Bilgi

4.4: Diyatomlar - Biyoloji

4.4: Diyatomlar - Biyoloji


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Diatomlar, Phylum Bacillariophyta

Diatomlar, kırmızı alglerin ikincil endosimbiyozundan türetilen heterokontların başka bir fotosentetik soyudur. Diatomlar, 20.000 ila 2 milyon tür içeren inanılmaz derecede çeşitli tek hücreli organizmalar grubudur. Bu organizmalar tek hücrelidir ve bir hüsran, plazma zarını çevreleyen iki ayrı valften yapılmış bir silika kabuk. Frustüller şaşırtıcı derecede karmaşıktır, güneş ışığını yakalamak için özel olarak uyarlanmış bir düzende küçük gözeneklerle kaplıdır (Şekil (PageIndex{1})). Karotenoid pigmenti nedeniyle altın kloroplastları vardır. fukoksantin (Şekil (PageIndex{2})).

Şekil (PageIndex{1}): Altın organellerle (kloroplastlar) dolu bir diatom. Fotoğraf Vicente Franch Meneu, CC-BY-NC.

Şekil (PageIndex{2}): Bir isthmia nervoza gözeneklerin karmaşık desenini gösteren frustule. Her biri için farklı bir gözenek düzenine sahip birden fazla katman var gibi görünüyor. Fotoğraflar Lama Mark Webber, CC-BY-NC.

Morfoloji

Hala bir diatom "türünün" ne olduğunu nasıl belirleyeceğimizi bulmaya çalışıyoruz ve şimdiye kadar, frustüllerinin morfolojisine göre sınıflandırıldılar. Bu sınıflandırmayı kullanarak, tarihsel olarak iki ana diatom grubu vardı: merkezli (radyal simetriye sahip) ve pennate (iki taraflı simetriye sahip). Bu sınıflandırmalar gelişmiş ve karmaşıklık bakımından artmıştır, bu nedenle burada sadece geniş vuruşları ele alacağız. Mevcut diatom morfolojik sınıflandırmasına ve harika görüntülere daha derinlemesine bakmak için bu harika web sitesine göz atın.

Şekil (PageIndex{3}): Bu görüntüler merkezli diatomları göstermektedir. Bu organizmaların her birine birkaç simetri çizgisi çizebilirsiniz. Merkezli, hala diatom cinsleri için kullanılan morfolojik bir tanımdır. Öncelikle: trikeratyum, fotoğraf Ryan Watson, CC-BY. İkinci: Arachnoidiscus ehrenbergii üzerinde bulundu ulva, Randall'ın fotoğrafı, CC0.

Şekil (PageIndex{4}): Bu görüntüler çeşitli "pennate" diatomları göstermektedir. Bu, tarihsel olarak, daha iyi tanımlanmış gruplara (hatta bazıları asimetrik) bölünmüş olan birçok ikili simetrik diatom çeşidini sınıflandırmıştır. Üç boyutlu olarak düşünüldüğünde, bu tip diatomdan sadece bir simetri çizgisi çizilebilir. Öncelikle: Gomphonema aküminatum, ölçek çubuğu = 10 µm. Fotoğraf Enviroethan, CC-BY-NC. İkinci: Surirella undulata, fotoğraf, Lila_137, CC-BY-NC.

Şekil (PageIndex{5}): Birçok diatom, tek hücreli diatomların daha karmaşık bir yapı oluşturmak için birbirine yapıştığı kolonilerde yaşar. Bu, su sütununda yüzmeyi (sal oluşumu) kolaylaştırabilir veya yırtıcılar tarafından yutulmayı zorlaştırabilir. Yukarıdaki örnekler, çeşitli şekillerde diatom kolonilerini göstermektedir. Sol: Asterionella formosa, yıldız şeklinde bir koloni oluşturan iki taraflı simetrik bir diatom. Mindy Morales'in fotoğrafı, CC-BY-NC. Doğru: Chaetoceros debilis, spiral şekilli bir koloni oluşturan merkezli bir diatom. Fotoğraf Sarka Martinez, CC-BY-NC.

Ekoloji

Morfolojiye ek olarak, diatomlar oluştukları yere göre de sınıflandırılabilir. Serbest yüzen diatomlar planktonik. Diğer organizmalara bağlı diatomlar (dev yosun gibi) epifitik. bentik diatomlar bir su kütlesinin dibine doğru durma eğilimindedir.

Şekil (PageIndex{6}): Bu görüntü, resmin her iki tarafında kümelenme eğiliminde olsalar da birçok diatom gösterir. Bir araya toplandıklarında, çok daha altın renkli görünürler. Bu, karotenoid fukoksantin içeren altın kloroplastlarından kaynaklanmaktadır. Fotoğraf Melissa Ha, CC-BY-NC.

Şekil (PageIndex{7}): Epifitik diatomlar. Bu diatomlar, kırmızı alg Polysiphonia'nın hazırlanmış bir slaydından fotoğraflandı. Slaytı yapmak için kullanılan kırmızı alg örneğinin yüzeyine bağlanmış, yelpaze benzeri bir pennate diatom kolonisidir. Slayt yapıldığında, boyama banyosundan geçti. Bu, diatomlardaki birçok altın kloroplastı maviye çevirdi. Diyatomların içindeki kloroplastları görebilirsiniz çünkü silika frustüller cam gibi şeffaftır. Fotoğraf Maria Morrow, CC-BY-NC.

Üreme

Diatomlar öncelikle eşeysiz olarak çoğalırlar. ikiye bölünerek çoğalma, prokaryotlara benzer. İkili fisyon sırasında frustülün iki valfi ayrılır ve her yeni hücre eskisinin içinde yeni bir valf oluşturur. Ancak, yeni valf her zaman daha küçüktür. Diatomlar sadece bu şekilde çoğalırsa, ortalama boyutta sürekli bir azalma ile sonuçlanır. Minimum boyuta ulaşıldığında, bu cinsel üremeyi tetikleyebilir. Diatomlar eşeyli olarak çoğaldıklarında diplontik bir yaşam döngüsüne sahiptirler ve çok büyük oksospor.

Şekil (PageIndex{8}): Diatomlar eşeyli olarak çoğaldıklarında, oksospor adı verilen büyük bir yapı oluştururlar. Bu resimde, oksospor, epifitik diatom kolonisinin sonunda bulunan ampul şeklinde bir hücredir. Her diatomda görünen birçok altın kloroplast vardır. Fotoğraf Maria Morrow, CC-BY-NC.

Çeşitlilik

Video (PageIndex{1}): Bu video, diatom şekillerinin inanılmaz çeşitliliğini ve Klaus Kemp'in onlarla yaptığı harika sanatı gösteriyor. YouTube'dan alınmıştır.


Krizofit Türleri: 2 Tür | protistler

(i) Diatomlar, tüm sucul ve nemli karasal habitatlarda meydana gelir.

(ii) Serbest yüzen veya dipte yaşayanlar olabilirler. Serbest yüzen formlar, müsilaj sekresyonu ve hafif lipidlerin mevcudiyeti ile su yüzeyinde asılı kalır.

(iii) Diyatomlar, müsilaj yardımıyla kayma hareketi gösterebilir.

(iv) Diatomların silisli frustülleri kolayca çürümez. Su rezervuarlarının dibinde yığılırlar ve diyatomit veya diyatomlu toprak adı verilen büyük yığınlar oluştururlar. Madenciliğin yapılabileceği belirli alanlarda birkaç yüz metreye kadar uzayabilir.

(i) Gövde, frustül olarak bilinen trans­parent silisli bir kabukla (hücre duvarında biriken silika) kaplıdır. Frustül, epitel ve hipoteka olmak üzere iki kapakçıktan oluşur. İki valf, bir sabun kutusu gibi birbirine oturur. Frustule çok ince işaretlere, çukurlara, gözeneklere ve sırtlara sahiptir.

(ii) Diatomlar, üreme durumu dışında kamçıya sahip olmayan mikroskobik, çeşitli renklerde ve çeşitli formlarda protistlerdir.

(iii) Temelde tek hücrelidirler, ancak yalancı filamentler ve colo­nies oluşturabilirler.

(iv) Simetriye bağlı olarak, dia&shitomlar pennat ve merkezli olmak üzere iki tiptir. Pennate diatomlar iki taraflı simetri gösterir; Navicula ve merkezli diatomlar radyal simetri ve simetriye sahiptir, örneğin Melosira.

(v) Her hücrenin büyük bir merkezi kofulu vardır. Tek büyük çekirdek, sitoplazmik iplikler vasıtasıyla merkezi vakuolde ortak bir şekilde asılıdır.

(vi) Kloroplastlar veya kromatoforlar sarımsı kahverengi ila yeşilimsi kahverengidir. Klorofil a ve klorofil c içerirler.

(vii) Dia­tomlar, kahverengimsi renk veren fukoksantin (tipik kahverengi alg) içerir.

Yiyecekler yağlar ve lökosin (polisakkarit) şeklinde saklanır. Volutin glob­ules (doğada proteinli) de mevcuttur.

(i) Çoklu bölünmenin yaygın modu ikili bölünmedir.

(ii) Bazı durumlarda dinlenme sporları veya statosporlar oluşur.

(iii) Mayoz, gametiktir. Eşeyli üreme, izogamiden zoogamiye değişir. İkinci durumda, erkek gametler hareketli ve uniflagellattır. Döllenme, boyut olarak büyüyen ve vejetatif hücrelerinin tipik olarak diploid olduğu oksospor adı verilen gençleştirici bir hücre oluşturan bir zigot üretir.

Triceratium, Pleurosigma, Navicula, Cymbella, Amphipleura.

iv. Ekonomik önem:

(i) Diatomlar çok önemli fotosentezlerdir. Dünyada sentezlenen tüm organik maddelerin yaklaşık yarısının onlar tarafından üretildiğine inanılıyor. Mikroskobik olmalarına rağmen, diatomlar suda yaşayan hayvanlar için önemli bir besin kaynağıdır. 60 tonluk bir mavi balinanın bağırsağında çoğunlukla diatom olan 2 ton plankton bulunabilir.

(ii) Bazı balıklardan ve balinalardan elde edilen yağlar aslında diatomlar tarafından üretilenlerdir.

(iii) Diatomit yataklarına genellikle petrol sahaları eşlik eder. Bugünün petrolünün çoğu muhtemelen geçmiş diatomların çürümüş gövdelerinden kaynaklanmaktadır.

(iv) Diatomit gözeneklidir ve kimyasal olarak inerttir. Bu nedenle şeker, alkol, yağ, şurup ve antibiyotiklerin filtrasyonunda kullanılır.

(v) Diatomit, diş macunlarında ve metal cilalarında temizlik maddesi olarak kullanılır.

(vi) Gece görünürlüğünü arttırmak için boyalara diyatomit eklenir.

(vii) Diatomit, buzdolaplarında, kazanlarda ve fırınlarda yalıtım malzemesi olarak kullanılır.

(viii) Ses geçirmez odalar yapmak için diyatomlu toprak eklenir.

(ix) Diatomit iyi bir endüstriyel katalizördür.

(x) Diatomit, su camı veya sodyum silikat kaynağıdır,

(xi) Diatomlar çok iyi kirlilik göstergeleridir.

Krizofitler: Tip # 2. Desmidler:

Desmidler tek hücreli yeşil alglerdir. Spirogyra gibi, ayrıntılı bir kloroplastları var. Hücrelerinin iki ayrı yarısı vardır. Hücrenin dış duvarı, hücrenin yavaş kayma hareketinde rol oynadığı düşünülen müsilajlı bir kılıfla kaplı çeşitli çıkıntılara sahiptir.

Eşeyli üreme, Spirogyra'nınkine benzer "eşleşme" ile gerçekleşir. Esas olarak tatlı suda bulunurlar ve genellikle temiz (kirlenmemiş) suyun göstergesidirler.


Diatomlarda genom düzenleme: başarılar ve hedefler

Diatomlar, fitoplanktonun ana bileşenleridir ve sucul ekosistemlerin ekolojisinde önemli bir rol oynar. Bu algler, deniz ekolojisi ve oşinografiden biyoteknolojiye kadar çok çeşitli araştırma alanları için büyük bilimsel öneme sahiptir. Son 20 yılda, seçilen diatom türleri hakkında genomik bilgilerin mevcudiyeti ve genetik manipülasyonda önemli bir ilerleme, diatomların deniz biyolojisi araştırmaları için moleküler model organizmalar olarak kurulmasına güçlü bir şekilde katkıda bulunmuştur. Son zamanlarda, özel TALEN endonükleazları ve CRISPR/Cas9 sistemi diatomlarda kullanıldı ve hedeflenen genetik modifikasyonlara ve nakavt suşların üretilmesine izin verdi. Bu yaklaşımlar diatom araştırmaları için son derece değerlidir çünkü üreme, rastgele yerleştirme yoluyla ileri genetik taramalar ve kimyasal mutajenez, laboratuarda cinsel olarak çaprazlamayan mevcut model türleri Phaeodactylum tricornutum ve Thalassiosira pseudonana için geçerli değildir. Burada, diatomlarda kararlı genetik modifikasyonlar gerçekleştirmek için şu anda mevcut olan genetik araç kutusuna genel bir bakış sunuyoruz. Diatom biyolojisinin karakterizasyonu ve metabolik mühendislik için bu teknolojilerin potansiyelinden tam olarak yararlanmak için ele alınması gereken yeni zorlukları da tartışıyoruz.

Anahtar Kelimeler: CRISPR Konjugasyon Diatom Genom düzenleme Mutant tarama Destekleyici TALEN.


Diatom Moleküler Araştırmaları Yaşlanıyor: Fitoplankton Biyolojisi ve Çeşitliliği Çalışmak İçin Model Türler

Diatomlar, en az 100.000 tür içeren dünyanın en çeşitli alg grubudur. Yıllık küresel karbon fiksasyonunun yaklaşık %20'sine katkıda bulunarak, başlıca sucul besin ağlarını destekler ve küresel biyojeokimyasal döngüleri yönlendirirler. Son yirmi yılda, Thalassiosira pseudonana ve Phaeodactylum tricornutum hızlı büyüme oranları, küçük genomları ve ilişkili genetik kaynakların kümülatif zenginliği nedeniyle hücre biyolojisinden ekofizyolojiye kadar uzanan diatom moleküler araştırmaları için en önemli model sistemler haline gelmiştir. Diatomların evrimsel farklılığını araştırmak için ek model türler ortaya çıkıyor, örneğin: Fragilariopsis cylindrus ve Sahte nitzschia multistriata Burada, fonksiyonel genomik ve ters genetiğin, evrim, hücre biyolojisi ve metabolik adaptasyonlar bağlamında bu önemli mikroalg sınıfını anlamamıza nasıl katkıda bulunduğunu açıklıyoruz. İncelememiz ayrıca, su ortamlarında ikincil plastid taşıyan organizmaların yaşamını yöneten yeni moleküler yolların keşfi de dahil olmak üzere, bu fotosentetik organizmaların çeşitliliğine ilişkin umut verici araştırma alanlarını vurgulayacaktır.

© 2020 Amerikan Bitki Biyologları Derneği. Her hakkı saklıdır.

