir - saç, tükürük, kan, sperm vb.

        3. Amniyosentez. Fetüsün tüm hücreleri aynı genlere/DNA'ya/kromozomlara sahipse, ilgili gen yalnızca belirli özel dokuları etkilese (içinde proteinler üretse) bile, herhangi bir fetal hücrenin DNA'sını veya kromozomlarını anormallikleri aramak için test edebilirsiniz. Yeterince ciddi engelleri olan bir fetüs tespit ederseniz, tedavi amaçlı düşük yapma seçeneğiniz vardır. Fetal hücreleri test etmenin birkaç mevcut yolu vardır ve daha fazla yol geliştirilme aşamasındadır. En yaygın güncel yöntem amniyosentezdir (amniyotik sıvıdan fetal hücrelerin test edilmesi). Bazı örnekler: bunlar sınıfta tartışılmayacaktır, ancak bilginize dahil edilmiştir.

        a. Gen Mutasyonları. Bir veya birkaç geni ve/veya nükleotidi etkileyen daha küçük değişiklikler ("gen" mutasyonları olarak adlandırılır) için DNA dizisine (PCR, prob kullanımı vb. ile) bakabilirsiniz. Bazen aşağıdaki (1) numaralı durumda olduğu gibi genin yaptığı proteine ​​bakabilirsiniz, ancak bazen (2) numaralı durumda olduğu gibi DNA'ya bakmanız gerekir. Bazı örnekler:

        (1). Tay-Sachs hastalığı. Tay-Sachs hastalığına neden olan gen (mutant olduğunda) bir enzimi kodlar. Enzim, amniyotik sıvıdaki hücreler de dahil olmak üzere birçok hücre tipinde yapılır. Amniyotik sıvı hücrelerini kullanarak DNA'ya bakabilir veya genden yapılan proteinin enzimatik aktivitesini ölçebilirsiniz.

        (2). PKU. Fenilketonüriye veya PKU'ya (mutant olduğunda) neden olan gen, yalnızca karaciğer hücrelerinde yapılan bir enzimi (PAH) kodlar. Yani amniyotik sıvı hücrelerini kullanarak enzimin aktivitesini ölçemezsiniz. Ancak genin normal mi yoksa mutant mı olduğunu görmek için genin durumunu (amniyotik sıvı hücrelerinde) test edebilirsiniz.

        B. Kromozom Mutasyonları. Bantlama yapabildiğiniz için tüm kromozomları ve kromozom bölgelerini birbirinden ayırabilirsiniz. Bu nedenle, daha önce tartışıldığı gibi karyotiplere bakarak tüm kromozomları ve/veya büyük gen bloklarını ("kromozomal" mutasyonlar olarak adlandırılır) etkileyen büyük anormallikleri tespit edebilirsiniz.

        Yaşam döngülerini, hücre döngüsünü vb. ve bunların nasıl birbirine uyduğunu gözden geçirmek için 8-11 ve/veya 8-14'ü deneyin.


        V. Ayrılmama -- bkz. alt kısım 20B.

        A. Eksik ve fazla kromozomları olan bireyler nereden geliyor?

        Cevap: Mayoz bölünmede hatalar. İki tür hata:

        • Homologlar, birinci bölmede (= 1. bölme. ayrılmama) düzgün bir şekilde ayrılmayabilir ("ayrılmada" başarısız olabilir) veya
        • Kardeş kromatitler ikinci bölmede (= 2. bölme ND) düzgün bir şekilde ayrılmayabilir.

        Her iki durumda da ayrılmama, gametlere fazladan ve/veya eksik kromozomlar (anöploidi) verir. Sayfanın alt yarısındaki 20B notuna bakın. Bir ebeveynden gelen bir anöploid gamet (= eksik veya fazla kromozomlu gamet), başka bir ebeveynden normal bir gametle karşılaştığında, monozomik veya trizomik bir zigot oluşur. Zigot, anöploid bir birey üretmek için mitozla bölünebilir. Eksik veya fazla otozomlar içeren anöploid zigotlar genellikle canlı bireylere dönüşmezler, ancak eksik veya fazla cinsiyet kromozomları (XO, XXY, XXX vb.) içeren anöploid zigotlar, en az bir X olduğu sürece genellikle yaşayabilir. (Neden bu? ? Aşağıya bakınız.)

