Bilgi

23: Fonksiyonel Genomik - Biyoloji

23: Fonksiyonel Genomik - Biyoloji


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

23: Fonksiyonel Genomik

Fonksiyonel Genomik Platformu

IBM Functional Genomics Platform (eski adıyla OMXWare), mikrobiyal genomlardan çıkarılan 300 milyonun üzerinde biyolojik dizi için genotipi fenotipe bağlayan ilişkisel bir veritabanıdır. Bu bulut tabanlı platform, NCBI GenBank, Sequence Read Archive (SRA) ve diğer kaynaklardan gelen yüz binlerce genomla sürekli olarak güncellenir. Ham bakteri dizisi veri kümeleri, tüm bakteri genomlarını oluşturan kalite için kendi kendine tutarlı bir şekilde birleştirilir ve düzenlenir. Birleştirilmiş genomların eksiksiz koleksiyonuna, içerdikleri her gen ve proteini tanımlamak için açıklama eklenir. Başka bir bulut süreci kümesi, her bir protein içindeki tüm etki alanlarını keşfeder. Protein alanları, mikroorganizmanın biyolojik aktivitesini sağlayan biyokimyanın temel nesneleridir. Fonksiyon geliştirirler ve içinde bulundukları daha büyük protein zincirinden bağımsız olarak var olabilirler. Bunlara ayrıca moleküler işlevlerini, hücresel bileşenlerini ve ilişkili oldukları biyolojik süreçleri temsil eden standart kodlar atanır. Bu biyolojik varlıkların tümü daha sonra Fonksiyonel Genomik Platformunda bağlantılıdır. Genomları protein alanlarına bağlamak, biyolojide fenotipi anlamanın anahtarıdır. IBM Functional Genomics Platform, araştırmacıların bu geniş veri havuzunu uygun ölçekte analiz etmelerine yardımcı olmak için REST Services, Python SDK ve bir Docker kapsayıcısından oluşan bir geliştirici araç takımı sağlar. Bu araç seti ayrıca geliştiricilerin platformla kendi bilgi işlem ortamlarında etkileşim kurmasına ve mevcut iş akışlarıyla entegre olmasına olanak tanır. Mikrobiyomdaki biyolojik işlevi açıklama, antimikrobiyal direnci (AMR) tahmin etme, sağlık müdahaleleri için moleküler hedefler geliştirme veya mikrobiyal yaşam hakkındaki temel bilgimizi genişletme hizmetleri de dahil olmak üzere, İşlevsel Genomik Platformunun üzerine önemli uygulamalar oluşturulabilir.

Bugün IBM Functional Genomics Platform, yaklaşık 220.000 yüksek kaliteli bakteriyel ve viral genoma, 64 milyon benzersiz gene, 50 milyon benzersiz proteine ​​ve 220 milyondan fazla benzersiz protein etki alanına sahiptir. Bu veri havuzu ayrıca coğrafya, gıda kaynağı (gıda kaynaklı izolatlar için), AMR tahlil verileri vb. dahil olmak üzere genel meta verileri içerir. Yeni genomlar otomatik olarak algılanıp halka açık kaynaklardan indirildikçe bu veriler büyüyor.


Arka plan

Doğal lif ve yağlı tohum bitkisi olarak pamuk (gosipiyum spp.) günlük yaşamda ve endüstriyel malzemede önemli bir rol oynar. Ek olarak, şu anda yetiştirilen pamukların poliploidisi ve atalara ait diploid donör türleriyle yakın ilişkisi, onu poliploidizasyon çalışmaları için mükemmel bir model organizma yapar. Bu iki yön, moleküler üreme ve evrimsel çalışmalarla uğraşan araştırmacılar için gen bilgi kaynakları sağlayan entegre bir genomik veri tabanı talebiyle sonuçlandı.

gibi diğer model organizmalarla karşılaştırıldığında Arabidopsis thaliana, pilav (Oryza sativa) ve mısır (zea mayası), pamuk türlerinin genom dizileri çok daha sonra serbest bırakıldı. için ilk pamuk genom derlemesi G.raimondii, ekili poliploid pamuğun D-alt genomunu bağışlayan diploid bir tür, 2012 yılında iki bağımsız grup tarafından piyasaya sürüldü [1, 2]. Diğer üç önemli pamuk türünün genomları, G. arboreum (diploit), G. hirsutum ve G. barbadense (her ikisi de poliploid), son iki yılda piyasaya sürüldü [3,4,5,6,7] (Ayrıntılar için incelemeye [8] bakın). Muhtemelen bu oldukça geç başlangıç ​​nedeniyle, pamuk genomiği hakkındaki bilgiler, popüler genel bitki dizisi veri tabanlarında kolaylıkla mevcut değildir. Dahil edilen 58 genel tesis veri tabanı arasında Nükleik Asitler Araştırması Moleküler Biyoloji Veritabanı Koleksiyonu [9], sadece yedi tanesi pamuk genlerinin bilgilerini içerir. Ayrıca, bunlardan altı tanesi yalnızca tek bir diploid tür için veri içerir, G.raimondii..

Genel tesis veri tabanlarına ek olarak, pamuk için özel olarak tasarlanmış üç veri tabanı da bulunmaktadır. CottonGen [10] pamuk genom dizilerini, genetik belirteçleri ve üreme germplazmı erişimlerini toplar. GraP [11] bir G. raimondii-gen fonksiyonel açıklama ve ekspresyon verileri için özel veritabanı. ccNet [12] diploid'den ortak ifade ağlarını görüntüler G. arboreum ve poliploit G. hirsutum. Bu veri tabanları pamuk genomu ve -omik veri analizindeki birçok boşluğu doldururken, bu veritabanlarının merkezi olmayan dağılımı, pratik araştırma çalışmaları sırasında bu bilgilere erişmeyi karmaşık bir görev haline getiriyor. Araştırmacıların, birden çok veri türünden çeşitli veri türlerine hazır erişime ihtiyacı vardır. gosipiyum genetik, genomik, fonksiyonel açıklamalar, transkriptomik ve dizi varyasyon verileri ile ilgili bilgiler dahil olmak üzere türler. Bu nedenle, IC4R pirinç veritabanına [13] benzer entegre bir fonksiyonel genomik veritabanı, kolay kullanım için mevcut pamuk genomik verilerini sistematik olarak bir araya getirmek için gereklidir.

Burada, pamuk için entegre bir fonksiyonel genomik veri tabanı olan CottonFGD'yi geliştirdik. CottonFGD'nin dikkate değer üç özelliği vardır: kapsamlılık, bütünlük ve kullanıcı dostu olma. İlk olarak, mevcut tüm pamuk genomlarını ve genetik belirteç açıklamaları, yapısal açıklamalar, fonksiyonel açıklamalar, RNA-seq ifadesi veri setleri ve popülasyon yeniden sıralama verileri dahil olmak üzere çeşitli genetik ve -omik verilerini kapsar. İkincisi, CottonFGD, gen aramayı, veritabanları arası referanslamayı ve gen listesi analizini kolay ve doğal bir şekilde entegre eder. Son olarak CottonFGD, kullanıcı arayüzünü her tür cihaz aracılığıyla erişilebilir hale getiren modern görselleştirme araçlarını kullanır. CottonFGD'nin pamuk fonksiyonel genomiği ve ıslah araştırma topluluğu için temel veri tabanı olarak ortaya çıkacağını umuyoruz.