Rakamlar

Küresel Dağıtım Modeli…

Diatom Biyokütlesinin Küresel Dağılımının Modeli. Küresel dağıtım modeli…

Diatom Özellikleri ve Morfolojik Çeşitlilik.…

Diatom Özellikleri ve Morfolojik Çeşitlilik. (A) Model merkezli taramalı elektron mikrografı…

Basitleştirilmiş Binbaşı Şeması…

Diatomların Evrimine Yol Açan Büyük Olayların Basitleştirilmiş Şeması…

Karbon, Azot ve…

Diatom Model Türlerinde Karakterize Edilen Karbon, Azot ve Demir Metabolizmasının Düzenleyicileri...


İçindekiler

Diatomlar genellikle 2 ila 200 mikrometre boyutundadır [13] ve birkaç daha büyük tür vardır. Fotosentez bölgesi olan sarımsı-kahverengi kloroplastları, dört zara sahip olan ve karotenoid fukoksantin gibi pigmentler içeren heterokontların tipik özelliğidir. Bireylerde genellikle flagella yoktur, ancak bunlar, merkezi diatomların erkek gametlerinde bulunurlar ve diğer gruplardaki kıllar (mastigonemler) dahil olmak üzere olağan heterokont yapıya sahiptirler.

Diatomlar, optik özelliklerinden dolayı genellikle "denizin mücevherleri" veya "canlı opaller" olarak adlandırılır. [22] Bu yapısal renklenmenin biyolojik işlevi net değildir, ancak iletişim, kamuflaj, termal değişim ve/veya UV koruması ile ilgili olabileceği tahmin edilmektedir. [23]

Diatomlar, esas olarak silikadan oluşan frustül adı verilen karmaşık, sert fakat gözenekli hücre duvarları oluşturur. [24] : 25–30 Bu silisli duvar [25], tümü cinsleri ve türleri tanımlamak için kullanılabilen çeşitli gözenekler, kaburgalar, küçük dikenler, marjinal sırtlar ve yükselmeler ile yüksek oranda desenli olabilir.

Hücrenin kendisi, her biri esasen düz bir plaka veya valf ve marjinal bağlantı veya kuşak bandı içeren iki yarıdan oluşur. Bir yarısı, hipoteka, diğer yarısından, epitekadan biraz daha küçüktür. Diatom morfolojisi değişir. Hücrenin şekli tipik olarak dairesel olmasına rağmen, bazı hücreler üçgen, kare veya elips şeklinde olabilir. Ayırt edici özelliği, opalden (hidratlı, polimerize silisik asit) oluşan sert bir mineral kabuk veya früstüldür.

Diatomlar, frustule şekli ile ayırt edilen iki gruba ayrılır: merkezli diatomlar ve pennat diatomlar.

Pennate diatomları bilateral simetriktir. Valflerinin her biri, yarıklar boyunca yarıklar olan açıklıklara sahiptir ve kabukları tipik olarak bu yarıklara paralel olarak uzar. Her zaman katı yüzeyler boyunca hareket eden, raflar boyunca akan sitoplazma yoluyla hücre hareketi üretirler.

Merkezli diatomlar radyal olarak simetriktir. Üst ve alt valflerden oluşurlar - epitel ve hipoteka - her biri, birbirinin altında kolayca kayabilen ve diatomların ilerlemesi üzerinde hücre içeriğini artırmak için genişleyebilen bir valf ve bir kuşak bandından oluşur. Sentrik diatomun sitoplazması, kabuğun iç yüzeyi boyunca yer alır ve hücrenin merkezinde bulunan büyük vakuolün etrafında içi boş bir astar sağlar. Bu büyük, merkezi vakuol, deniz suyuna benzeyen ancak spesifik iyon içeriğine göre değişen "hücre özsuyu" olarak bilinen bir sıvı ile doldurulur. Sitoplazmik katman, kloroplastlar ve mitokondri gibi birkaç organele ev sahipliği yapar. Sentrik diatom genişlemeye başlamadan önce, çekirdeği valflerden birinin merkezindedir ve bölünme tamamlanmadan önce sitoplazmik tabakanın merkezine doğru hareket etmeye başlar. Merkezli diatomlar, kabuğun hangi eksenden uzandığına ve dikenlerin olup olmadığına bağlı olarak çeşitli şekil ve boyutlara sahiptir.

Çoğu merkezli ve araphid pennat diatomları hareketsizdir ve nispeten yoğun hücre duvarları onların kolayca batmalarına neden olur. Açık sudaki planktonik formlar, genellikle okyanus sularının üst katmanlarının rüzgarla türbülanslı karışımına dayanır ve onları güneşli yüzey sularında asılı tutar. Birçok planktonik diatom, dikenler veya kolonyal zincirlerde büyüme yeteneği gibi batma hızlarını yavaşlatan özellikler de geliştirmiştir. [29] Bu uyarlamalar, yüzey alanı-hacim oranını ve sürüklenmesini artırarak su sütununda daha uzun süre asılı kalmalarına olanak tanır. Bireysel hücreler, iyonik bir pompa aracılığıyla kaldırma kuvvetini düzenleyebilir. [30]

Bazı pennate diatomlar, rafe (valf yüzünde uzun bir yarık) yoluyla salgılanan yapışkan müsilaj yoluyla yüzeyler arasında hareket etmelerini sağlayan "kayma" adı verilen bir tür hareket yeteneğine sahiptir. [31] [32] Bir diatom hücresinin kayması için, müsilajın yapışması için katı bir alt tabakaya sahip olması gerekir.

Hücreler tek veya çeşitli koloniler halinde birleşmiştir ve silisli yapılar, müsilaj yastıkları, sapları veya tüpleri ile amorf müsilaj kütleleri veya hücrenin gerdirilmiş süreçleri yoluyla salgılanan kitin (polisakkarit) iplikleri ile bağlanabilir.

Üreme ve hücre boyutu Düzenle

Bu organizmalar arasında üreme, diatomun iki parçaya bölündüğü ve aynı genlere sahip iki "yeni" diatom ürettiği ikili fisyon ile aseksüeldir. Her yeni organizma, ebeveynin sahip olduğu ve şimdi epitel olarak adlandırılan ve ikinci, daha küçük bir frustülü, hipotekayı oluşturmak için kullanılan iki frustülden birini - biri daha büyük, diğeri daha küçük - alır. Daha büyük frustülü alan diatom, ebeveyni ile aynı boyuta gelir, ancak daha küçük frustülü alan diatom, ebeveyninden daha küçük kalır. Bu, bu diatom popülasyonunun ortalama hücre boyutunun azalmasına neden olur. [13] Bununla birlikte, bazı taksonların hücre boyutunda bir azalmaya neden olmadan bölünebilme yeteneğine sahip oldukları gözlemlenmiştir. [33] Bununla birlikte, boyut küçültmesine dayananlar için bir diatom popülasyonunun hücre boyutunu eski haline getirmek için cinsel üreme ve oksospor oluşumu gerçekleşmelidir. [13]

Hücre bölünmesi Düzenle

Diatomların vejetatif hücreleri diploiddir (2N) ve bu nedenle mayoz, erkek ve dişi gametler üreterek daha sonra zigotu oluşturmak üzere birleşebilir. Zigot, silika tekasını döker ve organik bir zarla, oksosporla kaplı geniş bir küreye dönüşür. Maksimum boyutta yeni bir diatom hücresi, ilk hücre, oksospor içinde oluşur ve böylece yeni bir nesil başlar. Dinlenme sporları, koşullar iyileştiğinde meydana gelen çimlenme ile olumsuz çevre koşullarına bir yanıt olarak da oluşturulabilir. [24]

Sperm motilitesi Düzenle

Diatomlar çoğunlukla hareketsizdir, ancak hareketlilik genellikle kayma hareketi ile sınırlı olsa da, bazı türlerde bulunan sperm kırbaçlanabilir. [24] Merkezli diatomlarda, küçük erkek gametlerde bir flagellum bulunurken, dişi gametler büyük ve hareketsizdir (oogam). Tersine, pennate diatomlarda her iki gamette de flagella (izogam) yoktur. [13] Bazı araphid türleri, yani rafe (dikiş) içermeyen pennat diatomlar anizogam olarak belgelenmiştir ve bu nedenle, merkezi ve raphid pennat diatomları, rafeli diatomlar arasında bir geçiş aşamasını temsil ettiği düşünülmektedir. [33]

Mikroplar tarafından bozunma

Okyanuslardaki ve göllerdeki belirli bakteri türleri, organik alg materyalini parçalamak için hidrolitik enzimler kullanarak ölü ve canlı diatomlarda silikanın çözünme hızını hızlandırabilir. [34] [35]

Dağıtım Düzenle

Diatomlar yaygın bir gruptur ve okyanuslarda, tatlı suda, toprakta ve nemli yüzeylerde bulunabilirler. Diğer fitoplankton gruplarından daha hızlı bölünebildikleri için, besin açısından zengin kıyı sularında ve okyanus bahar çiçeklerinde fitoplanktonun baskın bileşenlerinden biridirler. [39] Bazıları açık suda pelajik olarak yaşar, ancak bazıları su-tortu ara yüzeyinde (bentik) yüzey filmleri olarak veya hatta nemli atmosferik koşullar altında yaşar. Toplam okyanus birincil organik madde üretiminin tahmini %45'ine katkıda bulundukları okyanuslarda özellikle önemlidirler. [40] Deniz fitoplankton türlerinin mekansal dağılımı hem yatay hem de dikey olarak sınırlandırılmıştır. [41] [24]

Büyüme Düzenle

Tatlı su ve deniz ortamlarındaki planktonik diatomlar tipik olarak bir "patlama ve düşüş" (veya "Çiçek açmak ve büstü") yaşam tarzı. Üst karışık katmandaki (besinler ve ışık) koşullar uygun olduğunda (ilkbaharda olduğu gibi), rekabet güçleri ve hızlı büyüme oranları [39] fitoplankton topluluklarına ("patlama" veya "çiçeklenme") hakim olmalarını sağlar. "). Bu nedenle genellikle fırsatçı r-stratejistler olarak sınıflandırılırlar (yani ekolojisi yüksek bir büyüme oranı ile tanımlanan organizmalar, r).

Modern okyanus silikon döngüsüne katkı

Diatomlar, modern okyanus silikon döngüsüne önemli ölçüde katkıda bulunur: biyolojik üretimin büyük çoğunluğunun kaynağıdırlar.

Etki Düzenleme

tatlı su diatom Didymosphenia geminata, yaygın olarak bilinen Didim, çiçek açtığı su yollarında ciddi çevresel bozulmaya neden olur ve "kahverengi sümük" veya "kaya sümük" adı verilen büyük miktarlarda kahverengi jöle benzeri bir malzeme üretir. Bu diatom Avrupa'ya özgüdür ve hem antipodlarda hem de Kuzey Amerika'nın bazı bölgelerinde istilacı bir türdür. [42] [43] Sorun en sık Avustralya ve Yeni Zelanda'dan kaydedilmiştir. [44]

Koşullar elverişsiz hale geldiğinde, genellikle besinlerin tükenmesi üzerine, diatom hücreleri tipik olarak batma hızında artar ve üst karışık katmandan ("büstü") çıkar. Bu batma, kaldırma kuvveti kontrolünün kaybı, diyatom hücrelerini birbirine yapıştıran müsilaj sentezi veya ağır dinlenme sporları. Üst karışık katmandan dışarı batma, diatomları, otlak popülasyonları ve daha yüksek sıcaklıklar (aksi takdirde hücre metabolizmasını artıracak) dahil olmak üzere büyümeye elverişsiz koşullardan uzaklaştırır. Daha derin suya veya sığ deniz tabanına ulaşan hücreler, koşullar tekrar daha uygun hale gelene kadar dinlenebilirler. Açık okyanusta, birçok batan hücre derinlerde kaybolur, ancak sığınak popülasyonları termoklin yakınında kalabilir.

Nihayetinde, bu dinlenme popülasyonlarındaki diatom hücreleri, dikey karıştırma onları sürüklediğinde üst karışık katmana yeniden girer. Çoğu durumda, bu karıştırma aynı zamanda üst karışık katmandaki besinleri de yeniler ve bir sonraki diatom çiçeklenmesi için sahneyi hazırlar. Açık okyanusta (sürekli yükselme alanlarından uzakta [45]), bu çiçeklenme döngüsü, patlama ve daha sonra çiçeklenme öncesi koşullara dönüş, tipik olarak yıllık bir döngü boyunca gerçekleşir, diatomlar yalnızca ilkbahar ve yaz başlarında yaygındır. Bununla birlikte, bazı yerlerde, ışık seviyeleri büyüme için hala yeterliyken, yaz tabakalaşmasının bozulması ve besinlerin sürüklenmesinin neden olduğu bir sonbaharda çiçeklenme meydana gelebilir. Kış yaklaştıkça dikey karışım arttığından ve ışık seviyeleri düştüğünden, bu çiçekler bahar eşdeğerlerine göre daha küçük ve daha kısa ömürlüdür.

Açık okyanusta, diatom (yay) çiçeklenmesi tipik olarak silikon kıtlığı ile sona erer. Diğer minerallerden farklı olarak, silisyum gereksinimi diatomlara özgüdür ve plankton ekosisteminde örneğin nitrojen veya fosforlu besinler kadar verimli bir şekilde yenilenmez. Bu, yüzey besin konsantrasyonlarının haritalarında görülebilir - besinler gradyanlar boyunca azaldıkça, genellikle ilk tükenen silikondur (normalde nitrojen ve ardından fosfor gelir).