        El notu 20B'de: İkinci bölüm ND'nin "düz" veya "kıvrımlı" kromatitleri içerebileceğini unutmayın, ancak yalnızca bir durum gösterilmektedir. Ayrıca, "boş" hücrenin gerçekten boş olmadığına dikkat edin - yalnızca ND'ye dahil olan çiftten bir kromozom eksik. Diğer tüm kromozomlara sahiptir, ancak resmi mümkün olduğunca basit tutmaları gösterilmemiştir. ND, genellikle bir seferde yalnızca bir olayı etkileyen bir hatadır - bir çift kromatit veya bir çift homolog, mayoz bölünmenin bir aşamasında ayrılamaz. genellikle kromozomların ve kromatitlerin diğer tüm ayrımları genellikle normal şekilde ilerler. Bkz. Sadava 9.20 (9.18).

        B. Ne tür anöploidi yaygındır? Ayrıntılar için yukarıya bakın.

        2. Cinsiyet kromozomlarının anöploidi.

        Ayrışmayı gözden geçirmek için 8-8E ve 8-9'u deneyin.


        VI. İnaktif X'ler ve Barr cisimleri - Neden fazla veya eksik X'ler genellikle tolere edilir ve fazla veya eksik otozomlar neden kabul edilmez?

        A. Lyon Hipotezi = aktif olmayan X Hipotezi

        Fazladan X'lerin genetik olarak atıl olduğu fikrine Lyon hipotezi (veya aktif olmayan X hipotezi) denir. Lyon hipotezine göre, her dişi bir mozaiktir, çünkü hücrelerinden bazıları anne X'ini protein yapmak için, bazıları ise baba X'ini kullanır.

        Bir Barr gövdesi oluşturduğundan, interfaz sırasında etkin olmayan X'i gerçekten görebilirsiniz. Her dişi hücrede 2 adet X kromozomu vardır, ancak (inaktif X hipotezine göre) çoğu zaman sadece 1 tanesi çalışır (yazıya aktarılır). Genel olarak, fazladan X kromozomu varsa, hücre erkek veya dişi olsun, tüm ekstralar inaktiftir. İnaktif X'ler, interfaz sırasında sıkıca sarılmış halde kalır ve Barr cisimleri olarak adlandırılır. (Yani karyotip yapmadan hücrenin cinsiyetini söyleyebilirsiniz.) Aktif olmayan X kromozomlarının kopyalandığını ancak kopyalanmadığını unutmayın.

        C. Mozaik nasıl tespit edilir? Giriş Genetik Terminolojiye

        Kedilerde kürk rengini düşünün. Lyon, etkin olmayan X'in var olduğunu bu şekilde anladı. Kedilerde, tüy rengini kontrol eden bir gen X üzerindedir. Genin pozisyonu olarak bilinir. bengöz atmak genin. Bu genin iki aleller(alternatif formlar) biri → siyah kaplama rengi ve diğeri → turuncu. Alellerden biri, her X'te kaplama rengi lokusunda bulunur. Y kromozomu, kaplama rengi geninin bir alelini taşımaz.
        Erkeklerde ya siyah ya da turuncu aleli taşıyan yalnızca bir X vardır, bu nedenle normal erkek kedilerin hepsi siyah ya da tamamen turuncudur. (Siyah veya turuncu üzerine bindirilmiş düzenli çizgileri olabilir, ancak arka plan rengi ya tamamen siyah ya da tamamen turuncudur - turuncu alanları ve siyah alanları yoktur).
        Dişilerin iki X'i vardır, bu nedenle kaplama rengi geninin iki alelini taşırlar - her X'te bir tane. homozigot siyah (2 siyah alel var), homozigotturuncu (2 turuncu alel var) veya heterozigot (her rengin bir aleline sahip olun), şekilde gösterildiği gibi. Dişiler turuncu, siyah veya yamalı olabilir (her rengin alanları ile). Sadece heterozigot dişiler yamalı.
        Tüm bunlar, her bir yamada X'in yalnızca bir kopyası çalışıyorsa anlamlıdır, bu nedenle hücre başına (ve yama başına) kaplama rengi geninin yalnızca bir kopyası çalışır. Nadir görülen yamalı erkekler XXY'dir (Klinefelter's Kats).