DNA dizileme nedir?

Sıralama basitçe bir DNA dizisindeki bazların tam sırasını belirlemek anlamına gelir. Bazlar çiftler halinde var olduğundan ve çiftteki bazlardan birinin kimliği çiftin diğer üyesini belirlediğinden, araştırmacıların çiftin her iki tabanını da rapor etmesi gerekmez.

Sentez yoluyla dizileme olarak adlandırılan günümüzde kullanılan en yaygın dizileme türünde, DNA polimeraz (hücrelerde DNA'yı sentezleyen enzim), ilgilenilen bir diziden yeni bir DNA dizisi oluşturmak için kullanılır. Sıralama reaksiyonunda, enzim, bir flüoresan etiketle kimyasal olarak etiketlenmiş ayrı ayrı nükleotidleri yeni DNA zincirine dahil eder. Bu gerçekleşirken, nükleotid bir ışık kaynağı tarafından uyarılır ve bir floresan sinyali yayılır ve saptanır. Sinyal, dört nükleotitten hangisinin dahil edildiğine bağlı olarak farklıdır. Bu yöntem, art arda 125 nükleotitlik 'okuma' ve bir seferde milyarlarca okuma üretebilir.

Bir gen gibi büyük bir DNA parçasındaki tüm bazların dizisini bir araya getirmek için araştırmacıların örtüşen segment dizisini okuması gerekir. Bu, bir şekilde doğrusal bir yapbozun bir araya getirilmesi gibi, daha uzun dizinin daha kısa parçalardan birleştirilmesine izin verir. Bu süreçte, doğruluğu sağlamak için her bazın yalnızca bir kez değil, örtüşen segmentlerde en az birkaç kez okunması gerekir.

Araştırmacılar, bir hastalığın gelişiminde veya ilerlemesinde rol oynayabilecek genetik varyasyonları ve/veya mutasyonları araştırmak için DNA dizilimini kullanabilir. Hastalığa neden olan değişiklik, tek bir baz çiftinin ikamesi, silinmesi veya eklenmesi kadar küçük veya binlerce bazın silinmesi kadar büyük olabilir.

Sıralama basitçe bir DNA dizisindeki bazların tam sırasını belirlemek anlamına gelir. Bazlar çiftler halinde var olduğundan ve çiftteki bazlardan birinin kimliği çiftin diğer üyesini belirlediğinden, araştırmacıların çiftin her iki tabanını da rapor etmesi gerekmez.

Sentez yoluyla dizileme olarak adlandırılan günümüzde kullanılan en yaygın dizileme türünde, DNA polimeraz (hücrelerde DNA'yı sentezleyen enzim), ilgilenilen bir diziden yeni bir DNA dizisi oluşturmak için kullanılır. Sıralama reaksiyonunda, enzim, bir flüoresan etiketle kimyasal olarak etiketlenmiş ayrı ayrı nükleotidleri yeni DNA zincirine dahil eder. Bu gerçekleşirken, nükleotid bir ışık kaynağı tarafından uyarılır ve bir floresan sinyali yayılır ve saptanır. Sinyal, dört nükleotitten hangisinin dahil edildiğine bağlı olarak farklıdır. Bu yöntem, art arda 125 nükleotitlik 'okuma' ve bir seferde milyarlarca okuma üretebilir.

Bir gen gibi büyük bir DNA parçasındaki tüm bazların dizisini bir araya getirmek için araştırmacıların örtüşen segment dizisini okumaları gerekir. Bu, bir şekilde doğrusal bir yapbozun bir araya getirilmesi gibi, daha uzun dizinin daha kısa parçalardan birleştirilmesine izin verir. Bu süreçte, doğruluğu sağlamak için her bazın yalnızca bir kez değil, örtüşen segmentlerde en az birkaç kez okunması gerekir.

Araştırmacılar, bir hastalığın gelişiminde veya ilerlemesinde rol oynayabilecek genetik varyasyonları ve/veya mutasyonları araştırmak için DNA dizilimini kullanabilir. Hastalığa neden olan değişiklik, tek bir baz çiftinin ikamesi, silinmesi veya eklenmesi kadar küçük veya binlerce bazın silinmesi kadar büyük olabilir.


Fizyolojik Uyarlamalar ve Fonksiyonel Genomik'in Temeli

Üyelerin araştırmalarını birleştirmek Fizyolojik Uyarlamalar ve Fonksiyonel GenomikAuburn Üniversitesi Biyolojik Bilimler Bölümü (DBS) içindeki  (PAFG) Çekirdeği, organizmaların değişen çevresel koşullarda abiyotik/biyotik strese tepki vermesiyle ortaya çıkan temel mekanizmalar ve fonksiyonel adaptasyonlara odaklanır. Hücresel ve organizma düzeyindeki geleneksel fizyoloji, gelişim, ekoloji ve biyokimya çalışmaları, bu çekirdek alandaki temel soruları ele almak için modern genomik, proteomik ve epigenetik yaklaşımlarıyla birleştirilmektedir.

Oylama Üyeleri Oy Vermeyen Üyeler
Moises Bernal Jon Armbruster
Joanna Diller Paul Cobine
Raymond Henry Brian Karşı Adam
Courtney Leisner Rita Graze
Mary Mendonca Geoff Tepesi
Anthony Moss Ryan Aralığı
Aaron Raşot Elizabeth Schwartz'ın 160
Tonia Schwartz Bill Wills'in 160
marie strader  
Haruka Wada  
   
   
   
   
   

Auburn Üniversitesi fırsat eşitliği sağlayan bir eğitim kurumu/işverendir.

Biyolojik Bilimler, Auburn Üniversitesi Fen Bilimleri ve Matematik Fakültesi
101 Rouse Yaşam Bilimleri | Auburn, Alabama 36849 | (334) 844-4830
Bize Ulaşın | Telif Hakkı ©


Fonksiyonel Genomik ve Farmakogenomik dahil Genomik İşler.

Genomik fakültesi, doktora sonrası ve araştırma bilim adamları için kariyer fırsatları. Amerika, Avrupa ve Dünya çapında bir sonraki genomik işinizi bulun. Fonksiyonel genomik, farmakogenomik, biyokimya ve genetik alanlarında daha fazla iş keşfedin.

Tıp ve Sağlık Fakültesinde Fakülte ve Doktora Sonrası Pozisyonlar: Harbin, Çin

  • Haerbin, Heilongjiang (CN)
  • Cömert maaş ve yan haklar
  • Harbin Teknoloji Enstitüsü

Tıp ve Sağlık Fakültesinde Fakülte ve Doktora Sonrası Pozisyonlar: Harbin, Çin HARBIN TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ Harbin Teknoloji Enstitüsü (.

Üstün Profesör - Mikrobiyoloji ve Hücre Bilimi

UF/ IFAS, atanan %20 öğretim ve %80 araştırma atanmış 9 aylık görev süresi olan bir Üstün Profesör arıyor.