Bu çiçeklenme ve çöküş döngüsü nedeniyle, diatomların okyanus yüzey sularından karbon ihracında orantısız olarak önemli bir rol oynadığına inanılmaktadır [45] [46] (ayrıca biyolojik pompaya bakınız). Modern okyanusta silikonun biyojeokimyasal döngüsünün düzenlenmesinde de önemli bir rol oynarlar. [40] [36]

Başarı nedeni Düzenle

Diatomlar ekolojik olarak başarılıdır ve su içeren hemen hemen her ortamda oluşur - sadece okyanuslar, denizler, göller ve akarsular değil, aynı zamanda toprak ve sulak alanlar. [ kaynak belirtilmeli ] Diatomlar tarafından silikon kullanımının birçok araştırmacı tarafından bu ekolojik başarının anahtarı olduğuna inanılıyor. Raven (1983) [47], organik hücre duvarlarına göre, silika frustüllerinin sentezlemek için daha az enerji gerektirdiğini (karşılaştırılabilir bir organik duvarın yaklaşık %8'i), potansiyel olarak toplam hücre enerji bütçesinde önemli bir tasarruf olduğunu kaydetti. Artık klasik bir çalışmada, Egge ve Aksnes (1992) [38] mezokozm topluluklarının diatom baskınlığının doğrudan silisik asit mevcudiyeti ile ilişkili olduğunu bulmuşlardır – konsantrasyonlar 2 μmol m -3'ten büyük olduğunda, diyatomların tipik olarak daha fazla temsil ettiğini bulmuşlardır. fitoplankton topluluğunun %70'inden fazlası. Diğer araştırmacılar [48], diatom hücre duvarlarındaki biyojenik silisin, etkili bir pH tamponlama maddesi olarak hareket ettiğini ve bikarbonatın çözünmüş CO2'ye dönüşümünü kolaylaştırdığını öne sürmüşlerdir.2 (ki bu daha kolay asimile edilir). Daha genel olarak, silikon kullanmalarının sağladığı bu olası avantajlara rağmen, diatomlar tipik olarak aynı büyüklükteki diğer alglerden daha yüksek büyüme oranlarına sahiptir. [39]

Koleksiyon kaynakları Düzenle

Diatomlar birden fazla kaynaktan elde edilebilir. [49] Deniz diatomları doğrudan su örneklemesi ile toplanabilir ve bentik formlar midye, istiridye ve diğer kabukları kazıyarak sabitlenebilir. Diatomlar genellikle batık taşlar ve çubuklar üzerinde kahverengi, kaygan bir kaplama olarak bulunur ve nehir akıntısıyla "aktığı" görülebilir. Bir gölet, hendek veya lagünün yüzey çamuru hemen hemen her zaman bazı diatomlar verecektir. Canlı diatomlar genellikle çok sayıda filamentli alglere yapışmış veya çeşitli su altındaki bitkiler üzerinde jelatinimsi kütleler oluşturmuş halde bulunur. Kladofora sıklıkla kaplıdır Cocconeis, eliptik şekilli bir diatom Vaucheria genellikle küçük formlarla kaplıdır. Diyatomlar yumuşakçalar, tunikler ve balıkların besinlerinin önemli bir bölümünü oluşturduğundan, bu hayvanların beslenme yolları genellikle başka yollarla kolayca sağlanamayan biçimler verir. Bir kavanoza su ve çamur doldurularak, siyah kağıda sarılarak ve doğrudan güneş ışığının suyun yüzeyine düşmesine izin vererek diatomlar ortaya çıkarılabilir. Bir gün içinde, diatomlar bir pislik içinde tepeye çıkar ve izole edilebilir. [49]

Enerji kaynağı Düzenle

Diatomlar esas olarak fotosentetiktir, ancak birkaçı zorunlu heterotroflardır ve uygun bir organik karbon kaynağının mevcut olması koşuluyla ışığın yokluğunda yaşayabilir. [50] [51]

Silika metabolizması Düzenle

Diatom hücreleri, tipik olarak birbiriyle örtüşen, thecae adı verilen iki valften oluşan bir frustül olarak bilinen benzersiz bir silika hücre duvarı içinde bulunur. [52] Hücre duvarını oluşturan biyojenik silika, silisik asit monomerlerinin polimerizasyonu ile hücre içinde sentezlenir. Bu malzeme daha sonra hücrenin dışına ekstrüde edilir ve duvara eklenir. Çoğu türde, bir diatom iki yavru hücre üretmek için bölündüğünde, her hücre iki yarıdan birini tutar ve içinde daha küçük bir yarı büyür. Sonuç olarak, her bölünme döngüsünden sonra popülasyondaki ortalama diatom hücrelerinin boyutu küçülür. Bu tür hücreler, basitçe bölünmek yerine belirli bir minimum boyuta ulaştıklarında, bir oksospor oluşturarak bu düşüşü tersine çevirirler. Bu, çok daha büyük bir hücreye yol açmak için boyut olarak genişler ve daha sonra boyut küçültücü bölünmelere geri döner. [ kaynak belirtilmeli ] Oksospor üretimi hemen hemen her zaman mayoz bölünme ve eşeyli üreme ile bağlantılıdır.

Diatom tarafından absorbe edilen silisin hücre duvarına transferinin kesin mekanizması bilinmemektedir. Diatom genlerinin dizilenmesinin çoğu, frustüle nano ölçekli modellerde silika alımı ve birikimi mekanizmasının araştırılmasından gelir. Bu alanda en çok başarı iki türden gelmiştir, Thalassiosira pseudonanaTüm genom dizilendikçe ve genetik kontrol yöntemleri oluşturuldukça model tür haline gelen ve Cylindrotheca fusiformisÖnemli silika biriktirme proteinleri silafinlerin ilk keşfedildiği yer. [53] Silaffinler, polikatyonik peptit setleri bulundu. C. fusiformis hücre duvarları ve karmaşık silika yapıları oluşturabilir. Bu yapılar, diatom modellerine özgü boyutlarda gözenekler gösterdi. Ne zaman T. pseudonana Genom analizine tabi tutulduğunda, çoğu genomdan daha fazla sayıda poliamin ve ayrıca üç farklı silika taşıma genini içeren bir üre döngüsünü kodladığı bulundu. [54] 8 farklı diatom grubundan silika taşıma genleri üzerinde yapılan bir filogenetik çalışmada, silika taşınmasının genellikle türlerle gruplandığı bulunmuştur. [53] Bu çalışma ayrıca pennat (iki taraflı simetri) ve merkezli (radyal simetri) diatomların silika taşıyıcıları arasında yapısal farklılıklar buldu. Bu çalışmada karşılaştırılan diziler, silika biriktirme işleminde işlevi farklılaştıran kalıntıları tanımlamak için farklı bir arka plan oluşturmak için kullanıldı. Ek olarak, aynı çalışma bazı bölgelerin türler içinde korunduğunu, muhtemelen silika taşınımının temel yapısını bulmuştur.

Bu silika taşıma proteinleri, süngerler veya pirinç gibi diğer türlerde hiçbir homolog bulunmayan diatomlara özgüdür. Bu silika taşıma genlerinin farklılığı, aynı zamanda, gen duplikasyonunu veya dimerizasyonunu gösteren, beş zara bağlı bölümden oluşan iki tekrarlanan birimden gelişen protein yapısının da göstergesidir. [53] Diatomlarda zara bağlı keseciklerden meydana gelen silika birikiminin, silafinlerin ve uzun zincirli poliaminlerin aktivitesinin bir sonucu olduğu varsayılmıştır. Bu Silika Biriktirme Vezikül (SDV), Golgi'den türetilen veziküllerle kaynaşmış asidik bir bölme olarak karakterize edilmiştir. [55] Bu iki protein yapısının, diatom frustülleri ölçeğinde düzensiz gözeneklere sahip in-vivo desenli silika tabakaları oluşturduğu gösterilmiştir. Bu proteinlerin karmaşık yapı oluşturmak için nasıl çalıştığına dair bir hipotez, kalıntıların SDV'ler içinde korunduğudur; bu, mevcut sınırlı sayıda çeşitli diziler nedeniyle ne yazık ki tanımlanması veya gözlemlenmesi zordur. Silikanın yüksek oranda homojen birikiminin kesin mekanizması henüz bilinmemekle birlikte, Thalassiosira pseudonana silafinlere bağlı genler, nano ölçekli silika birikiminin genetik kontrolü için hedefler olarak aranmaktadır.

Üre döngüsü Düzenle

Diatomların bir özelliği, onları evrimsel olarak hayvanlara bağlayan üre döngüsüdür. Bu, Andrew Allen, Chris Bowler ve meslektaşları tarafından yürütülen araştırmada keşfedildi. Diatomların işleyen bir üre döngüsüne sahip olduğuna dair 2011 yılında yayınlanan bulguları oldukça önemliydi, çünkü bundan önce üre döngüsünün diatomlardan birkaç yüz milyonlarca yıl önce ortaya çıkan metazoanlardan kaynaklandığı düşünülüyordu. Çalışmaları, diatomlar ve hayvanlar üre döngüsünü farklı amaçlar için kullanırken, hayvanların ve bitkilerin olmadığı şekilde evrimsel olarak bağlantılı olduklarının görüldüğünü gösterdi. [56]

Pigmentler Düzenle

Diatomların başlıca pigmentleri klorofil a ve c, beta-karoten, fukoksantin, diatoksantin ve diadinoksantindir. [13]

Depolama ürünleri Düzenle

Diatomlar, çoğu klorofil a ve c açısından zengin plastidler içeren büyük bir protist grubuna aittir. Grup, çeşitli şekillerde heterokontlar, krizofitler, kromistler veya stramenopiller olarak adlandırılmıştır. Birçoğu, altın alg ve yosun gibi ototroflar ve su kalıpları, opalinidler ve aktinofrid heliozoa gibi heterotroflardır. Protistlerin bu alanının sınıflandırılması hala belirsizdir. Rütbe açısından, bir bölüm, filum, krallık veya bunların arasında bir şey olarak kabul edildiler. Sonuç olarak, diatomlar, genellikle olarak adlandırılan bir sınıftan herhangi bir yerde sıralanır. diatomofisi veya Bacillariophyceae, bir bölüme (= filum), genellikle denir Bacillariophyta, alt gruplarının saflarında karşılık gelen değişikliklerle.

Cins ve türler Düzenle

Guiry, 2012'ye [57] göre bugüne kadar yaklaşık 12.000'i adlandırılmış olan tahmini 20.000 mevcut diatom türünün var olduğuna inanılmaktadır (diğer kaynaklar daha geniş bir tahmin aralığı vermektedir [13] [58] [59] [60] ) . Hem mevcut hem de fosil olmak üzere yaklaşık 1.000-1.300 diatom cinsi tanımlanmıştır [61] [62] ve bunların 250-300 kadarı yalnızca fosil olarak mevcuttur. [63]

Sınıflar ve siparişler Düzenle

Uzun yıllar boyunca, ya bir sınıf (Bacillariophyceae) ya da bir filum (Bacillariophyta) olarak ele alınan diatomlar, merkezi ve pennat diatomlara (Centrales ve Pennales) karşılık gelen sadece 2 sıraya bölünmüştür. Bu sınıflandırma, diatomları daha yüksek bir sırada (zoolojik sınıflandırmada filuma karşılık gelen bölüm) tedavi eden ve merkezi diatomları tek bir sınıf Coscinodiscophyceae olarak koruyarak ana sınıflandırma birimlerini sınıflara terfi ettiren Round, Crawford ve Mann tarafından 1990 yılında kapsamlı bir şekilde elden geçirildi. , ancak eski pennate diatomları 2 ayrı sınıfa ayırıyor, Fragilariophyceae ve Bacillariophyceae (ikinci eski isim korundu, ancak değiştirilmiş bir tanımla), aralarında çoğunluğu yeni olan 45 siparişi kapsıyor.

Bugün (2020 ortalarında yazıyor), Round ve diğerlerinin 1990 sisteminin. daha yeni moleküler çalışmaların ortaya çıkmasıyla revizyona ihtiyaç duyuyor, ancak bunun yerini alacak en iyi sistem belirsiz ve AlgaeBase, Dünya Deniz Türleri Kaydı ve katkıda bulunan veritabanı DiatomBase ve sistem gibi yaygın olarak kullanılan mevcut sistemler " Ruggiero ve diğerleri, 2015'te temsil edilen tüm yaşam", tümü Round ve diğerleri. her ne kadar bir bütün olarak diatomlar bölüm/filum yerine bir sınıf olarak muamele görse de temel olarak muamele ve Round ve arkadaşlarının sınıfları, filogenetik olarak bitişik grupların ve onları içeren taksonların tedavisi ile daha iyi uyum sağlamak için alt sınıflara indirgenmiştir. (Referanslar için aşağıdaki ayrı bölümlere bakın).

2004 yılında başlayan Linda Medlin ve iş arkadaşları tarafından yapılan bir öneri, pennatlarla daha yakından ilişkili olduğu düşünülen bazı merkezi diatom düzenlerinin yeni bir sınıf olarak ayrılmasıdır, Mediophyceae, kendisi pennate diatomlarla daha yakından hizalanır. kalan merkezler. Daha sonra Coscinodiscophyceae-Mediophyceae-Bacillariophyceae veya Coscinodiscophyceae+(Mediophyceae+Bacillariophyceae) (CMB) hipotezi olarak adlandırılan bu hipotez, D.G. Adl'de sunulduğu gibi diatomların sınıflandırılması için temel olarak kullanan diğerleri arasında Mann. ve arkadaşlarının sentez serisi (2005, 2012, 2019) ve ayrıca 2017 yılının Bacillariophyta bölümünde Protistlerin El Kitabı Archibald ve diğerleri tarafından düzenlendi, Medlin ve ark. orijinal "Coscinodiscophyceae". Bu arada, EC Theriot liderliğindeki bir grup, yapısal derecelendirme hipotezi (SGH) olarak adlandırılan ve Mediophyceae'yi monofiletik bir grup olarak tanımayan farklı bir filogeni hipotezini desteklerken, başka bir analiz, Parks ve diğerleri, 2018, radyal merkezli diatomların (Medlin ve arkadaşlarının Coscinodiscophyceae'si) monofiletik olmadığını, ancak Mediophyceae eksi monofilisini desteklediğini bulur. Attheya, anormal bir cins. Bu çelişkili planların göreceli değerlerinin tartışılması, ilgili çeşitli taraflarca devam etmektedir. [64] [65] [66] [67]

Adl ve diğerleri, 2019 tedavisi Düzenle

2019 yılında Adl et al. [68] diatomların aşağıdaki sınıflandırmasını sunmuş ve şunu not etmiştir: "Bu revizyon, son on yılda diatomların filogenisindeki sayısız ilerlemeyi yansıtmaktadır. Mediophyceae ve pennat diatomlar dışındaki zayıf takson örneklememiz ve bilinen ve beklenen çeşitlilik nedeniyle tüm diatomlar arasında, birçok klad yüksek bir sınıflandırma seviyesinde görünür (ve daha yüksek seviyeli sınıflandırma oldukça düzdür). Bu sınıflandırma, diatomları bir filum (Diatomeae/Bacillariophyta) olarak ele alır, Medlin ve çalışma arkadaşlarının Mediophyceae sınıfını kabul eder, başka türlü izole edilmiş bir dizi cins için yeni alt filumlar ve sınıflar sunar ve daha önce oluşturulmuş bir dizi taksonu alt sınıflar olarak yeniden sıralar, ancak siparişleri veya aileleri listelemez. Anlaşılması için çıkarsanan sıralar eklenmiştir (Adl. ve diğerleri, sıraları kullanmaz, ancak sınıflandırmanın bu bölümünde amaçlananlar, kullanılan botanik isimlendirme sistemi içinde kullanılan sonların seçiminden açıktır).