        Not "Yamalı", tekir patiska = yamalı artı beyaz değil, kaplumbağa kabuğu olarak adlandırılır. (Tekir = hem erkeklerde hem de kadınlarda görülen düzenli çizgi deseni.)

        D. Barr cisimleri ne zaman oluşur? Mozaik nasıl elde edilir?

        Döllenmiş yumurta (zigot) → hücre yumağı → her hücre rastgele bir X'i inaktive eder → her hücre aynı X açık/kapalı → torunları ile bölünür. Bir X inaktive edildiğinde, genellikle birbirini izleyen mitozlar yoluyla inaktive olarak kalır, bu nedenle tek bir hücrenin tüm mitotik torunları aynı X'e ve aynı X'e sahiptir → bir alandaki (veya aynı soydaki) tüm hücreler aynı X'e sahiptir. /kapalı.

        Germ hattı hücreleri (mayoz bölünmeden geçecek), gamet oluşmadan önce, mayoz bölünmeden önce her iki X'i de açar. Böylece iki X kromozomundan biri bir sonraki nesilde kullanılabilir veya inaktive edilebilir.

        Şimdiye kadar Genetik Terminolojiyi gözden geçirmek için 8R-1'i deneyin. (Ayrıca bkz. Becker şek. 20-2 [18-2].)

        Bir dahaki sefere: Turuncu ve siyah renk nasıl miras alınır? Ve genotip fenotipi nasıl belirler?

        Telif Hakkı 2007 Deborah Mowshowitz ve Lawrence Chasin Biyolojik Bilimler Bölümü Columbia Üniversitesi New York, NY.


        Yöntemler

        Vektör yapımı ve hücre hattı üretimi

        SRSF2 (veya U2AF1) cDNA-FLAG-P2A-mCherry içeren bir ek, lentiviral vektör pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE (Addgene plazmit 12252) içine klonlandı. SRSF2 veya U2AF1'deki mutasyonlar daha sonra bölgeye yönelik mutajenez ile yaratıldı. Bu plazmitler, psPAX2 (Addgene plazmit 12260) ve zarf vektörü pMD2.G (Addgene plazmit 12259) ile 293T hücrelerine birlikte transfekte edildi. Lentivirüs, transfeksiyondan 48 saat sonra süpernatandan toplandı. Stabil hücre hatları, 2.5 (U2AF1) veya 5 (SRSF2) enfeksiyon çokluğunda K562 hücrelerinin lentivirüs ile dönüştürülmesiyle yapılmıştır. Hücreler genişletildi ve mCherry + hücreleri, floresanla aktive olan hücre sınıflandırması ile toplandı. K562 hücreleri, %10 fetal sığır serumu ile takviye edilmiş Iscove modifiye Dulbecco ortamında kültürlendi.

        Western blotlama

        Protein lizatları, radyoimmünopresipitasyon deneyi (RIPA) tamponu içinde yeniden süspanse edilerek K562 hücrelerinden özütlendi. Otuz mikrogram protein daha sonra sodyum dodesil sülfat-poliakrilamid jel elektroforezi için yüklendi ve bir nitroselüloz membrana aktarıldı. Proteinler şu antikorlarla araştırıldı: anti-U2AF1 (A302-080A Bethyl Laboratories), anti-SRSF2 (04-1550 MilliporeSigma), anti-FLAG (MA1-91878 Thermo Fisher Scientific) ve anti-Histone H3 (ab179 Abcam1) .