Veriye Dayalı Evrim ve Biyoçeşitlilik Bölümünde Yardımcı Doçent

Veriye dayalı evrim ve biyoçeşitlilik alanında bir araştırma grubu kurmak için beş yıllık finansman da dahil olmak üzere görev süresi pozisyonu.

Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi - Pediatrik Kardiyoloji

  • Milwaukee, Wisconsin
  • Rekabetçi
  • Wisconsin Tıp Fakültesi - Pediatri Anabilim Dalı

Hücre / moleküler biyoloji ve / veya fare genetiği konusunda deneyime sahip bir bilim insanı için Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi pozisyonu hemen mevcuttur.

3D Genom Biyolojisinde Doktora (PhD) öğrenci pozisyonu

Mitotik kromozomlar üzerinde kromatin mimarisini incelemek için doktora pozisyonu

Kıdemli Bilim Adamı, LGR Fonksiyonel Genomik

Site Adı: ABD - California - San Francisco Yayınlanma Tarihi: 27 Mayıs 2021 “Teknoloji, GSK'daki inovasyon stratejimizin anahtarıdır ve CRISPR de bunlardan biridir.

Genomik Veri Bilimcisi

  • Berkeley, Kaliforniya (ABD)
  • daha fazla bilgi için başvurun
  • Lawrence Berkeley Ulusal Laboratuvarı

Yeni ve geliştirilmiş bitki genomu açıklamaları oluşturmak için Bitki Karşılaştırmalı Analiz grubu içindeki JGI'da çalışın.

GSK Araştırmacısı, LGR Fonksiyonel Genomik

Site Adı: ABD - Kaliforniya - San Francisco Yayınlanma Tarihi: 10 Mayıs 2021 “Teknoloji, GSK'daki inovasyon stratejimizin anahtarıdır ve CRISPR bunlardan biridir.

Veriye Dayalı Evrim ve Biyoçeşitlilik alanında Kıdemli Öğretim Görevlisi (Yardımcı Doçent)

Ağaçlarda evrim, adaptasyon ve biyoçeşitlilik üzerine veriye dayalı araştırmalara ilişkin bir görev süresi pozisyonu şimdi İsveç'teki Umeå Bitki Bilim Merkezi'nde açıldı.

Yardımcı Doçent (Kıdem Alanı)

  • Britanya Kolombiyası (CA)
  • Tecrübe ile orantılı maaş.
  • British Columbia Üniversitesi

ICORD (Onarım Keşiflerinde Uluslararası İşbirliği)

Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi - Warnhoff Lab

Sanford Research'teki Pediatri ve Nadir Hastalıklar Grubundaki Warnhoff Laboratuarı, hücreyi araştırmak için Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi için bir açıklığa sahiptir.

Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi - Lenfoma Genomik

6.000'den fazla çalışanı olan yenilikçi bir biyomedikal araştırma, tedavi ve eğitim kurumu olan City of Hope, a.

Doktora sonrası

  • Şikago, Illinois
  • tecrübe ile orantılı
  • Northwestern Üniversitesi, Feinberg Tıp Fakültesi

Laboratuvarları Dr. Harris Perlman ve Deborah Winter, MD/PhD, MD veya PhD adayları arıyor

Metagenomik Doktora Araştırmacısı (f/div/m)

  • Jena, Thüringen (DE)
  • -
  • Leibniz Doğal Ürün Araştırma ve Enfeksiyon Biyolojisi Enstitüsü – Hans Knöll Enstitüsü

Araştırma Grubu Sistem Biyolojisi ve Biyoinformatik, yetenekli ve üstün yetenekli adayları başvurmaya davet ediyor.

Doktora Sonrası Akademik - Biyoloji

  • Reno, Nevada
  • tecrübe ile orantılı
  • Nevada Üniversitesi, Reno - Bilim Koleji

Dr. Pedro Miura'nın laboratuvarında koordineli alternatif ekleme ve alternatif poliadenilasyon mekanizmasını inceleyin.

Veriye Dayalı Evrim ve Biyoçeşitlilik Bölümünde Yardımcı Doçent

Veriye dayalı evrim ve biyoçeşitlilik alanında bir araştırma grubu kurmak için beş yıllık finansman da dahil olmak üzere görev süresi pozisyonu.

Doktora Sonrası Asistan

  • Albany, New York (ABD)
  • tecrübe ile orantılı
  • SUNY Araştırma Vakfı

SUNY Araştırma Vakfı, bakteri popülasyonu genomiği ve evrimi konusundaki araştırma programımıza katkıda bulunmak üzere bir Doktora Sonrası Ortak arıyor.

Biyoçeşitlilik ve Evrimde Veriye Dayalı Yaşam Biliminde Araştırma Bursu

  • İsveç Doğa Tarihi Müzesi (NRM), Stockholm, İsveç
  • Aylık maaş
  • SciLifeLab

Büyük ölçekli genetik, morfolojik veya dağılımsal verileri kullanarak yaşamın çeşitliliğini ve evrimini incelemek için kendi araştırma grubunuzu başlatın.

Tıp ve Sağlık Fakültesinde Fakülte ve Doktora Sonrası Pozisyonlar: Harbin, Çin

  • Haerbin, Heilongjiang (CN)
  • Cömert maaş ve yan haklar
  • Harbin Teknoloji Enstitüsü

Tıp ve Sağlık Fakültesinde Fakülte ve Doktora Sonrası Pozisyonlar: Harbin, Çin HARBIN TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ Harbin Teknoloji Enstitüsü (.

Üstün Profesör - Mikrobiyoloji ve Hücre Bilimi

UF/ IFAS, atanan %20 öğretim ve %80 araştırma atanmış, 9 aylık bir kadrolu Üstün Profesör arıyor.

Araştırma Görevlisi (Doktora Sonrası)

  • Madison, Wisconsin
  • NIH Seviyesi Başına
  • Wisconsin Üniversitesi-Madison Tıp Fakültesi ve Halk Sağlığı

Gelişim sırasında vasküler anomalilerin mekanizmalarını araştırmak için UW-Madison'daki Dermatoloji Bölümünde doktora sonrası pozisyonlar mevcuttur.

Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi

  • Rtp, Kuzey Karolina
  • Rekabetçi maaşlar, eğitim dereceleri ve önceki deneyimlere göre belirlenir.
  • NIEHS-ESCBL-SCB

Ulusal Çevre Sağlığı Bilimleri Enstitüsü, RTP, NC'deki Kök Hücre Biyolojisi Grubunda doktora sonrası pozisyonu

Doktora Sonrası İmmünoloji

Portland'daki Earle A. Chiles Araştırma Enstitüsü'nden Dr. Sasha Stanton, Or, ekibine katılmak için yüksek motivasyonlu bir Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi arıyor.


Kuantum sıçraması

Araştırma ve klinik uygulamaları biyotıpta tüm yaklaşımları yeniden yazacak şekilde geliştirebilecek potansiyel devrimci teknik gelişmeler hakkında spekülasyon yapmak ilginçtir. Polimeraz zincir reaksiyonunun ortaya çıkışı, büyük insert klonlama sistemleri ve düşük maliyetli, yüksek verimli DNA dizilimi için yöntemler, halihazırda gerçekleşmiş olan bu tür ilerlemelerin örnekleridir.