  • Clade Diatomista Derelle ve ark. 2016, düzelt. Cavalier-Smith 2017 (diatomlar artı diğer okrofit gruplarının bir alt kümesi)
  • Phylum Diatomeae Dumortier 1821 [= Bacillariophyta Haeckel 1878] (diatomlar)
  • Subphylum Leptocylindrophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019
  • Sınıf Leptocylindrophyceae D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (Leptocylindrus, Tenuicilindrus)
  • Sınıf Corethrophyceae D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (çekirdekron)
  • Subphylum Ellerbeckiophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (Ellerbeckia)
  • Subphylum Probosciophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (hortum)
  • Subphylum Melosirophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (Aulacoseira, melosira, hyalodiskus, Stephanopyxis, paralia, Endictya)
  • Subphylum Coscinodiscophytina Medlin & Kaczmarska 2004, düzeltme. (Aktinoptikus, kozinodiskus, aktinosiklus, asteromfalus, Aulacodiscus, stellarima)
  • Subphylum Rhizosoleniophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (Guinardia, rizosoleni, yalancı)
  • Subphylum Arachnoidiscophytina D.G. Mann, Adl ve ark. 2019 (araknoidiskus)
  • Subphylum Bacillariophytina Medlin & Kaczmarska 2004, düzeltme.
  • Sınıf Mediophyceae Jouse & Proshkina-Lavrenko içinde Medlin & Kaczmarska 2004
  • Alt sınıf Chaetocerotophycidae Round & R.M. Crawford, Round ve ark. 1990, düzelt.
  • Alt sınıf Lithodesmiophycidae Round & R.M. Crawford, Round ve ark. 1990, düzelt.
  • Alt sınıf Thalassiosirophycidae Round & R.M. Crawford, Round ve ark. 1990
  • Alt sınıf Cymatosirophycidae Round & R.M. Crawford, Round ve ark. 1990
  • Alt sınıf Odontellophycidae D.G. Mann, Adl ve ark. 2019
  • Alt sınıf Chrysanthemodiscophycidae D.G. Mann, Adl ve ark. 2019
  • Sınıf Biddulphiophyceae D.G. Mann, Adl ve ark. 2019
  • Alt sınıf Biddulphiophycidae Round ve R.M. Crawford, Round ve ark. 1990, düzelt.
  • Biddulphiophyceae incertae sedis (Attheya)
  • Sınıf Bacillariophyceae Haeckel 1878, düzeltme.
  • Bacillariophyceae incertae sedis (Striatellaceae)
  • Alt sınıf Urneidophycidae Medlin 2016
  • Round'da Fragilariophycidae Round alt sınıfı, Crawford & Mann 1990, düzeltme.
  • Alt sınıf Bacillariophycidae D.G. Mann in Round, Crawford & Mann 1990, düzeltme.

diyatome Surirella sarmal

Diatomlar Thalassiosira sp. bir membran filtre üzerinde, gözenek boyutu 0,4 μm.

diyatome paralia sulcata.

diyatome Achanthes trinodis

Menşe Düzenle

Heterokont kloroplastları, bitkilerde meydana gelen doğrudan prokaryotlardan ziyade kırmızı alglerinkinden türemiş görünmektedir. Bu, diğer birçok algden daha yeni bir kökene sahip olduklarını gösteriyor. Bununla birlikte, fosil kanıtları yetersizdir ve heterokontlar sadece diatomların evrimi ile fosil kayıtları üzerinde ciddi bir izlenim bırakmaktadır.

En eski fosiller

Bilinen en eski fosil diatomları erken Jura dönemine aittir (

185 Ma önce), [69] moleküler saat [69] ve tortul [70] kanıtlar daha erken bir kökene işaret etse de. Kökenlerinin Permiyen sonu kitlesel yok oluşuyla ilişkili olabileceği öne sürülmüştür.

250 Ma), ardından birçok deniz nişi açıldı. [71] Bu olay ile fosil diatomlarının ilk ortaya çıktığı zaman arasındaki boşluk, diatomların silisleşmediği ve evrimlerinin şifreli olduğu bir döneme işaret ediyor olabilir. [72] Silisleşmenin ortaya çıkmasından bu yana, diyatomlar, erken Kretase kadar eski bir yerde bulunan büyük fosil yatakları ve neredeyse tamamen bunlardan oluşan diyatomlu toprak gibi bazı kayalar ile fosil kayıtları üzerinde önemli bir etki yarattı.

Silikon döngüsü ile ilişkisi Düzenle

Diatomlar Triyas'tan beri var olmuş olsalar da, yükselişlerinin ve silikon döngüsünün "devralmalarının" zamanlaması daha yakın zamanlarda meydana geldi. Fanerozoyikten (544 milyon yıl önce) önce, mikrobiyal veya inorganik süreçlerin okyanusun silikon döngüsünü zayıf bir şekilde düzenlediğine inanılır. [73] [74] [75] Daha sonra, döngü radyolaryalılar ve silisli süngerler tarafından domine edilir (ve daha güçlü bir şekilde düzenlenir), ilki zooplankton, ikincisi ise esas olarak kıta sahanlıklarında yerleşik filtre besleyiciler olarak görülür. [76] Son 100 My içinde silikon döngüsünün daha da sıkı kontrol altına alındığı ve bunun diatomların ekolojik üstünlüğünden kaynaklandığı düşünülmektedir.

Bununla birlikte, "devralmanın" kesin zamanlaması belirsizliğini koruyor ve farklı yazarların fosil kayıtları hakkında çelişkili yorumları var. Silisli süngerlerin raflardan yer değiştirmesi gibi bazı kanıtlar [77] bu devralmanın Kretase'de (146 My - 66 My) başladığını, radyolaryalılardan elde edilen kanıtlar ise "devralmanın" Senozoyik'e kadar başlamadığını öne sürüyor ( 66 Ma'ya kadar). [78]

Çayırlarla ilişkisi Düzenle

Miyosen sırasında otlak biyomlarının genişlemesi ve otların evrimsel radyasyonunun, çözünebilir silikonun okyanuslara akışını arttırdığına inanılıyor ve bunun, Cenozoik çağda diatomları teşvik ettiği iddia edildi. [79] [80] Son çalışmalar, orta Miyosen'den itibaren hem diatom hem de otlak çeşitliliğinin güçlü bir şekilde artmasına rağmen, diatom başarısının otların evriminden ayrıldığını göstermektedir. [81]

İklim ile ilişkisi Düzenle

Cenozoik üzerindeki diatom çeşitliliği, küresel sıcaklığa, özellikle ekvator-kutup sıcaklık gradyanına çok duyarlı olmuştur. Daha sıcak okyanusların, özellikle daha sıcak kutup bölgelerinin geçmişte önemli ölçüde daha düşük diatom çeşitliliğine sahip olduğu gösterilmiştir. Küresel ısınma senaryolarında öngörüldüğü gibi, artan kutupsal ısınmaya sahip gelecekteki sıcak okyanuslar [82] bu nedenle teorik olarak önemli bir diatom çeşitliliği kaybıyla sonuçlanabilir, ancak mevcut bilgilere göre bunun hızlı bir şekilde mi yoksa yalnızca birçok kez mi olacağını söylemek mümkün değildir. on binlerce yıl. [81]

Soruşturma Yöntemi Düzenle

Diyatomların fosil kayıtları, büyük ölçüde deniz ve deniz dışı tortullarda silisli frustüllerinin geri kazanılmasıyla oluşturulmuştur. Diatomların hem deniz hem de deniz dışı stratigrafik kaydı olmasına rağmen, zaman kısıtlı evrimsel oluşumlara ve benzersiz taksonların yok oluşlarına dayanan diatom biyostratigrafisi yalnızca iyi gelişmiştir ve deniz sistemlerinde yaygın olarak uygulanabilir. Diatom türlerinin aralıklarının süresi, karada açığa çıkan okyanus çekirdekleri ve kaya dizilimlerinin incelenmesi yoluyla belgelenmiştir. [83] Diatom biyozonlarının iyi kurulduğu ve jeomanyetik polarite zaman ölçeğine göre kalibre edildiği yerlerde (örneğin, Güney Okyanusu, Kuzey Pasifik, doğu ekvator Pasifik), tipik yaş çözünürlüğü olmasına rağmen, diyatome dayalı yaş tahminleri <100.000 yıl içinde çözülebilir. Senozoik diatom toplulukları için birkaç yüz bin yıldır.

Göl çökellerinde korunan diatomlar, özellikle su derinliği ve tuzluluk dalgalanmaları yaşayan kapalı havza gölleri için Kuvaterner ikliminin paleo-çevresel rekonstrüksiyonlarında yaygın olarak kullanılmaktadır.

Çeşitlendirme Düzenle

Diyatomların Kretase kayıtları sınırlıdır, ancak son çalışmalar diatom tiplerinin ilerleyici bir çeşitlendirmesini ortaya koymaktadır. Okyanuslarda kalkerli iskeletlere sahip organizmaları çarpıcı biçimde etkileyen Kretase-Paleojen neslinin tükenmesi olayının, diatom evrimi üzerinde nispeten az etkisi olduğu görülüyor. [84]

Ciro Düzenleme

Senozoyik sırasında deniz diyatomlarının kitlesel yok oluşları gözlemlenmemiş olsa da, deniz diatom tür topluluklarında nispeten hızlı evrimsel dönüşüm zamanları, Paleosen-Eosen sınırına yakın [85] ve Eosen-Oligosen sınırında meydana geldi. [86] Kutup bölgelerinin giderek soğumasına ve daha endemik diatom topluluklarının gelişmesine yanıt olarak, Orta Miyosen ve geç Pliyosen arasında çeşitli zamanlarda toplulukların daha fazla devri gerçekleşti.

Oligosen'den Kuvaterner'e kadar daha hassas diatom frustüllerine yönelik küresel bir eğilim kaydedilmiştir. [83] Bu, Antarktika'daki büyük buz tabakası genişlemesinin başlangıcında artan enlemsel termal gradyanların ve Neojen ve Kuvaterner boyunca iki kutuplu bir buzullu dünyaya doğru ilerleyen soğumanın neden olduğu okyanus yüzeyinin ve derin suların giderek daha güçlü bir sirkülasyonu ile çakışmaktadır. Bu, diatomların frustüllerinin oluşumu için daha az silika almasına neden oldu. Okyanusların artan karışımı, yüzey sularında, özellikle kıyı ve okyanus yükselmesi bölgelerinde diatom büyümesi için gerekli olan silika ve diğer besin maddelerini yeniler.

Ekspres dizi etiketleme Düzenle

2002 yılında, mülkün özelliklerine ilişkin ilk görüşler Phaeodactylum tricornutum gen repertuarı, 1.000 eksprese edilmiş dizi etiketi (EST'ler) kullanılarak tarif edildi. [88] Daha sonra, EST sayısı 12.000'e çıkarılmış ve fonksiyonel analizler için diatom EST veri tabanı oluşturulmuştur. [89] Bu diziler arasında karşılaştırmalı bir analiz yapmak için kullanılmıştır. P. trikornutum ve yeşil algden gelen varsayılan tam proteomlar Chlamydomonas reinhardtii, kırmızı alg Cyanidioschyzon merolae, ve diatom Thalassiosira pseudonana. [90] Diatom EST veri tabanı artık 200.000'den fazla EST'den oluşmaktadır. P. trikornutum (16 kütüphane) ve T. pseudonana (7 kitaplık) birçoğu farklı abiyotik streslere karşılık gelen bir dizi farklı koşulda büyümüş hücreler. [91]

Genom dizileme Düzenle

2004 yılında, merkezi diatomun tüm genomu, Thalassiosira pseudonana (32.4 Mb) sekanslandı, [92] bunu 2008'de pennate diatomun sekanslanmasıyla takip etti, Phaeodactylum tricornutum (27.4 Mb). [93] İkisinin karşılaştırılması, P. trikornutum genom daha az gen içerir (11.776'ya karşı 10.402) T. pseudonana iki genom arasında büyük bir sentez (gen sırası) tespit edilememiştir. T. pseudonana genler ortalama gösterir

0.79'da gen başına 1.52 intron P. trikornutum, merkezi diatomda son zamanlarda yaygın intron kazancı olduğunu düşündürür. [93] [94] Nispeten yeni evrimsel farklılığa (90 milyon yıl) rağmen, merkezler ve pennatlar arasındaki moleküler ayrışmanın boyutu, diğer ökaryotik gruplara kıyasla Bacillariophyceae içinde hızlı evrim oranlarına işaret eder. [93] Karşılaştırmalı genomik ayrıca, belirli bir transpoze edilebilir elementler sınıfının, Diatom Copia-benzeri retrotranspozonların (veya CoDis'in) P. trikornutum ile ilgili olarak genom T. pseudonana, ilgili genomların %5,8 ve %1'ini oluşturur. [95]

Endosimbiyotik gen transferi Düzenle

Diatom genomiği, endosimbiyotik gen transferi (EGT) sürecinin kapsamı ve dinamikleri hakkında çok fazla bilgi getirdi. karşılaştırması T. pseudonana diğer organizmalarda homologları olan proteinler, yüzlerce kişinin Plantae soyunda en yakın homologlarına sahip olduğunu ileri sürdü. Diatom genomlarına yönelik EGT, T. pseudonana genom tarafından kodlanan genlerle en yakından ilişkili olan altı proteini kodlar. Guillardia teta (kriptomonad) nükleomorf genomu. Bu genlerin dördü ayrıca kırmızı alg plastid genomlarında bulunur, böylece kırmızı alg plastidinden kırmızı alg çekirdeğine (nükleomorf) ve heterokont konakçı çekirdeğine kadar ardışık EGT gösterir. [92] Diatom proteomlarının daha yakın tarihli filogenomik analizleri, Plantae kökenli diatom genlerinin %70'inin yeşil soy kökenli olduğu ve bu tür genlerin de bulunduğu gerçeğiyle desteklenen kromalveolatların ortak atasında prasinofit benzeri bir endosimbiyont için kanıt sağlamıştır. diğer stramenopillerin genomunda. Bu nedenle, kromalveolatların, önce yeşil bir alg ile seri ikincil endosimbiyozun ürünü olduğu, ardından bir öncekinin genomik ayak izlerini koruyan ancak yeşil plastidin yerini alan kırmızı bir alg ile ikincisinin geldiği öne sürülmüştür. [96] Bununla birlikte, diatom proteomlarının ve kromalveolat evrimsel tarihinin filogenomik analizleri, muhtemelen kırmızı algler gibi yetersiz sıralanmış soylardan gelen tamamlayıcı genomik verilerden yararlanacaktır.

Yatay gen transferi Düzenle

EGT'ye ek olarak, yatay gen transferi (HGT), endosimbiyotik bir olaydan bağımsız olarak gerçekleşebilir. Yayınlanması P. trikornutum genom, en az 587 olduğunu bildirdi P. trikornutum genler, bakteri genleri ile en yakından ilişkili görünmektedir ve bu genlerin %5'inden fazlasını oluşturmaktadır. P. trikornutum proteom. Bunların yaklaşık yarısı aynı zamanda T. pseudonana genom, diatom soyuna eski dahil olduklarını doğrular. [93]

Genetik Mühendisliği Düzenle

Jeokimyasal döngülerde diatomların büyük öneminin altında yatan biyolojik mekanizmaları anlamak için bilim adamları, Phaeodactylum tricornutum ve Thalassiosira spp. 90'lardan beri model organizmalar olarak türler. [97] Mutantlar veya transgenik çizgiler oluşturmak için şu anda birkaç moleküler biyoloji aracı mevcuttur: transgenleri içeren plazmitler, biyolistik yöntem [98] veya transkingdom bakteriyel konjugasyonu [99] (sırasıyla 10 −6 ve 10 −4 verimle) kullanılarak hücrelere yerleştirilir. [98] [99] ) ve elektroporasyon veya PEG kullanımı gibi diğer klasik transfeksiyon yöntemlerinin daha düşük verimli sonuçlar sağladığı bildirilmiştir. [99]

Transfekte edilmiş plazmitler, diatomun kromozomlarına rastgele entegre edilebilir veya stabil dairesel epizomlar olarak muhafaza edilebilir (CEN6-ARSH4-HIS3 maya sentromerik dizisi sayesinde [99]). Fleomisin/zeosin direnç geni Sh Ble yaygın olarak bir seçim belirteci olarak kullanılır, [97] [100] ve çeşitli transgenler başarılı bir şekilde dahil edilmiş ve diatomlarda nesiller boyunca stabil aktarımlar [99] [100] veya olasılığı ile ifade edilmiştir. onu kaldır. [100]

Ayrıca, bu sistemler artık CRISPR-Cas genom baskı aracının kullanılmasına izin vererek, işlevsel nakavt mutantların hızlı bir şekilde üretilmesine [100] [101] ve diatomların hücresel işlemlerinin daha doğru bir şekilde anlaşılmasına yol açmaktadır.