        RNA-seq kitaplığı hazırlama ve analizi

        Toplam RNA, K562 hücrelerinden veya hasta materyallerinden, TRIzol reaktifi (Thermo Fisher Scientific) kullanılarak izole edildi. Dört mikrogram (K562) veya 500 ng (hasta materyali) toplam RNA, TruSeq RNA Kitaplık Hazırlık Kiti v2 (Illumina) ile poli(A)-seçilmiş, sarmalsız kitaplıklar yapmak için kullanıldı. Saflaştırılmış kitaplıklar Illumina Hi-Seq 2000'de 2 x 50-bp okumalarla dizildi.

        RNA-seq okuma eşlemesinden sonra, izoform ekspresyon seviyeleri daha önce tarif edildiği gibi tahmin edildi. 23 Aksi belirtilmedikçe, bir ekleme olayı, izoform oranında en az %10'luk bir değişiklik ve en az 5'lik bir Bayes Faktörü sergiliyorsa, diferansiyel olarak eklenmiş olarak sınıflandırılmıştır. örnekler arasında. Analizin tam açıklaması şu adreste bulunan ek Yöntemlerde bulunabilir: Kan İnternet sitesi.

        Birincil insan örnekleri

        Çalışmalar Memorial Sloan Kettering Kanser Merkezi (MSK Kurumsal İnceleme Kurulu protokolü 06-107 kapsamında MSK) ve Hôpital Saint-Louis Kurumsal İnceleme Kurulları tarafından onaylandı ve Helsinki Bildirgesi protokolüne uygun olarak yürütüldü. Tüm katılımcılardan yazılı bilgilendirilmiş onam alındı. Hasta örnekleri MSK'nın Hematolojik Onkoloji Doku Bankası ve Hôpital Saint-Louis tarafından anonimleştirildi. mutasyon analizi SRSF2 ve U2AF1 MSK Heme-PACT tahlili 33 (MSK'den numuneler için) kullanılarak hedeflenen dizileme ile kemik iliği mononükleer hücrelerinden genomik DNA üzerinde yapıldı.

        Veri kullanılabilirliği

        Bu çalışmanın bir parçası olarak oluşturulan RNA-seq verileri, Gene Expression Omnibus'ta (erişim numarası GSE135732) saklandı. Daha önce yayınlanmış veriler, GSE65349, 20 GSE114922, 34 GSE66917 ve GSE67039 erişim numaraları altında Gene Expression Omnibus'tan indirilmiştir. 35 TCGA verisi CGHub'dan indirildi. 36,37


        Soyut

        Sistoskopi, insan mesane kanserinin (BC) klinik teşhisi için altın standart olarak kabul edilir. Sistoskopi pahalı ve invaziv olduğundan, hastaların uyumunu tehlikeye atabilir ve bazı hastalarda tekrarlayan BC'yi saptamadaki başarısızlığı açıklayabilir. Bu yazıda, insan BC tanısında üriner metabonomiklerin rolünü araştırdık. 24 BC hastasının ve 51 BC olmayan kontrolün üriner metabolik profili için gaz kromatografisi/uçuş süresi kütle spektrometrisi uygulandı. Elde edilen veriler, çok değişkenli temel bileşen analizi ve ardından ortogonal kısmi en küçük kareler diskriminant analizi (OPLS-DA) kullanılarak analiz edildi. Model geçerliliği, permütasyon testleri ve alıcı işletim özelliği (ROC) analizi kullanılarak doğrulandı. BC hastaları, global üriner metabolik profillerine (OPLS-DA, 4 gizli değişken, R 2 X = 0.420, R 2 Y = 0.912 ve Q 2 (kümülatif) = 0.245 ROC AUC 0.90) dayalı olarak BC olmayan deneklerden açıkça ayırt edildi 15 belirteç metabolitleri). İdrar sitolojisi ile elde edilen %33 duyarlılığa karşın, üriner metabonomik kullanılarak BC'yi saptamada yüzde yüz duyarlılık gözlemlendi. Ek olarak, üriner metabonomik, mesane tümörlerinin evrelenmesi ve derecelendirilmesinde potansiyel sergilemiştir. Özetle, üriner metabonomik insan BC'sinin noninvaziv teşhisi için uygundur.


        Videoyu izle: Evrim Teorisini Tek Soruyla Çürüten Adam (Ağustos 2022).