NHGRI'nin planlama tartışmaları sırasında, neredeyse kurgusal gibi görünen ancak başarılabilirse biyomedikal araştırma ve klinik uygulamada devrim yaratacak benzer 'teknolojik sıçramalar' hakkında başka fikirler ortaya çıktı.

Aşağıdakilerin kapsamlı bir liste olması değil, yaratıcı hayal kurmayı teşvik etmesi amaçlanmıştır:

Çok düşük maliyetle bir genotip belirleme yeteneği, 2.000 kişinin yaklaşık 400.000 genetik belirteçle taranabileceği bir ilişki çalışmasına izin vererek 10.000 $ veya daha düşük bir ücret karşılığında

DNA'yı mevcut maliyetten dört ila beş büyüklük sırası daha düşük maliyetlerle dizileme yeteneği, bir insan genomunun 1.000 $ veya daha düşük bir fiyata dizilenmesine olanak tanır

için uzun DNA moleküllerini yüksek doğrulukta sentezleme yeteneği

Mendel, G. Versuche über Pflanzen-Hybriden. Verhandlungen des naturforschenden Vereines, Abhandlungen, Brünn 4, 3–47 (1866).

Avery, O.T., MacLeod, C.M. & McCarty, M. Pnömokok türlerinin dönüşümünü indükleyen maddenin kimyasal yapısı üzerine çalışmalar. Bir desoksiribonükleik asit fraksiyonu ile transformasyonun uyarılması pnömokok Tip III. J. Uzm. Med. 79, 137–158 (1944).

Watson, J.D. & Crick, F.H.C. Nükleik asitlerin moleküler yapısı: Deoksiriboz nükleik asit için bir yapı. Doğa 171, 737 (1953).

Nirenberg, M. W. Genetik kod: II. bilim NS. 208, 80–94 (1963).

Jackson, D.A., Symons, R.H. & Berg, P. Simian Virus 40 DNA'sına yeni genetik bilgi eklemek için biyokimyasal yöntem: lambda faj genleri ve galaktoz operonunu içeren dairesel SV40 DNA molekülleri Escherichia koli. Proc. Natl Acad. bilim Amerika Birleşik Devletleri 69, 2904–2909 (1972).

Cohen, S.N., Chang, A.C., Boyer, H.W. ve Helling, R.B. Biyolojik olarak işlevsel bakteriyel plazmitlerin yapımı laboratuvar ortamında. Proc. Natl Acad. bilim Amerika Birleşik Devletleri 70, 3240–3244 (1973).

Uluslararası İnsan Genom Dizileme Konsorsiyumu. İnsan genomunun ilk dizilimi ve analizi. Doğa 409, 860–921 (2001).

Sanger, F. & Coulson, A. R. DNA polimeraz ile hazırlanmış sentez yoluyla DNA'daki dizileri belirlemek için hızlı bir yöntem. J. Mol. Biol. 94, 441–448 (1975).

Maxam, A.M. & Gilbert, W. DNA dizilimi için yeni bir yöntem. Proc. Natl Acad. bilim Amerika Birleşik Devletleri 74, 560–564 (1977).

Smith, L.M. ve diğerleri. Otomatik DNA dizi analizinde floresan tespiti. Doğa 321, 674–679 (1986).

Fare Genom Dizileme Konsorsiyumu. Fare genomunun ilk dizilimi ve karşılaştırmalı analizi. Doğa 420, 520–562 (2002).

Yonga Tahmini II. Doğa Genet. 32, 461–552 (2002).

Guttmacher, A.E. & Collins, F.S. Genomik tıp — Bir astar. N. İngilizce J. Med. 347, 1512–1520 (2002).

Ulusal Araştırma Konseyi. İnsan Genomunun Haritalanması ve Sıralanması (National Academy Press, Washington DC, 1988).

ABD Sağlık ve İnsan Hizmetleri Departmanı, ABD DOE. Genetik Mirasımızı Anlamak. ABD İnsan Genom Projesi: İlk Beş Yıl. NIH Yayını No. 90-1590 (Ulusal Sağlık Enstitüleri, Bethesda, MD, 1990).

Collins, F. & Galas, D. ABD İnsan Genom Projesi için yeni bir beş yıllık plan. Bilim 262, 43–46 (1993).

Collins, F.S. et al. ABD İnsan Genom Projesi için yeni hedefler: 1998-2003. Bilim 282, 682–689 (1998).

Hilbert, D. Matematiksel problemler. Boğa. NS. Matematik. Soc. 8, 437–479 (1902).

Aparicio, S. ve ark. Tüm genomlu av tüfeği montajı ve genomunun analizi Fugu rubripleri. Bilim 297, 1301–1310 (2002).

Sidow, A. Dizi ilk. Soruları sonra sorun. Hücre 111, 13–16 (2002).

Zhang, M. Q. Ökaryotik protein kodlayan genlerin hesaplamalı tahmini. Doğa Rev. Genet. 3, 698–709 (2002).

Banerjee, N. & Zhang, M. X. Transkripsiyon düzenleyici ağların haritalanmasına uygulanan fonksiyonel genomik. Kör. Görüş. Mikrobiyol. 5, 313–317 (2002).

Van der Weyden, L., Adams, D.J. ve Bradley, A. Fare genomunun hedeflenen manipülasyonu için araçlar. Fizyol. genomik 11, 133–164 (2002).

Hannon, G. J. RNA müdahalesi. Doğa 418, 244–251 (2002).

Stockwell, B. R. Kimyasal genetik: Gen fonksiyonunun ligand bazlı keşfi. Doğa Rev. Genet. 1, 116–125 (2000).

Gavin, A.C. ve ark. Protein komplekslerinin sistematik analizi ile maya proteomunun fonksiyonel organizasyonu. Doğa 415, 141–147 (2002).

Tyson, J.J., Chen, K. & Novak, B. Ağ dinamikleri ve hücre fizyolojisi. Doğa Rev. Mol. Hücre Biol. 2, 908–916 (2001).

Sachidanandam, R. et al. 1.42 milyon tek nükleotid polimorfizmi içeren bir insan genom dizisi varyasyon haritası. Doğa 409, 928–933 (2001).

Gabriel, S.B. et al. İnsan genomundaki haplotip bloklarının yapısı. Bilim 296, 2225–2229 (2002).

Reich, D.E. ve Lander, E.S. İnsan hastalığının alelik spektrumu üzerine. Trendler Genet. 17, 502–510 (2001).

Hirschhorn, J.N., Lohmueller, K., Byrne, E. & Hirschhorn, K. Genetik ilişkilendirme çalışmalarının kapsamlı bir incelemesi. Genet. Med. 4, 45–61 (2002).

Wagner, K. R. Genetik kas hastalıkları. Nörol. Klinik. 20, 645–678 (2002).

Golub, T. R. Hematolojik malignitenin patogenezine genomik yaklaşımlar. Kör. Görüş. Hematol. 8, 252–261 (2001).

Drews, J. & Ryser, S. İlaç geliştirmede inovasyonun rolü. Doğa Biyoteknoloji. 15, 1318–1319 (1997).

Druker, B. J. Imatinib tek başına ve kronik miyeloid lösemi için kombinasyon halinde. Semin. Hematol. 40, 50–8 (2003).