Paleontoloji Düzenle

Diyatomların ayrışması ve çürümesi, organik ve inorganik (silikatlar şeklinde) tortuya yol açar; bunun inorganik bileşeni, inorganik madde gömülü olduğu için okyanus tabanlarının veya körfez çamurlarının çekirdekleri ile geçmiş deniz ortamlarını analiz etme yöntemine yol açabilir. killerin ve siltlerin birikmesi ve bu tür deniz katmanlarının kalıcı bir jeolojik kaydını oluşturur (bkz. silisli sızıntı).

Endüstriyel Düzenleme

Diatomlar ve diatomit veya diyatomlu toprak olarak kabukları (frustüller), ince cilalama ve sıvı filtrasyonu için kullanılan önemli endüstriyel kaynaklardır. Mikroskobik kabuklarının karmaşık yapısı, nanoteknoloji için bir malzeme olarak önerilmiştir. [102]

Diatomit doğal bir nano malzeme olarak kabul edilir ve çeşitli seramik ürünlerin üretimi, inşaat seramikleri, refrakter seramikler, özel oksit seramikler, nem kontrol malzemeleri üretimi, filtrasyon malzemesi olarak kullanılan, çimentoda malzeme gibi birçok kullanım ve uygulamaya sahiptir. üretim endüstrisi, uzun süreli salınımlı ilaç taşıyıcılarının üretimi için başlangıç ​​malzemesi, endüstriyel ölçekte absorpsiyon malzemesi, gözenekli seramik üretimi, cam endüstrisi, katalizör desteği olarak kullanılan, plastik ve boyalarda dolgu maddesi olarak, endüstriyel suların arıtılması, pestisit tutucu, belirli toprakların fiziksel ve kimyasal özelliklerini ve diğer kullanımları iyileştirmek için. [103] [104] [105]

Diatomlar ayrıca deniz suyu da dahil olmak üzere onları içeren malzemelerin kökenini belirlemeye yardımcı olmak için kullanılır.

Adli Düzenleme

Adli tıpta diatom analizinin temel amacı, bir cesedin ölüm sonrası suya daldırılmasından daldırma yoluyla bir ölümü ayırt etmektir. Laboratuvar testleri vücutta diatomların varlığını ortaya çıkarabilir. Diatomların silika bazlı iskeletleri kolayca bozunmadığından, bazen aşırı derecede ayrışmış gövdelerde bile tespit edilebilirler. Vücutta doğal olarak oluşmadıkları için, laboratuvar testleri cesette, cesedin bulunduğu suda bulunan aynı türden diatomlar gösteriyorsa, bu ölüm nedeni olarak boğulmanın iyi bir kanıtı olabilir. Bir cesette bulunan diatom türlerinin karışımı, çevredeki su ile aynı veya farklı olabilir, bu da kurbanın cesedin bulunduğu yerde boğulup boğulmadığını gösterir. [106]

Nanoteknoloji Düzenle

Silikanın diatomlar tarafından biriktirilmesinin de nanoteknoloji için faydalı olduğu kanıtlanabilir. [107] Diatom hücreleri, çeşitli şekil ve boyutlarda valfleri tekrar tekrar ve güvenilir bir şekilde üreterek, potansiyel olarak diatomların, aşağıdakiler de dahil olmak üzere bir dizi cihazda kullanılabilecek mikro veya nano ölçekli yapılar üretmesine izin verir: optik sistemler, yarı iletken nanolitografi ve hatta ilaç için araçlar teslimat. Uygun bir yapay seçim prosedürüyle, belirli şekil ve boyutlarda valfler üreten diatomlar, nano ölçekli bileşenleri seri üretmek için kemostat kültürlerinde yetiştirme için geliştirilebilir. [108] Diatomların normalde hücre duvarlarını oluşturmak için kullandıkları silikon dioksit yerine ışığa duyarlı titanyum dioksit ikame edilerek güneş pillerinin bir bileşeni olarak kullanılabileceği de öne sürülmüştür. [109] Diatom biyoyakıt üreten güneş panelleri de önerilmiştir. [110]

Bilimsel literatürde resmi olarak tanımlanan ilk diatom olan kolonyal Bacillaria paradoksa, 1783 yılında Danimarkalı doğa bilimci Otto Friedrich Müller tarafından keşfedildi.