Selkoe, D. J. Alzheimer hastalığı: genler, proteinler ve terapi. Fizol. Rev. 81, 741–66 (2001).

Lynch, H.T. & de la Chapelle, A. Genomik tıp: kalıtsal kolorektal kanser. N. İngilizce J. Med. 348, 919–932 (2003).

Gardner, M.J. ve ark. İnsan sıtma parazitinin genom dizisi Plasmodium falciparum. Doğa 419, 498–511 (2002).

Holt, R.A. ve ark. Sıtma sivrisinek genom dizisi anofel gambia. Bilim 298, 129–149 (2002).

Anderlik, M. R. & Rothstein, M. A. Genetik bilginin mahremiyeti ve gizliliği: Yeni bilim için hangi kurallar? Annu. Rev. Genom. Hımm. Genet. 2, 401–433 (2001).

Hudson, K.L., Rothenberg, K.H., Andrews, L.B., Kahn, M.J.E. & Collins, F.S. Genetik ayrımcılık ve sağlık sigortası — Reform için acil bir ihtiyaç. Bilim 270, 391–393 (1995).

Rothenberg, K. ve ark. Genetik bilgi ve işyeri: Mevzuat yaklaşımları ve politika zorlukları. Bilim 275, 1755–1757 (1997).

Fuller, B.P. ve ark. Politika forumu: Etik — genetik araştırmalarında mahremiyet. Bilim 285, 1359–1361 (1999).

Miller, P. S. Genlerimde pembe bir kayma var mı? J. Sağlık Hukuku Politikası 3, 225–265 (2000).

10 ila 10.000 $ arasında herhangi bir diziye ait gen boyutlu DNA parçalarının sentezine izin veren baz başına 0.01

tek bir hücredeki tüm DNA'nın metilasyon durumunu belirleme yeteneği ve

tek bir deneyde tek bir hücredeki tüm proteinlerin durumunu izleme yeteneği.


Yapısal genomiklerden işlevsel bilgiler

Yapısal genomik çabalar, son birkaç yılda binlerce protein için ya doğrudan ya da modelleme yoluyla yapısal bilgi üretti. Bu proteinlerin birçoğu bilinen fonksiyonlara sahipken, bunların büyük bir yüzdesi fonksiyonel seviyede karakterize edilmemiştir. Yapısal bilgiler, dikkatli yapısal analizler, şans eseri ve yapı güdümlü işlevsel tarama yoluyla bu proteinlerin bazıları hakkında değerli işlevsel bilgiler sağlamıştır. Kuzeydoğu Yapısal Genomik Konsorsiyumu'nda (NESG) çözülen yapılara dayalı başarı öykülerinden bazıları burada rapor edilmektedir. Bunlar, bitkinin doğal bağışıklığında önemli rolü olan yeni bir metil salisilat esteraz, yeni bir RNA metiltransferaz (H. influenzae yggJ (HI0303)), yeni bir spermidin/spermin N-asetiltransferaz (B. subtilis PaiA), yeni bir metiltransferaz veya AdoMet bağlanmasını içerir. protein (A. fulgidus AF_0241), bir ATP:cob(I)alamin adenosiltransferaz (B. subtilis YvqK), yeni bir karboksizom gözenek (E. coli EutN), bozulmuş bir aktif bölgeye sahip bir prolin rasemaz homologu (B. melitensis BME11586) , bir FMN'ye bağlı enzim (S. pneumoniae SP_1951) ve yeni bir kıvrıma sahip 12 iplikli bir beta varil (V. parahaemolyticus VPA1032).


Genomik

Kendi adını taşıyan alanla birlikte gelişen bir dergi olarak, genomik geniş bir kitleye potansiyel ilgi ile temel soruları ele alan, en son yöntemlerin geliştirilmesi ve uygulanmasına odaklanır. Amacımız, en kaliteli araştırmaları yayınlamak ve yazarlara, kapsamımıza giren yazıların hızlı, adil ve doğru bir şekilde gözden geçirilmesini ve yayınlanmasını sağlamaktır. Genomik kapsamındaki konular aşağıdakileri içerir, ancak bunlarla sınırlı değildir:

  • Genom projeleri, genom dizilimi ve genomik teknolojiler ve yeni stratejiler dahil olmak üzere genomik. Tek mitokondriyal, kloroplast ve bakteri suşu varyant genomlarının basit raporları artık uygun değildir.
  • Transkripsiyonel profil oluşturma, mRNA analizi, mikroRNA analizi ve yerleşik ve yeni ortaya çıkan teknolojileri (dijital gen ifadesi gibi) kullanarak kodlamayan ve diğer RNA'ların analizini içeren fonksiyonel genomik. Yeni dizi verileri eklenmedikçe veya analiz için yeni bir algoritma tanıtılmadıkça, yalnızca mevcut dizi verilerini analiz eden el yazmaları artık uygun değildir. Algoritma, bir web sayfası aracılığıyla veya kod olarak herkese açık hale getirilmelidir.
  • Filogenomik dahil olmak üzere evrimsel ve karşılaştırmalı genomik.
  • Alanda ve gelişmekte olan teknolojilerde önemli etki potansiyeli olan yeni ve heyecan verici uygulamalara odaklanan genomik teknoloji ve metodoloji geliştirme.
  • Bütünleştirici yöntemler, ağ biyolojisi ve yeni araç ve tekniklerin geliştirilmesi dahil olmak üzere hesaplamalı biyoloji, biyoinformatik ve biyoistatistik.
  • Karmaşık gen çalışmaları, popülasyon genomiği, ilişkilendirme çalışmaları, yapısal varyasyon ve gen-çevre etkileşimleri dahil genomik ölçekte modern genetik. DNA metilasyonu, histon modifikasyonu, kromatin yapısı, damgalama ve kromatin yeniden modellemesi dahil epigenomik.
  • DNA elemanları, lokus kontrol bölgeleri, yalıtkanlar, güçlendiriciler, susturucular ve gen düzenleme mekanizmaları dahil olmak üzere genomik düzenleyici analiz.
  • Hastalık patogenezinin mekanizmasını ve bunun meta-genomik ve gen ve genom dizisi evriminin modu ve temposu dahil olmak üzere genetik faktörlerle ilişkisini anlamaya yönelik genomik yaklaşımlar.
  • Tıbbi Genomik, Kişisel Genomik ve insan sağlığına yönelik diğer uygulamalar.
  • Genomik tekniklerin geniş bir kitlenin ilgisini çekebilecek model organizmalarda uygulanması.
  • Üç veya daha fazla biyolojik kopya içermeyen RNA-seq deneyleri, diferansiyel ifadeye dayalı makaleler için kabul edilmeyecektir.
  • Karmaşık, dinamik ve yüksek verimli genomik veri kümelerinden yeni içgörüler çıkarmaya yardımcı olan hesaplamalı sistem biyolojisi, ayrık ve sürekli modelleme ve yapay zeka üzerine son teknoloji araştırmaları içeren Sistem Genomiği.

genomik öncelikle orijinal araştırma makaleleri yayınlar, ancak tam uzunlukta ve mini inceleme önerilerini de memnuniyetle karşılar. Tüm gönderimler genomik sıkı bir akran değerlendirmesine tabidir ve amacımız gönderilen yazıların yalnızca en iyi %25-30'unu kabul etmektir. Derginin kapsamı veya bir makalenin yayına uygunluğu ile ilgili inceleme önerileri veya sorularınız için lütfen Yayın Ofisi ile iletişime geçin.


Referanslar

Akpinar BA, Biyiklioglu S, Alptekin B, Havránková M, Vrána J, Doležel J, Distelfeld A, Hernandez P, The IWGSC Budak H (2018 ) Chromosome-based anket sekanslama, yabani buğday progenitörünün genom organizasyonunu ortaya koyuyor triticum diccocoides. Bitki Biyoteknoloji Dergisi 16, 2077&ndash2087.
| Kromozom tabanlı anket dizilimi, yabani buğday progenitörünün genom organizasyonunu ortaya koyuyor triticum diccocoides. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 29729062 PubMed |

Attitalla IH (2011 ) Tıbbi bitkilerden yüksek kaliteli genomik DNA ekstraksiyonu için modifiye CTAB yöntemi. Pakistan Biyolojik Bilimler Dergisi 14, 998&ndash999.
| Tıbbi bitkilerden yüksek kaliteli genomik DNA ekstraksiyonu için modifiye CTAB yöntemi. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 22514891 PubMed |

Bai Q, Wang X, Chen X, Shi G, Liu Z, Guo C, Xiao K (2018 ) Buğday miRNA TaemiR408, stresle ilişkili fizyolojik süreçleri modüle ederek bitki Pi yoksunluğuna ve tuz stresine toleransta önemli bir aracı görevi görür. Bitki Biliminin Sınırları 9, 499
| Buğday miRNA TaemiR408, stresle ilişkili fizyolojik süreçleri modüle ederek Pi yoksunluğuna ve tuz stresine karşı bitki toleransında önemli bir aracı görevi görür. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik |

Ben Amor B, Wirth S, Merchan F, Laporte P, d'Aubenton-Carafa Y, Hirsch J, Maizel A, Mallory A, Lucas A, Deragon JM, Vaucheret H, Thermes C, Crespi M (2009 ) Novel long non- Arabidopsis farklılaşması ve stres tepkilerinde yer alan protein kodlayan RNA'lar. Genom Araştırması 19, 57&ndash69.
| Arabidopsis farklılaşması ve stres tepkilerinde yer alan yeni, uzun protein kodlamayan RNA'lar. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 18997003 PubMed |

Bonasio R, Shiekhattar R (2014 ) Uzun kodlamayan RNA'lar tarafından transkripsiyonun düzenlenmesi. Genetiğin Yıllık İncelemesi 48, 433&ndash455.
| Uzun kodlamayan RNA'lar tarafından transkripsiyonun düzenlenmesi. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 25251851 PubMed |

Budak H, Khan Z, Kantar M (2015)a) Yeni nesil dizileme kullanan buğday miRNA'larının tarihçesi ve mevcut durumu ile gelişim ve stresteki rolleri. Fonksiyonel Genomikte Brifingler 14, 189&ndash198.
| Yeni nesil dizileme kullanan buğday miRNA'larının tarihçesi ve mevcut durumu ile gelişim ve stresteki rolleri. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 24962995 PubMed |

Budak H, Kantar M, Bulut R, Akpınar BA (2015)B) Tahıllarda strese duyarlı miRNA'lar ve izomiR'ler. Bitki Bilimi 235, 1&ndash13.
| Tahıllarda strese duyarlı miRNA'lar ve izomiR'ler. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 25900561 PubMed |

Çağırıcı HB, Alptekin B, Budak H (2017 ) Modern ve yabani buğdaylarda RNA dizilemesi ve birlikte eksprese edilen uzun kodlamayan RNA. Bilimsel Raporlar 7, 10670
| Modern ve yabani buğdaylarda RNA dizilimi ve birlikte eksprese edilen uzun kodlamayan RNA. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 28878329 PubMed |

Crooks GE, Hon G, Chandonia JM, Brenner SE (2004) WebLogo: bir dizi logo oluşturucu. Genom Araştırması 14, 1188&ndash1190.
| WebLogo: bir dizi logo oluşturucu. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 15173120 PubMed |

Csorba T, Questa JI, Sun Q, Dean C (2014 ) Antisense SERİN HAVA kromatin durumlarının koordineli olarak değiştirilmesine aracılık eder. FLC vernalizasyon sırasında. Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri 111, 16160&ndash16165.
| antisens SERİN HAVA kromatin durumlarının koordineli olarak değiştirilmesine aracılık eder. FLC vernalizasyon sırasında. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 25349421 PubMed |

Czarnocka W, Karpiński S (2018 ) Dost mu düşman mı? Çevresel streslere bitki tepkisinde reaktif oksijen türleri üretimi, süpürme ve sinyalleme. Serbest Radikal Biyoloji ve Tıp 122, 4&ndash20.
| Dost yada düşman? Çevresel streslere bitki tepkisinde reaktif oksijen türleri üretimi, süpürme ve sinyalleme. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik |

Deng F, Zhang X, Wang W, Yuan R, Shen F (2018 ) Gossypium hirsutum tuz stresi altında uzun kodlayıcı olmayan RNA'lar (lncRNA'lar). BMC Bitki Biyolojisi 18, 23
| tanımlanması Gossypium hirsutum tuz stresi altında uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA'lar). çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 29370759 PubMed |

Ding YF, Wang GY, Fu YP, Zhu C (2010) Bitki stres tepkilerinde miR398'in rolü. Yi Chuan 32, 129&ndash134.
| Bitki stres tepkilerinde miR398'in rolü. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 20176556 PubMed | [Çin'de]

Ding Y, Tao Y, Zhu C (2013) Bitkilerde kuraklık stres yanıtının aracılık etmede mikroRNA'ların ortaya çıkan rolleri. Deneysel Botanik Dergisi 64, 3077&ndash3086.
| Bitkilerde kuraklık stres tepkisine aracılık etmede mikroRNA'ların ortaya çıkan rolleri. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 23814278 PubMed |

Gálvez S, Mérida-García R, Camino C, Borrill P, Abrouk M, Ramírez-González RH, Biyiklioglu S, Amil-Ruiz F, The IWGSC Dorado G, Budak H, Gonzalez-Dugo V, Zarco-Tejada PJ, Appels R , Uauy C, Hernandez P (2019 ) Yetiştirme hedefleri olarak buğdayda tarla kuraklığı tepkilerinin genomik mimarisindeki sıcak noktalar. Fonksiyonel ve Bütünleştirici Genomik 19, 295&ndash309.
| Buğdayda ıslah hedefleri olarak tarla kuraklığı tepkilerinin genomik mimarisindeki sıcak noktalar. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik |

Gao H, Chen X, Shang Z, Niu Y (2018 ) Uzun kodlamayan ve miRNA rekabet eden endojen ağ analizi ile tanımlanan böbrek kanseri için prognostik imzalar. Onkoloji Raporları 40, 959&ndash967.
| Uzun kodlamayan ve miRNA rekabet eden endojen ağ analizi ile tanımlandığı gibi böbrek kanseri için prognostik imzalar. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 29901101 PubMed |