  1. ^ Dangeard, P. (1933). Özellik d'Algologie. Paul Lechvalier ve Fils, Paris, [1].
  2. ^ Dumortier, B.-C. (1822). Yorumlar botanik. Gözlemler botanikler, dédiées à la Société d'Horticulture de Tournay (PDF) . Turnuva: Imprimerie de Ch. Casterman-Dieu, Rue de pont No. 10. pp. [i], [1]-116, [1, tabl., err.] 6 Ekim 2015 tarihinde Algaebase aracılığıyla orijinalinden (PDF) arşivlendi.
  3. ^ Rabenhorst, L. Flora europaea algarum aquae dulcis ve denizaltı (1864–1868). Bölüm I. Algas diatomaceas tamamlar, cum figuris generum omnium xylographice impressis (1864). s. 1-359. Lipsiae [Leipzig]: Apud Eduardum Kummerum.
  4. ^ Haeckel, E. (1878). Das Protistenreich.
  5. ^ Engler, A. ve Gilg, E. (1919). Müfredat Ailesi: eine Übersicht über das gesamte Pflanzensystem mit besonderer Berücksichtichtigung der Medizinal- ve Nutzpflanzen, nebst einer Übersicht über die Florenreiche und Florengebiete der Erdeische und Florengebiete der Erdei zumor Gebrauch'un en iyileri., 8. baskı, Gebrüder Borntraeger Verlag, Berlin, 395 s.
  6. ^dia-tom-os "yarıya kes" (= dicho-tom-os) – dia "aracılığıyla" veya "ayrı" ve kökü tém-n-o "Kestim". arasında geçiş e ve Ö fiil kökü ablaut'tur.
  7. ^
  8. "DIATOM'un Tanımı". www.merriam-webster.com. 29 Temmuz 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. 30 Temmuz 2018 alındı.
  9. ^Soluduğunuz Hava? Bunu Yapan Bir Diatom
  10. ^
  11. "Diatom nedir?". Kuzey Amerika'nın Diatomları. 25 Ocak 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Ocak 2020 .
  12. ^
  13. Treguer, P. Nelson, D.M. Van Bennekom, A.J. Demaster, D.J. Leynaert, A. Queguiner, B. (1995). "Dünya Okyanusunda Silika Dengesi: Yeniden Tahmin". Bilim. 268 (5209): 375–9. Bibcode: 1995Sci. 268..375T. doi:10.1126/bilim.268.5209.375. PMID17746543. S2CID5672525.
  14. ^
  15. "King's College London - Megachad Gölü". www.kcl.ac.uk . Erişim tarihi: 5 Mayıs 2018 .
  16. ^
  17. Bristow, C.S. Hudson-Edwards, K.A. Chappell, A. (2010). "Batı Afrika tozu ile Amazon ve Ekvator Atlantik Gübreleme". jeofizik. Araş. Letonya. 37 (14): L14807. Bibcode:2010GeoRL..3714807B. doi:10.1029/2010GL043486.
  18. ^ aBCNSeFG
  19. Grethe R. Hasle Erik E. Syvertsen Karen A. Steidinger Karl Tangen (25 Ocak 1996). "Deniz Diyatomları". Carmelo R. Tomas'ta (ed.). Deniz Diatomlarını ve Dinoflagellatları Tanımlama. Akademik Basın. s. 5–385. ISBN978-0-08-053441-1 . 13 Kasım 2013 alındı.
  20. ^
  21. "Gaz toplama araçları".
  22. ^
  23. "Diatomlar hakkında daha fazlası". Kaliforniya Üniversitesi Paleontoloji Müzesi. 4 Ekim 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Mayıs 2015 .
  24. ^
  25. Nakayama, T. Kamikawa, R. Tanifuji, G. Kashiyama, Y. Ohkouchi, N. Archibald, J. M. Inagaki, Y. (2014). "Bir diatomda fotosentetik olmayan bir siyanobakterinin tam genomu, hücre içi bir yaşam tarzına son uyarlamaları ortaya koymaktadır". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 111 (31): 11407–11412. Bibcode:2014PNAS..11111407N. doi:10.1073/pnas.1405222111. PMC4128115 . PMID25049384.
  26. ^
  27. Wehr, J.D. Sheath, R.G. Kociolek, J.P., ed. (2015). Kuzey Amerika Tatlısu Algleri: Ekoloji ve Sınıflandırma (2. baskı). San Diego: Akademik Basın. ISBN978-0-12-385876-4 .
  28. ^
  29. Girard, Vincent Saint Martin, Simona Buffetaut, Eric Saint Martin, Jean-Paul Néraudeau, Didier Peyrot, Daniel Roghi, Guido Ragazzi, Eugenio Suteethorn, Varavudh (2020). "Tay kehribar: erken diatom tarihine ilişkin görüşler?". BSGF - Yer Bilimleri Bülteni. 191: 23. doi: 10.1051/bsgf/2020028 . ISSN1777-5817.
  30. ^ Colin, S., Coelho, LP, Sunagawa, S., Bowler, C., Karsenti, E., Bork, P., Pepperkok, R. ve De Vargas, C. (2017) "Hücre biyolojisi için nicel 3D-görüntüleme ve çevresel mikrobiyal ökaryotların ekolojisi". e-hayat, 6: e26066. doi:10.7554/eLife.26066.002. Materyal, Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı altında bulunan bu kaynaktan kopyalanmıştır.
  31. ^Subarktik Pasifik Okyanusu'nun İç AlanıNASA Dünya Keşifleri, 4 Eylül 2018. Bu makale, kamu malı olan bu kaynaktan alınan metni içermektedir.
  32. ^
  33. Rousseaux, Cecile S. Gregg, Watson W. (2015). "Küresel fitoplankton bileşiminde son on yıllık eğilimler". Küresel Biyojeokimyasal Döngüler. 29 (10): 1674-1688. Bibcode:2015GBioC..29.1674R. doi: 10.1002/2015GB005139 .
  34. ^
  35. Parker, Andrew R. Townley, Helen E. (2007). "Fotonik nanoyapıların biyomimetiği". Doğa Nanoteknoloji. 2 (6): 347–53. Bibcode:2007NatNa. 2.347P. doi:10.1038/nnano.2007.152. PMID18654305.
  36. ^
  37. Gordon, Richard Losic, Dusan Tiffany, Mary Ann Nagy, Stephen S. Sterrenburg, Frithjof A.S. (2009). "Cam Menagerie: Nanoteknolojide yeni uygulamalar için Diatomlar". Biyoteknolojideki Eğilimler. 27 (2): 116-27. doi:10.1016/j.tibtech.2008.11.003. PMID19167770.
  38. ^ aBCNSe
  39. Rita A. Horner (2002). Bazı yaygın deniz fitoplanktonları için taksonomik bir rehber. Biyopres. s. 25-30. ISBN978-0-948737-65-7 . 13 Kasım 2013 alındı.
  40. ^
  41. "Doğada Cam". Corning Cam Müzesi. 7 Mart 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Şubat 2013 .
  42. ^ Taylor, J.C., Harding, W.R. ve Archibald, C. (2007). Güney Afrika'dan Bazı Yaygın Diatom Türleri İçin Resimli Bir Kılavuz. Gezina: Su Araştırma Komisyonu. 9781770054844.
  43. ^ Mishra, M., Arukha, A.P., Bashir, T., Yadav, D. and Prasad, G.B.K.S. (2017) "Diatomların tüm yeni yüzleri: potansiyel nanomalzeme kaynağı ve ötesi". Mikrobiyolojide sınırlar, 8: 1239. doi:10.3389/fmicb.2017.01239. Materyal, Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı altında bulunan bu kaynaktan kopyalanmıştır.
  44. ^ aB
  45. Zhang, D. Wang, Y. Cai, J. Pan, J. Jiang, X. Jiang, Y. (2012). "Diatome mikro ve nano yapıya dayalı biyo-üretim teknolojisi". Çin Bilim Bülteni. 57 (30): 3836-3849. Bibcode:2012ChSBu..57.3836Z. doi: 10.1007/s11434-012-5410-x .
  46. ^
  47. Padisák, Judit Soróczki-Pintér, Éva Rezner, Zsuzsanna (2003), Martens, Koen (ed.), "Bazı fitoplankton şekillerinin batma özellikleri ve form direncinin planktonun morfolojik çeşitliliğiyle ilişkisi – deneysel bir çalışma" (PDF), Sudaki Biyoçeşitlilik: Henri J. Dumont Onuruna Bir Kutlama Kitabı, Developments in Hydrobiology, Springer Hollanda, pp. 243–257, doi:10.1007/978-94-007-1084-9_18, ISBN9789400710849 , orijinalinden arşivlendi (PDF) 23 Temmuz 2018 , alındı ​​4 Ekim 2019
  48. ^
  49. Anderson, Lars W.J. Sweeney, Beatrice M. (1 Mayıs 1977). "Ditylum brightwelli'nin sedimantasyon özelliklerindeki Diel değişiklikleri: Hücresel lipiddeki değişiklikler ve solunum inhibitörlerinin ve iyon taşıma değiştiricilerinin etkileri1". Limnoloji ve Oşinografi. 22 (3): 539-552. Bibcode:1977LimOc..2..539A. doi:10.4319/lo.1977.22.3.0539. ISSN1939-5590.
  50. ^
  51. Poulsen, Nicole C. Spector, Ilan Spurck, Timothy P. Schultz, Thomas F. Wetherbee, Richard (1 Eylül 1999). "Diatom kayması, bir aktin-miyozin hareketlilik sisteminin sonucudur". Hücre Motilitesi ve Hücre İskeleti. 44 (1): 23–33. doi:10.1002/(SICI)1097-0169(199909)44:1<23::AID-CM2>3.0.CO2-D. ISSN1097-0169. PMID10470016.
  52. ^
  53. Mann, David G. (Şubat 2010). "raphid diatomları". Hayat Ağacı Web Projesi . 27 Eylül 2019'da alındı.
  54. ^ aB
  55. G. Drebes (1 Ocak 1977). "Bölüm 9: Cinsellik". Dietrich Werner'de (ed.). Diatomların Biyolojisi. Botanik Monograflar. 13. Kaliforniya Üniversitesi Yayınları. s. 250–283. ISBN978-0-520-03400-6 . Erişim tarihi: 14 Kasım 2013 .
  56. ^
  57. Azam, Farooq Bidle, Kay D. (1999). "Deniz bakteri toplulukları tarafından diatom silikanın hızlandırılmış çözünmesi". Doğa. 397 (6719): 508–12. Bibcode:1999Natur.397..508B. doi:10.1038/17351. S2CID4397099. INIST:1755031.
  58. ^
  59. Zakharova, Yulia R. Galachyants, Yuri P. Kurilkina, Maria I. Likhoshvay, Alexander V. Petrova, Darya P. Shishlyannikov, Sergey M. Ravin, Nikolai V. Mardanov, Andrey V. Beletsky, Alexey V. Likhoshway, Yelena V. (2013). "Baykal Gölü'nün Derin Yakın-Alt Katmanında Mikrobiyal Topluluğun Yapısı ve Diatomların Bozunması". PLOS BİR. 8 (4): e59977. Bibcode:2013PLoSO. 859977Z. doi:10.1371/journal.pone.0059977. PMC3613400 . PMID23560063.
  60. ^ aB
  61. Treguer, P. Nelson, D.M. Van Bennekom, A.J. Demaster, D.J. Leynaert, A. Queguiner, B. (1995). "Dünya Okyanusunda Silika Dengesi: Yeniden Tahmin". Bilim. 268 (5209): 375–9. Bibcode: 1995Sci. 268..375T. doi:10.1126/bilim.268.5209.375. PMID17746543. S2CID5672525.
  62. ^
  63. Kilias, Estelle S. Junges, Leandro Šupraha, Luka Leonard, Guy Metfies, Katja Richards, Thomas A. (2020). "Chytrid mantar dağılımı ve diatomlarla birlikte ortaya çıkması, Arktik Okyanusu'ndaki deniz buzu erimesi ile ilişkilidir". İletişim Biyolojisi. 3 (1): 183. doi:10.1038/s42003-020-0891-7. PMC7174370. PMID32317738. S2CID216033140.
  64. ^ aB
  65. Egge, J.K. Aksnes, D.L. (1992). "Fitoplankton rekabetinde düzenleyici besin olarak silikat". Mart Ekol. prog. sör. 83: 281–289. Bibcode:1992MEPS. 83..281E. doi: 10.3354/meps083281 .
  66. ^ aBC
  67. Furnas, Miles J. (1990). "Deniz fitoplanktonunun yerinde büyüme oranları: Ölçüm, topluluk ve tür büyüme oranlarına yaklaşımlar". Plankton Araştırmaları Dergisi. 12 (6): 1117–51. doi:10.1093/plankt/12.6.1117. INIST:5474600.
  68. ^ aB
  69. Yool, Andrew Tyrrell, Toby (2003). "Okyanusun silikon döngüsünün düzenlenmesinde diatomların rolü". Küresel Biyojeokimyasal Döngüler. 17 (4): yok. Bibcode:2003GBioC..17.1103Y. CiteSeerX10.1.1.394.3912 . doi:10.1029/2002GB002018.
  70. ^
  71. Lipps, Jere H. (1970). "Plankton Evrimi". Evrim. 24 (1): 1-22. doi:10.2307/2406711. JSTOR2406711. PMID28563010.
  72. ^Didymo, Aramızdaki Yabancılar.7 Ekim 2015'te Kanada Sanal Müzesi'ndeki Wayback Machine Sanal Sergisinde arşivlendi.
  73. ^
  74. "DEP Raporları Didymo West Branch Farmington Nehri'nde Keşfedildi. 2014-01-15 tarihinde alındı". 16 Şubat 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. 27 Nisan 2015 alındı.
  75. ^
  76. "Didymo Paydaş Güncellemesi – 31 Ekim 2008". MAF Biosecurity Yeni Zelanda www.biosecurity.govt.nz. 12 Şubat 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 1 Aralık 2013 .
  77. ^ aB
  78. Dugdale, R.C. Wilkerson, F.P. (1998). "Ekvatoral Pasifik yükselişinde yeni üretimin silikat düzenlemesi". Doğa. 391 (6664): 270-273. Bibcode:1998Natur.391..270D. doi:10.1038/34630. S2CID4394149.
  79. ^
  80. Smetacek, V.S. (1985). "Diatom yaşam-tarih döngülerinde batmanın rolü: Ekolojik, evrimsel ve jeolojik önemi". Mart Biol. 84 (3): 239-251. doi:10.1007/BF00392493. S2CID85054779.
  81. ^
  82. Raven, J.A. (1983). "Bitkilerde silikonun taşınması ve işlevi". Biol. Rev. 58 (2): 179–207. doi:10.1111/j.1469-185X.1983.tb00385.x. S2CID86067386.
  83. ^
  84. Milligan, A.J. Morel, F.M.M. (2002). "Diatomlarda silika için bir proton tamponlama rolü". Bilim. 297 (5588): 1848-1850. Bibcode:2002Sci. 297.1848M. doi:10.1126/bilim.1074958. PMID12228711. S2CID206507070.
  85. ^ aB Chamberlain, CJ (1901) Bitki Histolojisinde Yöntemler, Chicago Press Üniversitesi, ABD
  86. ^
  87. Armstrong, E. Rogerson, A Leftley, Jw (2000). "Üç yüzeyle ilişkili heterotrofik protistler, Stereomyxa ramosa, Nitzschia alba ve Labyrinthula sp tarafından deniz yosunu karbonunun kullanılması". Su Mikrobiyal Ekolojisi. 21: 49-57. doi: 10.3354/ame021049 . ISSN0948-3055.
  88. ^
  89. LEWIN, JOYCE LEWIN, R.A. (1967). "Nitzschia Cinsinin Bazı Apoklorotik Diatomlarının Kültürü ve Beslenmesi". Mikrobiyoloji. 46 (3): 361-367. doi: 10.1099/00221287-46-3-361 . ISSN1350-0872.
  90. ^
  91. "Diatomlar" . 13 Şubat 2016'da alındı.
  92. ^ aBC
  93. Thamatrakoln, K. Alverson, A.J. Hildebrand, M. (2006). "Diatom Silikon Taşıyıcıların Karşılaştırmalı Dizi Analizi: Silikon Taşımanın Mekanistik Bir Modeline Doğru". Psikoloji Dergisi. 42 (4): 822-834. doi:10.1111/j.1529-8817.2006.00233.x. S2CID86674657.
  94. ^
  95. Kröger, Nils Deutzmann, Rainer Manfred, Sumper (Kasım 1999). "Silis Nanosfer Oluşumunu Yönlendiren Diatom Biyosilikasından Polikatyonik Peptitler". Bilim. 286 (5442): 1129-1132. doi:10.1126/bilim.286.5442.1129. PMID10550045. S2CID10925689. [kalıcı ölü bağlantı]
  96. ^
  97. Kroger, Nils (2007). Biyomineralizasyon El Kitabı: Biyolojik Yönler ve Yapı Oluşumu. Weinheim, Almanya: Wiley-VCH Verlag GmbH. s. bölüm 3.
  98. ^
  99. Allen, Andrew E. Dupont, Christopher L. Oborník, Miroslav Horák, Aleš Nunes-Nesi, Adriano McCrow, John P. Zheng, Hong Johnson, Daniel A. Hu, Hanhua Fernie, Alisdair R. Bowler, Chris (2011). "Fotosentetik diatomlarda üre döngüsünün evrimi ve metabolik önemi". Doğa. 473 (7346): 203–7. Bibcode:2011Natur.473..203A. doi:10.1038/doğa10074. PMID21562560. S2CID4350884. Lay özeti – Günlük Bilim (12 Mayıs 2011).
  100. ^
  101. Guiry, M.D. (2012). "Kaç tür yosun var?". Psikoloji Dergisi. 48 (5): 1057-1063. doi:10.1111/j.1529-8817.2012.01222.x. PMID27011267. S2CID30911529.
  102. ^
  103. Frank Eric Yuvarlak R.M. Crawford D.G. Mann (1990). Diatomlar: Cinslerin Biyolojisi ve Morfolojisi. Cambridge Üniversitesi Yayınları. ISBN978-0-521-36318-1 . 13 Kasım 2013 alındı. [sayfa gerekli]
  104. ^ Canter-Lund, H. ve Lund, J.W.G. (1995). Tatlı Su Algleri: Mikroskobik dünyalarını açıkladılar, Biopress Limited. 0-948737-25-5. [sayfa gerekli]
  105. ^
  106. Mann, David G. (2005). "Diatomlarda tür kavramı: Dört epipelik türde morfolojik olarak farklı, sempatik gamodemler için kanıt". Bitki Sistematiği ve Evrimi. 164 (1/4): 215–37. doi:10.1007/BF00940439. JSTOR23675282. S2CID37684109.
  107. ^
  108. Fourtanier, Elisabeth Kociolek, J. Patrick (1999). "Diatom Cinslerinin Kataloğu". Diyatom Araştırması. 14 (1): 1-190. doi:10.1080/0269249X.1999.9705462.
  109. ^ Dünya Deniz Türleri Kaydı, Temmuz 2020 itibariyle tüm habitatlardan 1.248'i "kabul edilen" 1.356 diatom cinsi adını listeler.
  110. ^ Dünya Deniz Türleri Kaydı'na yapılan sorgular, Temmuz 2020, 285'i "kabul edilen" 299 "yalnızca fosil" cins adı döndürür.
  111. ^
  112. Theriot, Edward C. Cannone, Jamie J. Gutell, Robin R. Alverson, Andrew J. (2009). "Diatome filogenisini çözmek için nükleer olarak kodlanmış SSU rDNA'nın sınırları". Avrupa Psikoloji Dergisi. 4 (3): 277–290. doi:10.5091/plecevo.2010.418. PMC2835975. PMID20224747.
  113. ^
  114. Theriot, Edward C. Ashworth, Matt Ruck, Elizabeth Nakov, Teofil Jansen, Robert K. (2010). "Diatomların (Bacillariophyta) bir ön multigen filogenisi: gelecekteki araştırmalar için zorluklar". Bitki Ekolojisi ve Evrimi. 143 (3): 277–290. doi: 10.1080/09670260902749159 . PMC2835975. PMID20224747.
  115. ^
  116. Parks, Matthew B. Wickett, Norman J. Alverson, Andrew J. (2018). "Mikrobiyal ökaryotların (Diatoms, Bacillariophyta) çeşitli soyları için filogenomik verilerde sinyal, belirsizlik ve çatışma". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 35 (1): 80-93. doi: 10.1093/molbev/msx268 . PMC5850769 . PMID29040712.
  117. ^
  118. Medlin, L.K. Desdevises, Y. (2020). "Toplam kanıt yaklaşımı için çoklu dış gruplar ve morfolojik veriler kullanılarak yedi gen veri setinin analizi ile moleküler araçlar kullanılarak diatomların filogenetik yeniden yapılandırılmasının gözden geçirilmesi" (PDF) . Fizyoloji. Basında.
  119. ^
  120. Adl, Sina M. Bass, David Lane, Christopher E. Lukeš, Julius Schoch, Conrad L. Smirnov, Alexey Agatha, Sabine Berney, Cedric Brown, Matthew W. (26 Eylül 2018). "Ökaryotların Sınıflandırılması, Adlandırılması ve Çeşitlilik Revizyonları". Ökaryotik Mikrobiyoloji Dergisi. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC6492006 . PMID30257078.
  121. ^ aB
  122. Kooistra, Wiebe H.C.F. Medlin, Linda K. (1996). "Diatomların (Bacillariophyta) Evrimi". Moleküler Filogenetik ve Evrim. 6 (3): 391–407. doi:10.1006/mpev.1996.00088. PMID8975694.
  123. ^
  124. Schieber, Jürgen Krinsley, Dave Riciputi, Lee (2000). "Çamurtaşlarında kuvars siltinin diyagenetik kökeni ve silika döngüsüne etkileri". Doğa. 406 (6799): 981–5. Bibcode:2000Natur.406..981S. doi:10.1038/35023143. PMID10984049. S2CID4417951.
  125. ^
  126. Medlin, L.K. Kooistra, W.H.C.F. Gersonde, R. Sims, P.A. Wellbrock, U. (1997). "Son Permiyen kitlesel yok oluşu ile ilgili diatomların kökeni mi?". Nova Hedwigia. 65 (1–4): 1–11. doi:10.1127/nova.hedwigia/65/1997/1. hdl:10013/epik.12689.
  127. ^
  128. Raven, J.A. Waite, A.M. (2004). "Diatomlarda silisleşmenin evrimi: Kaçınılmaz batma ve kaçış olarak batma?". Yeni Fitolog. 162 (1): 45-61. doi:10.1111/j.1469-8137.2004.01022.x. JSTOR1514475.
  129. ^
  130. R. Siever Stephen Henry Schneider Penelope J. Boston (Ocak 1993). "Okyanuslarda silika: biyolojik-jeolojik etkileşim". Gaia'daki bilim adamları . MİT Basın. s. 287–295. ISBN978-0-262-69160-4 . Erişim tarihi: 14 Kasım 2013 .
  131. ^
  132. Kidder, David L. Erwin, Douglas H. (2001). "Biyojenik Silika'nın Fanerozoik Dönemde Seküler Dağılımı: Seri Düzeyinde Silika Yer Değiştirmiş Fosiller ve Tabakalı Çörtlerin Karşılaştırılması". Jeoloji Dergisi. 109 (4): 509–22. Bibcode: 2001JG. 109..509K. doi:10.1086/320794. S2CID128401816.
  133. ^
  134. Grenne, Tor Slack, John F. (2003). "Paleozoyik ve Mesozoyik silika bakımından zengin deniz suyu: Hematitik çört (jasper) yataklarından elde edilen kanıtlar". jeoloji. 31 (4): 319–22. Bibcode:2003Geo. 31.319G. doi:10.1130/0091-7613(2003)031<0319:PAMSRS>2.0.CO2. INIST:14692468.
  135. ^
  136. Racki, G Cordey, Fabrice (2000). "Radyolar paleoekolojisi ve radyolaritler: Şimdiki zaman geçmişin anahtarı mı?". Yer Bilimi İncelemeleri. 52 (1): 83–120. Bibcode:2000ESRv. 52. 83R. doi:10.1016/S0012-8252(00)00024-6.
  137. ^
  138. Maldonado, Manuel Carmona, M. Carmen Uriz, María J. Cruzado, Antonio (1999). "Silikon sınırlaması ile açıklanan Mesozoyik resif oluşturma süngerlerindeki düşüş". Doğa. 401 (6755): 785-8. Bibcode:1999Natur.401..785M. doi:10.1038/44560. S2CID205034177. INIST:1990263.
  139. ^
  140. Harper, Howard E. Knoll, Andrew H. (1975). "Silika, diatomlar ve Senozoik radyolarya evrimi". jeoloji. 3 (4): 175–7. Bibcode:1975Geo. 3.175H. doi:10.1130/0091-7613(1975)3<175:SDACRE>2.0.CO2.
  141. ^
  142. Falkowski, P.G. Katz, Miriam E. Knoll, Andrew H. Quigg, Antonietta Raven, John A. Schofield, Oscar Taylor, F.J.R. (2004). "Modern Ökaryotik Fitoplanktonun Evrimi". Bilim. 305 (5682): 354-60. Bibcode: 2004Sci. 305..354F. CiteSeerX10.1.1.598.7930 . doi:10.1126/bilim.1095964. PMID15256663. S2CID451773.
  143. ^
  144. Kidder, D.L. Gierlowski-Kordesch, E.H. (2005). "Otlak Radyasyonunun Deniz Dışı Silika Döngüsü ve Miyosen Diatomit Üzerindeki Etkisi". PALAIOS. 20 (2): 198–206. Bibcode:2005Palai..2..198K. doi:10.2110/palo.2003.p03-108. JSTOR27670327. S2CID140584104.
  145. ^ aB
  146. Lazarus, David Barron, John Renaudie, Johan Diver, Patrick Türke, Andreas (2014). "İklim Değişikliği Senozoik Planktonik Deniz Diatom Çeşitliliği ve Korelasyonu". PLOS BİR. 9 (1): e84857. Bibcode:2014PLoSO. 984857L. doi:10.1371/journal.pone.0084857. PMC3898954 . PMID24465441.
  147. ^ IPCC Temel Yazı Ekibi, 2007. İklim Değişikliği 2007: Sentez Raporu. 104.
  148. ^ aB
  149. Scherer, R.P. Gladenkov, A. Yu. Barron, J.A. (2007). "Senozoik deniz diatom biyostratigrafisinin yöntemleri ve uygulamaları". Paleontoloji Derneği Kağıtları. 13: 61-83. doi:10.1017/S1089332600001467.
  150. ^
  151. Harwood, D.M. Nikolaev, V.A. Winter, D.M. (2007). "Diatome evrim, radyasyon ve genişleme Kretase kaydı". Paleontoloji Derneği Kağıtları. 13: 33–59. doi:10.1017/S1089332600001455.
  152. ^
  153. Strelnikova, N.I. (1990). "Kretase ve Paleojen dönemlerinde diatomların Evrimi". Simola'da, H. (ed.). Onuncu Uluslararası Diatom Sempozyumu Bildiriler Kitabı. Koenigstein: Koeltz Bilimsel Kitapları. s. 195–204. ISBN3-87429-307-6 .
  154. ^
  155. Baldauf, J.G. (1993). "Erken Miyosen aracılığıyla Orta Eosen diatom çiçek devri". Prothero'da, D. Berggren, W.H. (ed.). Eosen-Oligosen iklimsel ve biyotik evrim. Princeton: Princeton Üniversitesi Yayınları. s. 310-326. ISBN0-691-02542-8 .
  156. ^
  157. Barron, J.A. (2003). "Geçtiğimiz 18 milyon yıl boyunca Pasifik ve Güney okyanuslarında planktonik diatomların ortaya çıkışı ve neslinin tükenmesi". Diyatom Araştırması. 18: 203–224. doi:10.1080/0269249x.2003.9705588. S2CID84781882.
  158. ^
  159. Scala, S. Carels, N Falciatore, A Chiusano, M.L. Bowler, C (2002). "Diatome Phaeodactylum tricornutum'un Genom Özellikleri". Bitki Fizyolojisi. 129 (3): 993-1002. doi:10.1104/pp.010713. PMC166495 . PMID12114555.
  160. ^
  161. Maheswari, U. Montsant, A Goll, J Krishnasamy, S Rajyashri, K.R. Patell, V.M. Bowler, C (2004). "Diatome EST Veritabanı". Nükleik Asitler Araştırması. 33 (Veritabanı sorunu): D344–7. doi:10.1093/nar/gki121. PMC540075 . PMID15608213.
  162. ^
  163. Montsant, A. Jabbari, K Maheswari, U Bowler, C (2005). "Pennate Diatom Phaeodactylum tricornutum'un Karşılaştırmalı Genomik". Bitki Fizyolojisi. 137 (2): 500–13. doi:10.1104/s.104.052829. PMC1065351 . PMID15665249.
  164. ^
  165. Maheswari, U. Mock, T. Armbrust, E. V. Bowler, C. (2009). "Diatom EST Veritabanının Güncellenmesi: Dijital transkriptomik için yeni bir araç". Nükleik Asitler Araştırması. 37 (Veritabanı sorunu): D1001–5. doi:10.1093/nar/gkn905. PMC2686495 . PMID19029140.
  166. ^ aB
  167. Armbrust, EV Berges, John A. Bowler, Chris Green, Beverley R. Martinez, Diego Putnam, Nicholas H. Zhou, Shiguo Allen, Andrew E. Apt, Kirk E. Bechner, Michael Brzezinski, Mark A. Chaal, Balbir K. Chiovitti, Anthony Davis, Aubrey K. Demarest, Mark S. Detter, J. Chris Gavina, Tijana Goodstein, David Hadi, Masood Z. Hellsten, Uffe Hildebrand, Mark Jenkins, Bethany D. Jurka, Jerzy Kapitonov, Vladimir V. Kröger, Nils Lau, Winnie WY Lane, Todd W. Larimer, Frank W. Lippmeier, J. Casey ve diğerleri. (2004). "Diatome Thalassiosira Pseudonana Genomu: Ekoloji, Evrim ve Metabolizma". Bilim. 306 (5693): 79-86. Bibcode: 2004Sci. 306. 79A. CiteSeerX10.1.1.690.4884 . doi:10.1126/bilim.11101156. PMID15459382. S2CID8593895.
  168. ^ aBCNS
  169. Bowler, Chris Allen, Andrew E. Badger, Jonathan H. Grimwood, Jane Jabbari, Kamel Kuo, Alan Maheswari, Uma Martens, Cindy Maumus, Florian Otillar, Robert P. Rayko, Edda Salamov, Asaf Vandepoele, Klaas Beszteri, Bank Gruber, Ansgar Heijde, Marc Katinka, Michael Mock, Thomas Valentin, Klaus Verret, Fréderic Berges, John A. Brownlee, Colin Cadoret, Jean-Paul Chiovitti, Anthony Choi, Chang Jae Coesel, Sacha De Martino, Alessandra Detter, J. Chris Durkin, Colleen ve ark. (2008). "Phaiodactylum genomu, diatom genomlarının evrimsel tarihini ortaya koymaktadır". Doğa. 456 (7219): 239-44. Bibcode:2008Natur.456..239B. doi: 10.1038/nature07410 . PMID18923393. S2CID4415177.
  170. ^
  171. Roy, S.W. Penny, D. (2007). "Intron Zengin Diatom Thalassiosira pseudonana'da Benzersiz Intron Pozisyonlarının Çok Yüksek Bir Kısmı Yaygın Intron Kazanımını Gösterir". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 24 (7): 1447–57. doi: 10.1093/molbev/msm048 . PMID17350938.
  172. ^
  173. Maumus, Florian Allen, Andrew E Mhiri, Corinne Hu, Hanhua Jabbari, Kamel Vardi, Assaf Grandbastien, Marie-Angèle Bowler, Chris (2009). "Bir deniz diatomunda genom evrimi üzerinde stresle aktive olan retrotranspozonların potansiyel etkisi". BMC Genomik. 10: 624. doi:10.1186/1471-2164-10-624. PMC2806351 . PMID20028555.
  174. ^
  175. Moustafa, A. Beszteri, B. Maier, U. G. Bowler, C. Valentin, K. Bhattacharya, D. (2009). "Diatomlarda Kriptik Plastid Endosimbiyozunun Genomik Ayak İzleri" (PDF) . Bilim. 324 (5935): 1724–6. Bibcode: 2009Sci. 324.1724M. doi:10.1126/bilim.1172983. PMID19556510. S2CID11408339. 21 Nisan 2014 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. 13 Ocak 2019 alındı.
  176. ^ aB
  177. Kroth, Peter G. Bones, Atle M. ve ark. (Ekim 2018). "Diatomlarda genom düzenleme: başarılar ve hedefler". Bitki Hücre Raporları. 37 (10): 1401–1408. doi:10.1007/s00299-018-2334-1. PMID30167805. S2CID52133809.
  178. ^ aB
  179. Falciatore, Angela Casotti, Raffaella ve ark. (Mayıs 2015). "Deniz Diatomse Re'de Seçilemeyen Genlerin Dönüşümü". Deniz Biyoteknolojisi. 1 (3): 239-251. doi:10.1007/PL00011773. PMID10383998. S2CID22267097.
  180. ^ aBCNSe
  181. Karas, Bogumil J. Diner, Rachel E. et al. (21 Nisan 2015). "Bakteriyel konjugasyon ile verilen tasarımcı diatom epizomları". Doğa İletişimi. 6 (1): 6925. Bibcode:2015NatCo. 6.6925K. doi: 10.1038/ncomms7925 . ISSN2041-1723. PMC4411287 . PMID25897682.
  182. ^ aBCNS
  183. Slattery, Samuel S. Diamond, Andrew ve ark. (16 Şubat 2018). "Genişletilmiş Plazmit Tabanlı Genetik Araç Kutusu, Phaeodactylum tricornutum'da Cas9 Genom Düzenlemesini ve Sentetik Yolların Kararlı Bakımını Sağlar". ACS Sentetik Biyoloji. 7 (2): 328–338. doi:10.1021/acssynbio.7b00191. PMID29298053.
  184. ^
  185. Nymark, Marianne Sharma, Amit Kumar ve ark. (Temmuz 2016). "Deniz yosunlarında gen düzenlemesi için uyarlanmış bir CRISPR/Cas9 sistemi". Bilimsel Raporlar. 6 (1): 24951. Bibcode:2016NatSR. 624951N. doi: 10.1038/srep24951 . PMC4842962 . PMID27108533.
  186. ^
  187. Mishra, M Arukha, AP Bashir, T Yadav, D Gbks, Prasad (2017). "Diatomların Tüm Yeni Yüzleri: Nanomalzemelerin Potansiyel Kaynağı ve Ötesi". Ön Mikrobiyol. 8: 1239. doi: 10.3389/fmicb.2017.01239 . PMC5496942 . PMID28725218.
  188. ^
  189. Reka, Arianit A. Pavlovski, Blagoj Makreski, Petre (Ekim 2017). "Diatomlu toprak kullanılarak gözenekli seramiklerin düşük sıcaklıkta hidrotermal üretimi için yeni optimize edilmiş yöntem". Seramik Uluslararası. 43 (15): 12572–12578. doi:10.1016/j.ceramint.2017.06.132.
  190. ^
  191. Reka, Arianit Anovski, Todor Bogoevski, Slobodan Pavlovski, Blagoj Boškovski, Boško (29 Aralık 2014). "Makedonya Cumhuriyeti, Rožden köyü yakınlarındaki yataktan diyatomitin fiziksel-kimyasal ve mineralojik-petrografik incelemeleri". Jeolojik Makedonya. 28 (2): 121–126. ISSN1857-8586. 18 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Nisan 2020 .
  192. ^
  193. Reka, Arianit A. Pavlovski, Blagoj Ademi, Egzon Jashari, Ahmed Boev, Blazo Boev, Ivan Makreski, Petre (31 Aralık 2019). "800-1200˚C Sıcaklık Aralığında Trepel Isıl İşleminin Etkisi". Açık Kimya. 17 (1): 1235–1243. doi: 10.1515/chem-2019-0132 .
  194. ^
  195. Auer, Antti (1991). "Boğulma Teşhisi İçin Bir Araç Olarak Niteliksel Diatom Analizi". Amerikan Adli Tıp ve Patoloji Dergisi. 12 (3): 213–8. doi:10.1097/00000433-199109000-00009. PMID1750392. S2CID38370984.
  196. ^
  197. Bradbury, J. (2004). "Doğanın Nanoteknologları: Diatomların Sırlarını Ortaya Çıkarmak". PLOS Biyoloji. 2 (10): 1512–1515. doi:10.1371/journal.pbio.0010306. PMC521728 . PMID15486572.
  198. ^
  199. Davul, Ryan W. Gordon, Richard (2003). "Star Trek çoğaltıcıları ve diatom nanoteknolojisi". Biyoteknolojideki Eğilimler. 21 (8): 325–8. doi:10.1016/S0167-7799(03)00169-0. PMID12902165.
  200. ^
  201. Johnson, R.C. (9 Nisan 2009). "Diatomlar güneş pili verimliliğini üç katına çıkarabilir". EE Zamanları. 31 Temmuz 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. 13 Nisan 2009'da erişildi.
  202. ^
  203. Ramachandra, T. V. Mahapatra, Durga Madhab b, Karthick Gordon, Richard (2009). "Sürdürülebilir Enerji için Sağım Diatomları: Benzin Salgılayan Diatom Güneş Panellerine Karşı Biyokimya Mühendisliği". Endüstri ve Mühendislik Kimya Araştırması. 48 (19): 8769-88. doi:10.1021/ie900044j.
    , Ecole Normale Supérieure , diatom türlerinin görüntülerini içeren taksonomik veritabanı , California Üniversitesi Paleontoloji Müzesi , Eureka sitesi, Bergen Üniversitesi , Öğrenme ve Eğitim için Mikrofosil Görüntü Kurtarma ve Dolaşım (MIRACLE), University College London 8 Ekim 2009'da Wayback Machine'de arşivlendi , Royal Botanic Garden Edinburgh , Monterey Bay Akvaryumu Araştırma Enstitüsü Philadelphia Doğa Bilimleri Akademisi (ANSP) Philadelphia Doğa Bilimleri Akademisi (ANSP)