Griffiths-Jones S,, Grocock RJ, van Dongen S, Bateman A, Enright AJ (2006) miRBase: microRNA dizileri, hedefler ve gen terminolojisi. Nükleik Asitler Araştırması 34, D140&ndashD144.
| miRBase: mikroRNA dizileri, hedefler ve gen terminolojisi. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik |

Gupta OP, Meena NL, Sharma I, Sharma P (2014 ) Buğdayda ozmotik, tuz ve soğuk streslerine yanıt olarak mikroRNA'ların farklı düzenlenmesi. Moleküler Biyoloji Raporları 41, 4623&ndash4629.
| Buğdayda ozmotik, tuz ve soğuk streslerine yanıt olarak mikroRNA'ların farklı düzenlenmesi. çapraz referans | Google Akademik Google Akademik | 24682922 PubMed |

Han D, Zhang J, Tang G (2012) MicroRNAfold: termodinamik tabanlı puanlama stratejisi ile değiştirilmiş NCM modeline dayalı mikroRNA öncesi ikincil yapı tahmini. Uluslararası Veri Madenciliği ve Biyoinformatik Dergisi 6, 272&ndash291.
| MicroRNAfold: pre-microRNA secondary structure prediction based on modified NCM model with thermodynamics- based scoring strategy. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 23155762 PubMed |

Huang XS, Liu JH, Chen XJ (2010 ) Overexpression of PtrABF gene, a bZIP transcription factor isolated from Poncirus trifoliata, enhances dehydration and drought tolerance in tobacco via scavenging ROS and modulating expression of stress-responsive genes. BMC Bitki Biyolojisi 10, 230
| Overexpression of PtrABF gene, a bZIP transcription factor isolated from Poncirus trifoliata, enhances dehydration and drought tolerance in tobacco via scavenging ROS and modulating expression of stress-responsive genes. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 20973995 PubMed |

Huang R, Cang J, Yu J, Lu BW, Liu LJ, Wang JF, Guo RM, Xv C (2014 ) Solexa sequencing and bioinformatics analysis of winter wheat small RNA. Zhiwu Xuebao 49, 8&ndash18.
| Solexa sequencing and bioinformatics analysis of winter wheat small RNA. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | [in Chinese]

Jia X, Wang WX, Ren L, Chen QJ, Mendu V, Willcut B, Dinkins R, Tang X, Tang G (2009 ) Differential and dynamic regulation of miR398 in response to ABA and salt stress in Populus tremula ve Arabidopsis thaliana. Plant Molecular Biology 71, 51&ndash59.
| Differential and dynamic regulation of miR398 in response to ABA and salt stress in Populus tremula ve Arabidopsis thaliana. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 19533381 PubMed |

Kong L, Sun M, Xie Y, Wang F, Zhao Z (2015 ) Photochemical and antioxidative responses of the glume and flag leaf to seasonal senescence in wheat. Frontiers of Plant Science 6, 358
| Photochemical and antioxidative responses of the glume and flag leaf to seasonal senescence in wheat. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Krüger J, Rehmsmeier M (2006 ) RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nükleik Asitler Araştırması 34, W451&ndashW454.
| RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 16845047 PubMed |

Kumar S, Stecher G, Tamura K (2016 ) MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets Moleküler Biyoloji ve Evrim 33, 1870&ndash1874.
| MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets Crossref | GoogleScholar Google Scholar | 27004904 PubMed |

Leng X, Wang P, Zhu X, Li X, Zheng T, Shangguan L, Fang J (2017 ) Ectopic expression of CSD1 ve CSD2 targeting genes of miR398 in grapevine is associated with oxidative stress tolerance. Functional & Integrative Genomics 17, 697&ndash710.
| Ectopic expression of CSD1 ve CSD2 targeting genes of miR398 in grapevine is associated with oxidative stress tolerance. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Lescot M, Déhais P, Thijs G, Marchal K, Moreau Y, Van de Peer Y, Rouzé P, Rombauts S (2002 ) PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for silico'da analysis of promoter sequences. Nükleik Asitler Araştırması 30, 325&ndash327.
| PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for silico'da analysis of promoter sequences. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 11752327 PubMed |

Li Y, Lu YG, Shi Y, Wu L, Xu YJ, Huang F, Guo XY, Zhang Y, Fan J, Zhao JQ, Zhang HY, Xu PZ, Zhou JM, Wu XJ, Wang PR, Wang WM (2014 ) Multiple rice microRNAs are involved in immunity against the blast fungus Magnaporthe oryzae. Bitki Fizyolojisi 164, 1077&ndash1092.
| Multiple rice microRNAs are involved in immunity against the blast fungus Magnaporthe oryzae. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 24335508 PubMed |

Li L, Yi H, Xue M, Yi M (2017 ) miR398 and miR395 are involved in response to SO2 stress in Arabidopsis thaliana. Ecotoxicology (London, England) 26, 1181&ndash1187.
| miR398 and miR395 are involved in response to SO2 stress in Arabidopsis thaliana. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Liang L, Yang M, Zhang L, Lin H, Zhou X (2012 ) Chlorophyll content inversion with hyperspectral technology for wheat canopy based on support vector regression algorithm. Nongye Gongcheng Xuebao (Beijing) 28, 162&ndash171.

Lv BS, Tian HY, Zhang F, Liu JJ, Lu SC, Bai MY, Li CY, Ding ZJ (2018 ) Brassinosteroids regulate root growth by controlling reactive oxygen species homeostasis and dual effect on ethylene synthesis in Arabidopsis. PLOS Genetics 14, e1007144
| Brassinosteroids regulate root growth by controlling reactive oxygen species homeostasis and dual effect on ethylene synthesis in Arabidopsis. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Ma SC, Li Q, Peng JY, Zhouwen JL, Zhang DN, Zhang CB, Jiang WG, Jia W (2018 ) CLDN5 affects lncRNAs acting as ceRNA dynamics contributing to regulating blood-brain barrier permeability in tumor brain metastasis. Onkoloji Raporları 39, 1441&ndash1453.

Marquardt S, Raitskin O, Wu Z, Liu F, Sun Q, Dean C (2014 ) Functional consequences of splicing of the antisense transcript COOLAIR üzerinde FLC transkripsiyon. moleküler hücre 54, 156&ndash165.
| Functional consequences of splicing of the antisense transcript COOLAIR üzerinde FLC transkripsiyon. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 24725596 PubMed |

Mekala JR, Naushad SM, Ponnusamy L, Arivazhagan G, Sakthiprasad V, Pal-Bhadra M (2018 ) Epigenetic regulation of miR-200 as the potential strategy for the therapy against triple-negative breast cancer. Gen 641, 248&ndash258.
| Epigenetic regulation of miR-200 as the potential strategy for the therapy against triple-negative breast cancer. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 29038000 PubMed |

Miller G, Suzuki N, Ciftci-Yilmaz S, Mittler R (2010 ) Reactive oxygen species homeostasis and signalling during drought and salinity stresses. Plant, Cell & Environment 33, 453&ndash467.
| Reactive oxygen species homeostasis and signalling during drought and salinity stresses. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Nour-Eldin HH, Hansen BG, Nørholm MH, Jensen JK, Halkier BA (2006 ) Advancing uracil-excision based cloning towards an ideal technique for cloning PCR fragments. Nükleik Asitler Araştırması 34, e122
| Advancing uracil-excision based cloning towards an ideal technique for cloning PCR fragments. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 17000637 PubMed |