60 ms %4,0 özyinelemeliKlon 60 ms %4,0 [diğer] 340 ms %22.7 Yüklenen Wikibase varlıklarının sayısı: 14/400 -->


Bu öğeyi görüntüleyen müşteriler de görüntüledi

Gözden geçirmek

". iriliği etkileyici, üretimi muhteşem, içeriğiyle ansiklopedik ve illüstrasyonlarıyla zarif." Doğa

". çevre açısından önemli bir grup ototrofik protistlerin taksonomisi hakkındaki bilgimizdeki muazzam bir boşluğu dolduruyor. Kitap, ışık mikroskobu, transmisyon elektron mikroskobu ve taramalı elektron mikroskobu aracılığıyla yapılan mükemmel resimli fotomikrografiklerle ve ayrıca incelikle oluşturulmuş resimlerle dolu." Amerikalı Bilim Adamı

". önemli bir su organizması grubu hakkında mükemmel bir referans." Kuzey Amerika Bentoloji Derneği Dergisi

"Üç İngiliz uzmanın diyatomların biyolojisi ve morfolojisi üzerine etkileyici bir ansiklopedik incelemesi. 60 yıldan fazla bir süredir diatom türlerini ilk kez özetleyen bu olağanüstü cilt, profesyoneller ve lisansüstü öğrenciler için ağırlığınca altın değerinde olacak." Tercih

"Kitap muhteşem ve gerekli." L. M. Van Valen, Evrimsel Teori ve İnceleme

". konuyla ilgili uzun zamandır baskıdan çıkacak en önemli kitap. Her ciddi diyatom işçisinin olmazsa olmazı." Robert B. McLaughlin, Mikroskop

Kitap açıklaması

Kitap açıklaması


Gerçekler

Bizim için yazmak ister misiniz? Eh, kelimeyi yaymak isteyen iyi yazarlar arıyoruz. Bizimle iletişime geçin, konuşalım.

Diatomlar, hücre duvarları silikon dioksitten (silika) oluşan mikroskobik, tek hücreli veya kolonyal bitki benzeri organizmalardır. Kabuklarında (veya testlerinde) mikroskop altında görülebilen çok sayıda delik veya areola vardır.

Nemli yüzeylerde, okyanuslarda, nehirlerde, göllerde, akarsularda, haliçlerde, su birikintilerinde, ıslak kayalarda ve çeşitli topraklarda bulunurlar. Çoğu diatom mikroskobiktir, ancak bazı türler 2 milimetre uzunluğundadır. Genellikle hareket etmezler, ancak çok az tür kamçıyı hareket için kullanır.

Sınıflandırmalarına göre, diatomlar Bacillariophyceae sınıfına aittir ve bu organizmanın 200'den fazla cinsi vardır. Protistler veya kromistler olarak sınıflandırılırlar. Bazı tahminlere göre, bu organizmanın mevcut yaklaşık 100.000 türü vardır. İki tip diatom mevcuttur: yuvarlak merkezler ve uzun veya kalem şeklindeki pennales.

Ölümlerinden sonra sualtı tortullarında korunan bir silika kabuğu yetiştiriyorlar. Bu test, her tür için farklı olan frustule olarak bilinir, bu nedenle onları mikroskopla gözlemleyerek tanımlayabilirsiniz. Bu früstüller, aralarında bir bölünme bulunan iki asimetrik taraf sergiler, bu nedenle diatom adı verilir. Çoğunlukla sarımsı veya kahverengidirler ve plastidlerde meydana gelen klorofil A, klorofil C ve karotenoid fukoksantin içerirler. Fotosentez yoluyla besin üretirler ve büyük oksijen tedarikçileridir.

Diatomlar hücre bölünmesiyle çoğaldıkça eşeysiz üremeye uğrarlar. Her replikasyon turunda küçülürler. Çok küçük türler, nispeten büyük bir zigotun büyümesine izin veren cinsel bir üreme modunu izleyebilir.

Öldükçe, diatom testleri sızıntıda birikir ve kizelgur olarak da bilinen diyatomlu toprak olarak bilinen malzemeyi oluşturur. Hem ısıyı hem de sesi emmek için yalıtım malzemesi olarak kullanılan diatomit adı verilen yumuşak, kireçli ve hafif bir kaya şeklinde bulunur. Dinamit, diğer patlayıcılar, filtreler, aşındırıcılar vb. üretmek için kullanılır. Bazen bahçecilikte haşere kontrolü olarak kullanılır.

Diyatomlar, kalker tabakaları üzerlerinde biriktirdikleri için Dünya'nın yapısının oluşumunda önemli bir rol oynarlar ve petrolün oluşumu kısmen bu organizmalar sayesinde mümkün olmuştur. Toplulukları, geçmiş ve mevcut çevresel koşulları izlemek için bir araç sağlar. Su kalitesi çalışmalarında faydalıdırlar. Bu organizmanın farklı türleri farklı sıcaklıkları tercih eder. Bu nedenle, bilim adamları yaşadıkları suyun sıcaklığını tahmin edebilirler. Diatomlar çoğunlukla çok sayıda bulunur ve boyutları yanal su hareketini ve suyun ne kadar iyi karıştığını göstermeye yardımcı olur.

İlgili Mesajlar

Spirogyra, tatlı su habitatlarında bulunan filamentli bir alg türüdür. En ilginç spirogyra gerçeklerinden ikisi, spiral şekilli kloroplastların varlığı ve konjugasyon yöntemiyle üremedir.

Mikroorganizma kolonilerini mikroskop altında izlemek nefes kesici bir deneyimdir. Çok sayıda mikroskobik organizma vardır ve volvox bunlardan biridir. Aşağıdaki makale bazı ilginç volvox gerçeklerini sunmaktadır. Oku&yardım

Amipler yaygın olarak gözlenen mikroplardan biridir. Bu yazıda sunulan amip gerçekleri, bu organizmaların farklı özellikleri hakkında ayrıntıları içerir.


Tanıtım

Sucul ortamlar sıklıkla farklı antropik faaliyetlerden etkilenmiş olup, Güney Amerika'nın en büyük sürekli taşkın yatağı olan Pantanal of Mato Grosso gibi gelişmiş [1-6] ve vahşi bölgelerdeki [7-9] nehir havzaları üzerinde olumsuz etkilere neden olmuştur. Brezilya'da. Altı Brezilya kıtasal biyomu ile karşılaştırıldığında, Pantanal Biyomu ülke topraklarının sadece %1,76'sını oluşturmaktadır. Bununla birlikte, habitatların karmaşıklığı ve bitki ve hayvan türlerinin yüksek çeşitliliği nedeniyle olağanüstü bir öneme sahiptir ve bu nedenle Unesco tarafından Dünya Doğal Mirası ve Biyosfer Rezervleri olarak kabul edilmektedir [10].

Ayrıca, sistemin tüm biyotasını etkileyen bir nehir-ova etkileşimi olan yıllık sel nabzı ile iyi bilinir [11]. Örneğin, yerel olarak adlandırılan doğal ötrofikasyon olgusu Decoadasel fazının başlangıcında meydana gelen, su kalitesinde ayrışma ve kemosentez süreçleri için büyük önem taşıyan bir dizi değişikliğe neden olur [12].

Bir başka önemli etki de, sudaki organizma topluluklarının yapısına ve dinamiklerine zarar veren, yıllık seller [13,14] tarafından sulak alanlarda şiddetlenen antropojenik ötrofikasyondur [12]. Ötrofikasyon işlemi sırasında besin konsantrasyonundaki artış, mikroorganizma biyokütle popülasyonlarını büyük ölçüde değiştirir [15]. Diatomlar gibi stresörlerle yoğun ilişkileri olan biyoindikatörlerin varlığından çevresel koşullara ilişkin sağlam bir sonuç çıkarılabilir [16]. Bununla birlikte, çevresel çıkarımlar yapılırken bireysel baskın taksonların yorumlanmasının ele alınması gerekir [17-19].

Diatomlar, çevresel değişikliklere en duyarlı gruplardan biri olarak kabul edilen bir silisleşmiş mikroalg grubudur [20]. Son yıllarda, herhangi bir tek alt tabakaya bağlı diatom topluluklarının incelenmesi, ekolojik bilginin zaman ve mekanla korelasyonuna izin vererek ekosistem tabakalaşması hakkında ilgili bilgiler sağladığı için artan bir ilgi görmüştür [21-26]. 29] ve ayrıca ılıman bölgelerdeki nehirlerin, akarsuların ve göllerin ekolojik durumunun değerlendirilmesi [30-32]. Bununla birlikte, bilgiyi diatom topluluğu ile ilgili çalışmaların az olduğu dünyanın sulak bölgelerine genişletmek için hala acil bir ihtiyaç vardır [33,34]. Şimdiye kadar, Güney Amerika'da, yani Brezilya'da, çalışmalar nehirlerdeki ve akarsulardaki planktonik ve epilitik diatomlara odaklandı, esas olarak su kalitesinin [35-37] ve taşkın yatağındaki perifitik diatomların [38] değerlendirilmesi ile ilgili. Son çalışmalar, diatom toplulukları ve su kütlesinin trofik durum geçmişini [39,40] ve diatomun biyotik homojenizasyonunun bir kaydını çıkarmak için bir araç olarak kullanılan arazi kullanım kayıtları ile ötrofikasyonun çevresel yeniden yapılanmadaki rolüne odaklanmıştır. tortul örneklerde çeşitlilik [41]. Ayrıca, tropikal türlerin oto-ekolojisinde, çevresel ve mekansal faktörlerin diatom biyoçeşitliliği üzerindeki etkisi ve dağılımında da bazı ilerlemeler kaydedilmiştir [42,43].

Bu gelişmelere rağmen, yüzey sedimanlarındaki diatomlarla ilgili çalışmalar yetersizdir. Taksonomik çalışmalar, biyoçeşitlilik bilgisine katkıda bulunur ve diğerlerinin yanı sıra biyoindikasyon, çevresel yeniden yapılanma, koruma araştırmaları ve Pantanal gibi öncelikli alanların tanımlanması gibi diğer yaklaşımların ilerlemesi için temel sağlar. Bölgedeki daha ilgili çalışmalar, iki tür diatomun dağılımı ve bunların Paraná Nehri'ndeki [44] su seviyelerindeki tarihsel değişimle ilişkisi üzerinedir. güney Pantanal'daki tuzluluk [46] ve sel nabzı dinamiklerinin kayıtları [47]. Diyatomlarla ilgili olmayan diğer çalışmalar, sulak alan karbon depolamasına [48] ve hidroklimatik değişkenlerin limnojeolojik süreçler üzerindeki etkisine [49] atıfta bulunur. Bununla birlikte, bu bölgenin diatom biyoçeşitliliği henüz yeterince çalışılmamıştır. Bunun nedeni, sulak alandan uygun ulaşımın sağlanamaması ve bu alanlarda dalış konusunda uzmanlaşmış kişilerin su basmış alanlardan numune alma zorluğu olabilir. Bu nedenle, tropik sulak alanların tortullarındaki diyatomların biyolojik çeşitliliğini daha iyi anlamak için, bu çalışma, Mato Grosso'nun Brezilya Pantanal'ının (sulak alan) üç farklı gölündeki yüzey tortularındaki bu organizmaların dağılımı üzerindeki çevresel faktörlerin etkisini değerlendirmeyi amaçladı. Durum. Yaklaşımımız, diatom türlerinin bir değerlendirmesini varlık/yokluk ve nispi bolluk verileriyle birleştirir.

Bu çalışma, su basmış tropik bölgelerin anlaşılmasına katkı sağlamakta ve halen yeterince araştırılmamış olan tropikal sulak alanlarda limnolojik bir biyoindikatör olarak türlerin yapısını ve bileşimini kullanarak Pantanal'daki diatom biyoçeşitliliği bilgisini artırmayı amaçlamaktadır. Ayrıca, Pantanal'ın çevresel tahribatı (yangın/orman 2020) ve bunun limnolojik süreçler üzerindeki etkisine ilişkin mevcut bağlamdaki bu çalışmanın sonuçları, şu anda ve gelecekte, yeni karşılaştırmalı çalışmaları gündeme getirmek için son derece önemlidir. alan için, sosyoekonomik nedenlerle, çevre yönetimiyle ve ayrıca biyoçeşitlilik sorunlarıyla ilgili olabilecek kararlara yardımcı olmak.


Diatom Keşifleri ve Tarihçesi

İngiltere'den bilinmeyen bir 18. yüzyıl bilimsel gözlemcisi, diatomları keşfeden ilk kişi olarak kabul edilir. Bu gözlem Londra Kraliyet Cemiyeti tarafından yayınlandı. Gözlemci, basit bir mikroskop altında bir su birikintisi otunun köklerine bakıyor ve “onlara yapışan (ve bazen suda ayrı) dikdörtgen dikdörtgenler ve tam karelerden oluşan birçok güzel dalın” olduğunu belirtiyordu. Bu dikdörtgenler ve kareler diatomlardı.

19. yüzyılda, diatomlara ilgi, onları tanımlamak için kendi aralarında yarışan ilk mikrop avcıları arasında arttı. 19. yüzyılın sonlarında, diatomlar, hücre bölünmesinin tanımlandığı ve diyagramının çizildiği ilk hücrelerden bazılarıydı. Mikroskopi tarihinin bu verimli döneminde, 19. yüzyılın başlarında birçok gözlemci, mikroskop altında gözlemledikleri diatomların ayrıntılı çizimlerini ve şemalarını ürettiler. Daha sonra 19. yüzyılın sonlarında ve 20. yüzyılın başlarında diatomların fosil kayıtları ayrıntılı olarak incelenmeye başlandı.

Hustedt, 20. yüzyılın başlarında, bugün hala başvurulan ayrıntılı taksonomik referanslar üretti. Ayrıca, Round'un 1990'lardaki diatom referansı, en eksiksiz taksonomik diatom kaydı olarak kabul edilir. Daha yakın zamanlarda, diatom biyolojisinde yeni keşifler yapılmaya devam ediyor. Genomik analizler, diatomların bitki, hayvan ve bakteri soylarından evrimleşmiş bir gen mozaiği içerdiğini göstermiştir. Birçok diatom geni, oldukça yaygın okyanus bakterileri olan eski ortakyaşar siyanobakterilerden elde edilmiştir.

Diatomların raphe mukus salgılayarak nasıl kaydıkları henüz tam olarak anlaşılamamışken, 1990'lı yıllarda bu süreçte bir aktin motilite sisteminin rol oynadığı belirlendi. Ek olarak, son zamanlarda okyanus diatomlarının yaşamak için kıyı diatomlarından daha az demir gerektirdiği, büyük olasılıkla fotosentez yapmak için gerekli hücresel makinelerdeki farklılıklar nedeniyle gösterilmiştir.

Son zamanlarda, diatom fitoplankton benzerinin kendi mikrobiyom konsorsiyumlarına sahip olduğu ve bunların örneklerinin laboratuvarda kararlı bir şekilde birleştirilebileceği gösterildi. Dünya okyanuslarında büyüklük sıralarında diatomları aşan bakteriler ile diatomlar arasında bilinen bir etkileşim vardır. Bu, besinleri ve metabolitleri ekolojik bir niş içinde paylaşmayı içerir. Bazı güncel araştırmacılar, biyomühendislik perspektifinden diatom biyolojisi ile ilgileniyorlar ve diatom biyolojisinin benzersiz yönlerinin insan imalatında veya tıpta faydalı olabileceğini umuyorlar.

Diatomlar içinde depolanan yağ damlacıklarının, insan kullanımı için yağ üretmek üzere tasarlanabileceği öne sürülmüştür. Ek olarak, diatom hücre duvarlarını içeren benzersiz biyosilikanın, tıbbi ve farmasötik uygulamalarda bir ilaç dağıtım aracı olarak kullanılmak üzere tasarlanabileceği öne sürülmüştür.


ABD İç Platosu Ekolojik Bölgesi için diatom tabanlı bir Biyotik Bütünlük İndeksinin geliştirilmesi ve değerlendirilmesi

ABD, İç Plato Ekolojik Bölgesi (IPE) için, insan rahatsızlığının akarsu diatom topluluklarının biyotik durumu üzerindeki etkilerini değerlendiren bir Biyotik Bütünlük Endeksi (IBI) geliştirdik. Mann-Whitney kullanarak site grupları arasındaki önemli farklılıklara dayanarak, referans ve bozuk sitelerdeki (eğitim siteleri) 59 diatom özelliğinden 7 metrik seçtik. sen test, yüksek ayırma gücü ve düşük varyasyon katsayısı. IBI'leri, ayrı 1, 3, 5 ölçeğine veya sürekli 0-10 ölçeğine dönüştürdükten sonra bir site için metrikleri toplayarak hesapladık. Hem ayrık hem de sürekli ölçekleme sistemleri, referans ve bozuk alanları başarıyla ayırdı ve IBI puanları, IPE havzalarındaki tarımsal arazi kullanımıyla önemli ölçüde ilişkiliydi. Daha sonra diatom IBI'yi, biraz farklı örnekleme yöntemleri ve taksonomik referanslarla işlenen IPE akışlarından (test siteleri) 2. bir veri seti kullanarak test ettik ve eğitim sitesi veri seti için kullanılan aynı kriterlere dayalı olarak siteleri referans veya bozuk olarak sınıflandırdık. . Diatom IBI puanları, referans ve bozulmuş akışlar arasında önemli ölçüde farklılık gösterdi ve test sahası veri setindeki sahaların %80'ini doğru bir şekilde sınıflandırdı. Diğer diatom IBI'leri ile karşılaştırıldığında, ölçümümüz sahalar arasında daha yüksek ayırma gücü gösterdi ve çalışma havzalarında akarsu bozulmasının doğru bir karakterizasyonunu sağladı. Geliştirilen diatom IBI, akarsu ve havza yönetimi için faydalı bir araç olabilir.


Videoyu izle: ชววทยา เคมทเปนพนฐานของสงมชวต สารอนนทรย (Haziran 2022).