Pagliarani C, Vitali M, Ferrero M, Vitulo N, Incarbone M, Lovisolo C, Valle G, Schubert A (2017 ) Accumulation of microRNAs differentially modulated by drought is affected by grafting in grapevine. Bitki Fizyolojisi 173, 2180&ndash2195.
| Accumulation of microRNAs differentially modulated by drought is affected by grafting in grapevine. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 28235889 PubMed |

Park SY, Grabau E (2017 ) Bypassing miRNA-mediated gene regulation under drought stress: alternative splicing affects CSD1 gene expression. Plant Molecular Biology 95, 243&ndash252.
| Bypassing miRNA-mediated gene regulation under drought stress: alternative splicing affects CSD1 gene expression. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 28776286 PubMed |

Rubio-Somoza I, Weigel D, Franco-Zorilla JM, García JA, Paz-Ares J (2011 ) ceRNAs: miRNA target mimic mimics. Hücre 147, 1431&ndash1432.
| ceRNAs: miRNA target mimic mimics. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 22196719 PubMed |

Salmena L, Poliseno L, Tay Y, Kats L, Pandolfi PP (2011 ) A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language? Hücre 146, 353&ndash358.
| A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language? çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 21802130 PubMed |

Sánchez-Pardo B, Fernández-Pascual M, Zornoza P (2012 ) Copper microlocalisation, ultrastructural alterations and antioxidant responses in the nodules of white lupin and soybean plants grown under conditions of copper excess. Çevresel ve Deneysel Botanik 84, 52&ndash60.
| Copper microlocalisation, ultrastructural alterations and antioxidant responses in the nodules of white lupin and soybean plants grown under conditions of copper excess. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Schmedes A, Hølmer G (1989 ) A new thiobarbituric acid (TBA) method for determining free malondialdehyde (MDA) and hydroperoxides selectively as a measure of lipid peroxidation. Journal of the American Oil Chemists’ Society 66, 813&ndash817.
| A new thiobarbituric acid (TBA) method for determining free malondialdehyde (MDA) and hydroperoxides selectively as a measure of lipid peroxidation. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Smillie CL, Sirey T, Ponting CP (2018 ) Complexities of post-transcriptional regulation and the modeling of ceRNA crosstalk. Biyokimya ve Moleküler Biyolojide Eleştirel İncelemeler 53, 231&ndash245.
| Complexities of post-transcriptional regulation and the modeling of ceRNA crosstalk. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 29569941 PubMed |

Song CN, Yu ML, Han J, Wang C, Liu H, Zhang YP, Fang JG (2012 ) Validation and characterization of narenciye sinensis microRNAs and their target genes. BMC Research Notes 5, 235
| Validation and characterization of narenciye sinensis microRNAs and their target genes. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Todesco M, Rubio-Somoza I, Paz-Ares J, Weigel D (2010 ) A collection of target mimics for comprehensive analysis of microRNA function in Arabidopsis thaliana. PLOS Genetics 6, e1001031
| A collection of target mimics for comprehensive analysis of microRNA function in Arabidopsis thaliana. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 20661442 PubMed |

Ueda Y, Uehara N, Sasaki H, Kobayashi K, Yamakawa T (2013 ) Impacts of acute ozone stress on superoxide dismutase (SOD) expression and reactive oxygen species (ROS) formation in rice leaves Bitki Fizyolojisi ve Biyokimyası 70, 396&ndash402.
| Impacts of acute ozone stress on superoxide dismutase (SOD) expression and reactive oxygen species (ROS) formation in rice leaves Crossref | GoogleScholar Google Scholar | 23831949 PubMed |

Wang J, Meng X, Yuan C, Harrison AP, Chen M (2016 ) The roles of cross-talk epigenetic patterns in Arabidopsis thaliana. Briefings in Functional Genomics 15, 278&ndash287.
| The roles of cross-talk epigenetic patterns in Arabidopsis thaliana. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 26141715 PubMed |

Wang Y, Gao L, Zhu B, Zhu H, Luo Y, Wang Q, Zuo J (2018 ) Integrative analysis of long non-coding RNA acting as ceRNAs involved in chilling injury in tomato fruit. Gen 667, 25&ndash33.
| Integrative analysis of long non-coding RNA acting as ceRNAs involved in chilling injury in tomato fruit. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 29753809 PubMed |

Xiong W, Huang C, Deng H, Jian C, Zen C, Ye K, Zhong Z, Zhao X, Zhu L (2018 ) Oncogenic non-coding RNA NEAT1 promotes the prostate cancer cell growth through the SRC3/IGF1R/AKT pathway. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 94, 125&ndash132.
| Oncogenic non-coding RNA NEAT1 promotes the prostate cancer cell growth through the SRC3/IGF1R/AKT pathway. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Yu J, Cang J, Li YP, Huang R, Lu QW, Wang XT, Liu LJ, Xu QH, Zhang KJ (2016 ) Salicylic acid-induced antioxidant protection against low temperature in cold-hardy winter wheat. Acta Physiologiae Plantarum 38, 261
| Salicylic acid-induced antioxidant protection against low temperature in cold-hardy winter wheat. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |

Zeng X, Xu Y, Jiang J, Zhang F, Ma L, Wu D, Wang Y, Sun W (2018 ) Identification of cold stress responsive microRNAs in two winter turnip rape (Brassica rapa L.) by high throughput sequencing. BMC Bitki Biyolojisi 18, 52
| Identification of cold stress responsive microRNAs in two winter turnip rape (Brassica rapa L.) by high throughput sequencing. çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar | 29587648 PubMed |

Zhang F (2015) Identification method of long-chain non-coding RNA related to pollen development and pollination and fertilization in Chinese cabbage. Masters thesis, Zhejiang University, China. [in Chinese]

Zhang H (2016) A preliminary study on the epigenetics of the photoperiod-sensitive male sterile line Wuxiang S in rice. PhD thesis, Wuhan University, China. [in Chinese]

Zhao JM, Zhai ZW, Li YN, Geng SF, Song GY, Guan JT, Jia ML, Wang F, Sun GL, Feng N, Kong XC, Chen L, Mao L, Li AL (2018 ) Genome-wide identification and expression profiling of the TCP family genes in spike and grain development of wheat (Triticum aestivum L.). Frontiers of Plant Science 9, 1282
| Genome-wide identification and expression profiling of the TCP family genes in spike and grain development of wheat (Triticum aestivum L.). çapraz referans | GoogleScholar Google Scholar |


Videoyu izle: #biyoloji #genel biyoloji BÖLÜM 5: Genomik ve Ötesi-2 (Haziran 2022).


Yorumlar:

  1. Abramo

    Bence haklı değilsin. Eminim. Kanıtlayabilirim.

  2. Dishura

    tam saçmalık

  3. Lia

    Eleştirmek yerine seçeneklerini daha iyi yazın.

  4. Hanly

    Wacker, bana olağanüstü bir fikir gibi geliyor.



Bir mesaj yaz